RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.08■■■□□ 2.09
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.05■■■□□ 2.08
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.99■■■□□ 2.07
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.81■■■□□ 2.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IQGAP2Q13576 1575 aa27.75■■■□□ 2.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.7■■■□□ 2.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PTPRGP23470 1445 aa27.67■■■□□ 2.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.67■■■□□ 2.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.65■■■□□ 2.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.65■■■□□ 2.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DISP1Q96F81 1524 aa27.64■■■□□ 2.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRXQ9BXM0 1461 aa27.64■■■□□ 2.01
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.61■■■□□ 2.01
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.6■■■□□ 2.01
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAPKBP1O60336 1514 aa27.57■■■□□ 2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.55■■■□□ 2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.53■■■□□ 2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.52■■■□□ 2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.52■■■□□ 2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIAA0556O60303 1618 aa27.51■■□□□ 1.99
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 UACAQ9BZF9 1416 aa27.48■■□□□ 1.99
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCC2Q92887 1545 aa27.46■■□□□ 1.99
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DIP2BQ9P265 1576 aa27.46■■□□□ 1.99
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.45■■□□□ 1.99
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EEA1Q15075 1411 aa27.4■■□□□ 1.98
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GOLGA3Q08378 1498 aa27.38■■□□□ 1.97
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.37■■□□□ 1.97
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ASXL2Q76L83 1435 aa27.35■■□□□ 1.97
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.34■■□□□ 1.97
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.32■■□□□ 1.96
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 P3H3Q8IVL6 736 aa27.29■■□□□ 1.96
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TSPOAP1O95153 1857 aa27.29■■□□□ 1.96
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCA8O94911 1581 aa27.26■■□□□ 1.95
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GLI2P10070 1586 aa27.22■■□□□ 1.95
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SAMD9Q5K651 1589 aa27.19■■□□□ 1.94
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIF21BO75037 1637 aa27.17■■□□□ 1.94
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.12■■□□□ 1.93
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KDM6BO15054 1643 aa27.12■■□□□ 1.93
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARID3CA6NKF2 412 aa27.1■■□□□ 1.93
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.1■■□□□ 1.93
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.08■■□□□ 1.93
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KCNH8Q96L42 1107 aa27.06■■□□□ 1.92
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATP10BO94823 1461 aa27.06■■□□□ 1.92
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.05■■□□□ 1.92
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.01■■□□□ 1.92
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.95■■□□□ 1.91
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.94■■□□□ 1.9
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CD109Q6YHK3 1445 aa26.94■■□□□ 1.9
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.92■■□□□ 1.9
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.89■■□□□ 1.89
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.83■■□□□ 1.89
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.8■■□□□ 1.88
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.78■■□□□ 1.88
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.76■■□□□ 1.87
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FMN1Q68DA7 1419 aa26.72■■□□□ 1.87
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.68■■□□□ 1.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HECW1Q76N89 1606 aa26.63■■□□□ 1.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.62■■□□□ 1.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NEO1Q92859 1461 aa26.62■■□□□ 1.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RAPGEF3O95398 923 aa26.59■■□□□ 1.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.58■■□□□ 1.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADGRL1O94910 1474 aa26.58■■□□□ 1.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.57■■□□□ 1.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLIP1P30622 1438 aa26.51■■□□□ 1.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AKNAQ7Z591 1439 aa26.51■■□□□ 1.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FANCAO15360 1455 aa26.5■■□□□ 1.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.5■■□□□ 1.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.5■■□□□ 1.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLCH2O75038 1416 aa26.47■■□□□ 1.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIF14Q15058 1648 aa26.47■■□□□ 1.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.44■■□□□ 1.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RICTORQ6R327 1708 aa26.42■■□□□ 1.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.39■■□□□ 1.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.39■■□□□ 1.81
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.38■■□□□ 1.81
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.36■■□□□ 1.81
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.35■■□□□ 1.81
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.3■■□□□ 1.8
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CEP162Q5TB80 1403 aa26.3■■□□□ 1.8
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms