RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429968.5

RBM39-212, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,149 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-212ENST00000429968 P3H3Q8IVL6 736 aa21.05■□□□□ 0.96
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RBM39-212ENST00000429968 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
RBM39-212ENST00000429968 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.01■□□□□ 0.95
RBM39-212ENST00000429968 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.01■□□□□ 0.95
RBM39-212ENST00000429968 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.99■□□□□ 0.95
RBM39-212ENST00000429968 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
RBM39-212ENST00000429968 MAP3K1Q13233 1512 aa20.96■□□□□ 0.95
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RBM39-212ENST00000429968 PBRM1Q86U86 1689 aa20.94■□□□□ 0.94
RBM39-212ENST00000429968 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.93■□□□□ 0.94
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RBM39-212ENST00000429968 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.91■□□□□ 0.94
RBM39-212ENST00000429968 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.89■□□□□ 0.94
RBM39-212ENST00000429968 SAMD9Q5K651 1589 aa20.88■□□□□ 0.93
RBM39-212ENST00000429968 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.88■□□□□ 0.93
RBM39-212ENST00000429968 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.87■□□□□ 0.93
RBM39-212ENST00000429968 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.932e-10■■■■□ 23
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RBM39-212ENST00000429968 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.84■□□□□ 0.93
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RBM39-212ENST00000429968 ITGAEP38570 1179 aa20.83■□□□□ 0.93
RBM39-212ENST00000429968 ADAMTS12P58397 1594 aa20.8■□□□□ 0.92
RBM39-212ENST00000429968 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
RBM39-212ENST00000429968 WDR62O43379 1518 aa20.77■□□□□ 0.92
RBM39-212ENST00000429968 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
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RBM39-212ENST00000429968 GRIN2BQ13224 1484 aa20.71■□□□□ 0.91
RBM39-212ENST00000429968 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.7■□□□□ 0.9
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RBM39-212ENST00000429968 IFT140Q96RY7 1462 aa20.67■□□□□ 0.9
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RBM39-212ENST00000429968 MAPKBP1O60336 1514 aa20.64■□□□□ 0.89
RBM39-212ENST00000429968 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.64■□□□□ 0.89
RBM39-212ENST00000429968 ERCC6Q03468 1493 aa20.6■□□□□ 0.89
RBM39-212ENST00000429968 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.6■□□□□ 0.89
RBM39-212ENST00000429968 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RBM39-212ENST00000429968 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.59■□□□□ 0.89
RBM39-212ENST00000429968 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.59■□□□□ 0.89
RBM39-212ENST00000429968 NCOA2Q15596 1464 aa20.57■□□□□ 0.88
RBM39-212ENST00000429968 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RBM39-212ENST00000429968 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.54■□□□□ 0.88
RBM39-212ENST00000429968 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.54■□□□□ 0.88
RBM39-212ENST00000429968 PTPRKQ15262 1439 aa20.53■□□□□ 0.88
RBM39-212ENST00000429968 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RBM39-212ENST00000429968 HECW1Q76N89 1606 aa20.53■□□□□ 0.88
RBM39-212ENST00000429968 GRIN2AQ12879 1464 aa20.52■□□□□ 0.88
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RBM39-212ENST00000429968 ARHGEF11O15085 1522 aa20.51■□□□□ 0.87
RBM39-212ENST00000429968 DISP1Q96F81 1524 aa20.5■□□□□ 0.87
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RBM39-212ENST00000429968 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RBM39-212ENST00000429968 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.49■□□□□ 0.87
RBM39-212ENST00000429968 ARID3CA6NKF2 412 aa20.48■□□□□ 0.87
RBM39-212ENST00000429968 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.48■□□□□ 0.87
RBM39-212ENST00000429968 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.47■□□□□ 0.87
RBM39-212ENST00000429968 CEP170Q5SW79 1584 aa20.46■□□□□ 0.87
RBM39-212ENST00000429968 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.46■□□□□ 0.87
RBM39-212ENST00000429968 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
RBM39-212ENST00000429968 MIER1Q8N108 512 aa20.43■□□□□ 0.86
RBM39-212ENST00000429968 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.42■□□□□ 0.86
RBM39-212ENST00000429968 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RBM39-212ENST00000429968 NEUROD1Q13562 356 aa20.4■□□□□ 0.86
RBM39-212ENST00000429968 SYNJ2O15056 1496 aa20.38■□□□□ 0.85
RBM39-212ENST00000429968 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RBM39-212ENST00000429968 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RBM39-212ENST00000429968 HFM1A2PYH4 1435 aa20.37■□□□□ 0.85
RBM39-212ENST00000429968 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.37■□□□□ 0.85
RBM39-212ENST00000429968 NAIPQ13075 1403 aa20.35■□□□□ 0.85
RBM39-212ENST00000429968 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RBM39-212ENST00000429968 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
RBM39-212ENST00000429968 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
RBM39-212ENST00000429968 FBLN2P98095 1184 aa20.32■□□□□ 0.84
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RBM39-212ENST00000429968 NUP160Q12769 1436 aa20.29■□□□□ 0.84
RBM39-212ENST00000429968 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.29■□□□□ 0.84
RBM39-212ENST00000429968 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.28■□□□□ 0.84
RBM39-212ENST00000429968 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.27■□□□□ 0.84
RBM39-212ENST00000429968 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RBM39-212ENST00000429968 UACAQ9BZF9 1416 aa20.26■□□□□ 0.83
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RBM39-212ENST00000429968 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.23■□□□□ 0.83
RBM39-212ENST00000429968 MIA2Q96PC5 1412 aa20.22■□□□□ 0.83
RBM39-212ENST00000429968 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RBM39-212ENST00000429968 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
RBM39-212ENST00000429968 KIF14Q15058 1648 aa20.21■□□□□ 0.83
RBM39-212ENST00000429968 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RBM39-212ENST00000429968 JPH4Q96JJ6 628 aa20.2■□□□□ 0.82
RBM39-212ENST00000429968 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RBM39-212ENST00000429968 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RBM39-212ENST00000429968 CHD1O14646 1710 aa20.16■□□□□ 0.82
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RBM39-212ENST00000429968 AKNAQ7Z591 1439 aa20.14■□□□□ 0.81
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