RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431155.1

GRAMD4-204, Transcript of GRAM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene GRAMD4, Length 311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4-204ENST00000431155 JPH4Q96JJ6 628 aa51.79■■■■■ 5.88
GRAMD4-204ENST00000431155 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP51.74■■■■■ 5.87
GRAMD4-204ENST00000431155 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa51.69■■■■■ 5.87
GRAMD4-204ENST00000431155 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa51.54■■■■■ 5.84
GRAMD4-204ENST00000431155 TRHP20396 242 aaPredicted RBP51.42■■■■■ 5.82
GRAMD4-204ENST00000431155 IQGAP2Q13576 1575 aa51.36■■■■■ 5.81
GRAMD4-204ENST00000431155 PRXQ9BXM0 1461 aa51.25■■■■■ 5.79
GRAMD4-204ENST00000431155 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa51.15■■■■■ 5.78
GRAMD4-204ENST00000431155 CSRNP3Q8WYN3 585 aa51.13■■■■■ 5.78
GRAMD4-204ENST00000431155 CHIC1Q5VXU3 224 aa51.1■■■■■ 5.77
GRAMD4-204ENST00000431155 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP51.07■■■■■ 5.77
GRAMD4-204ENST00000431155 PTPRGP23470 1445 aa51.05■■■■■ 5.76
GRAMD4-204ENST00000431155 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa51.05■■■■■ 5.76
GRAMD4-204ENST00000431155 DISP1Q96F81 1524 aa51.05■■■■■ 5.76
GRAMD4-204ENST00000431155 UGGT2Q9NYU1 1516 aa51.05■■■■■ 5.76
GRAMD4-204ENST00000431155 EEA1Q15075 1411 aa51.04■■■■■ 5.76
GRAMD4-204ENST00000431155 TNIKQ9UKE5 1360 aa51.03■■■■■ 5.76
GRAMD4-204ENST00000431155 ADCY10Q96PN6 1610 aa51■■■■■ 5.75
GRAMD4-204ENST00000431155 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP50.98■■■■■ 5.75
GRAMD4-204ENST00000431155 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP50.9■■■■■ 5.74
GRAMD4-204ENST00000431155 KIAA0556O60303 1618 aa50.87■■■■■ 5.73
GRAMD4-204ENST00000431155 MAPKBP1O60336 1514 aa50.72■■■■■ 5.71
GRAMD4-204ENST00000431155 GOLGA3Q08378 1498 aa50.71■■■■■ 5.71
GRAMD4-204ENST00000431155 UACAQ9BZF9 1416 aa50.69■■■■■ 5.7
GRAMD4-204ENST00000431155 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa50.64■■■■■ 5.7
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCC2Q92887 1545 aa50.63■■■■■ 5.7
GRAMD4-204ENST00000431155 KIF13AQ9H1H9 1805 aa50.6■■■■■ 5.69
GRAMD4-204ENST00000431155 KIF21BO75037 1637 aa50.58■■■■■ 5.69
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCC10Q5T3U5 1492 aa50.56■■■■■ 5.68
GRAMD4-204ENST00000431155 FAM69CQ0P6D2 419 aa50.52■■■■■ 5.68
GRAMD4-204ENST00000431155 P3H3Q8IVL6 736 aa50.48■■■■■ 5.67
GRAMD4-204ENST00000431155 DIP2BQ9P265 1576 aa50.47■■■■■ 5.67
GRAMD4-204ENST00000431155 PLB1Q6P1J6 1458 aa50.46■■■■■ 5.67
GRAMD4-204ENST00000431155 KDM5BQ9UGL1 1544 aa50.41■■■■■ 5.66
GRAMD4-204ENST00000431155 EHMT2Q96KQ7 1210 aa50.41■■■■■ 5.66
GRAMD4-204ENST00000431155 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP50.4■■■■■ 5.66
GRAMD4-204ENST00000431155 SAMD9Q5K651 1589 aa50.38■■■■■ 5.66
GRAMD4-204ENST00000431155 ASXL2Q76L83 1435 aa50.38■■■■■ 5.66
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCA8O94911 1581 aa50.34■■■■■ 5.65
GRAMD4-204ENST00000431155 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP50.33■■■■■ 5.65
GRAMD4-204ENST00000431155 UBTFP17480 764 aaKnown RBP50.24■■■■■ 5.63
GRAMD4-204ENST00000431155 FHOD3Q2V2M9 1422 aa50.14■■■■■ 5.62
GRAMD4-204ENST00000431155 GLI2P10070 1586 aa50.08■■■■■ 5.61
GRAMD4-204ENST00000431155 TSPOAP1O95153 1857 aa50.08■■■■■ 5.61
GRAMD4-204ENST00000431155 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP50.07■■■■■ 5.61
GRAMD4-204ENST00000431155 EFCAB5A4FU69 1503 aa50.06■■■■■ 5.6
GRAMD4-204ENST00000431155 ARID3CA6NKF2 412 aa50.06■■■■■ 5.6
GRAMD4-204ENST00000431155 WDR7Q9Y4E6 1490 aa50.04■■■■■ 5.6
GRAMD4-204ENST00000431155 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa50■■■■■ 5.6
GRAMD4-204ENST00000431155 ATP10BO94823 1461 aa49.95■■■■■ 5.59
GRAMD4-204ENST00000431155 KCNH8Q96L42 1107 aa49.87■■■■■ 5.57
GRAMD4-204ENST00000431155 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa49.85■■■■■ 5.57
GRAMD4-204ENST00000431155 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP49.85■■■■■ 5.57
GRAMD4-204ENST00000431155 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP49.84■■■■■ 5.57
GRAMD4-204ENST00000431155 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa49.81■■■■■ 5.56
GRAMD4-204ENST00000431155 KDM6BO15054 1643 aa49.78■■■■■ 5.56
GRAMD4-204ENST00000431155 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP49.77■■■■■ 5.56
GRAMD4-204ENST00000431155 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP49.77■■■■■ 5.56
GRAMD4-204ENST00000431155 TEX14Q8IWB6 1497 aa49.64■■■■■ 5.54
GRAMD4-204ENST00000431155 CD109Q6YHK3 1445 aa49.64■■■■■ 5.54
GRAMD4-204ENST00000431155 CFAP43Q8NDM7 1665 aa49.63■■■■■ 5.54
GRAMD4-204ENST00000431155 FMN1Q68DA7 1419 aa49.62■■■■■ 5.53
GRAMD4-204ENST00000431155 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa49.53■■■■■ 5.52
GRAMD4-204ENST00000431155 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP49.51■■■■■ 5.52
GRAMD4-204ENST00000431155 PLEKHD1A6NEE1 506 aa49.48■■■■■ 5.51
GRAMD4-204ENST00000431155 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP49.48■■■■■ 5.51
GRAMD4-204ENST00000431155 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP49.48■■■■■ 5.51
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCA9Q8IUA7 1624 aa49.45■■■■■ 5.51
GRAMD4-204ENST00000431155 HECW1Q76N89 1606 aa49.45■■■■■ 5.51
GRAMD4-204ENST00000431155 CLIP1P30622 1438 aa49.38■■■■■ 5.5
GRAMD4-204ENST00000431155 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
GRAMD4-204ENST00000431155 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa49.2■■■■■ 5.47
GRAMD4-204ENST00000431155 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP49.19■■■■■ 5.478e-8■■■■■ 40.8
GRAMD4-204ENST00000431155 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa49.19■■■■■ 5.46
GRAMD4-204ENST00000431155 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP49.15■■■■■ 5.46
GRAMD4-204ENST00000431155 TTC37Q6PGP7 1564 aa49.14■■■■■ 5.46
GRAMD4-204ENST00000431155 ARAP3Q8WWN8 1544 aa49.11■■■■■ 5.45
GRAMD4-204ENST00000431155 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP49.1■■■■■ 5.45
GRAMD4-204ENST00000431155 NEO1Q92859 1461 aa49.1■■■■■ 5.45
GRAMD4-204ENST00000431155 PHLDB1Q86UU1 1377 aa49.08■■■■■ 5.45
GRAMD4-204ENST00000431155 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa49.06■■■■■ 5.44
GRAMD4-204ENST00000431155 CEP162Q5TB80 1403 aa49.06■■■■■ 5.44
GRAMD4-204ENST00000431155 FYCO1Q9BQS8 1478 aa49.06■■■■■ 5.44
GRAMD4-204ENST00000431155 CCDC18Q5T9S5 1454 aa49.03■■■■■ 5.44
GRAMD4-204ENST00000431155 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP49.02■■■■■ 5.44
GRAMD4-204ENST00000431155 KIF14Q15058 1648 aa48.98■■■■■ 5.43
GRAMD4-204ENST00000431155 FANCAO15360 1455 aa48.96■■■■■ 5.43
GRAMD4-204ENST00000431155 RAPGEF3O95398 923 aa48.93■■■■■ 5.42
GRAMD4-204ENST00000431155 AKNAQ7Z591 1439 aa48.9■■■■■ 5.42
GRAMD4-204ENST00000431155 PLCH2O75038 1416 aa48.89■■■■■ 5.42
GRAMD4-204ENST00000431155 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa48.88■■■■■ 5.42
GRAMD4-204ENST00000431155 CFAP74Q9C0B2 1584 aa48.88■■■■■ 5.42
GRAMD4-204ENST00000431155 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa48.81■■■■■ 5.4
GRAMD4-204ENST00000431155 MYO5CQ9NQX4 1742 aa48.8■■■■■ 5.4
GRAMD4-204ENST00000431155 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP48.77■■■■■ 5.4
GRAMD4-204ENST00000431155 ADGRL1O94910 1474 aa48.73■■■■■ 5.39
GRAMD4-204ENST00000431155 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa48.71■■■■■ 5.39
GRAMD4-204ENST00000431155 RICTORQ6R327 1708 aa48.68■■■■■ 5.38
GRAMD4-204ENST00000431155 ARHGAP5Q13017 1502 aa48.66■■■■■ 5.38
GRAMD4-204ENST00000431155 SCAPERQ9BY12 1400 aa48.64■■■■■ 5.38
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