RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429205.6

SENP3-202, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SENP3, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-202ENST00000429205 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SENP3-202ENST00000429205 CUL7Q14999 1698 aa20.51■□□□□ 0.87
SENP3-202ENST00000429205 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.5■□□□□ 0.87
SENP3-202ENST00000429205 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 36
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SENP3-202ENST00000429205 IFT140Q96RY7 1462 aa20.44■□□□□ 0.86
SENP3-202ENST00000429205 PBRM1Q86U86 1689 aa20.43■□□□□ 0.86
SENP3-202ENST00000429205 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SENP3-202ENST00000429205 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.42■□□□□ 0.86
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SENP3-202ENST00000429205 ADAMTS12P58397 1594 aa20.31■□□□□ 0.84
SENP3-202ENST00000429205 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.3■□□□□ 0.84
SENP3-202ENST00000429205 P3H3Q8IVL6 736 aa20.26■□□□□ 0.83
SENP3-202ENST00000429205 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.24■□□□□ 0.83
SENP3-202ENST00000429205 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.2■□□□□ 0.82
SENP3-202ENST00000429205 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.2■□□□□ 0.82
SENP3-202ENST00000429205 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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SENP3-202ENST00000429205 GRIN2AQ12879 1464 aa20.12■□□□□ 0.81
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SENP3-202ENST00000429205 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SENP3-202ENST00000429205 FMN1Q68DA7 1419 aa20.06■□□□□ 0.8
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SENP3-202ENST00000429205 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.05■□□□□ 0.8
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SENP3-202ENST00000429205 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.04■□□□□ 0.8
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SENP3-202ENST00000429205 CEP170Q5SW79 1584 aa20.01■□□□□ 0.79
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SENP3-202ENST00000429205 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.99■□□□□ 0.79
SENP3-202ENST00000429205 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.98■□□□□ 0.79
SENP3-202ENST00000429205 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.96■□□□□ 0.79
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SENP3-202ENST00000429205 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
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SENP3-202ENST00000429205 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa19.74■□□□□ 0.75
SENP3-202ENST00000429205 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.73■□□□□ 0.75
SENP3-202ENST00000429205 ITGAEP38570 1179 aa19.73■□□□□ 0.75
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SENP3-202ENST00000429205 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.71■□□□□ 0.75
SENP3-202ENST00000429205 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
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SENP3-202ENST00000429205 NCOA2Q15596 1464 aa19.7■□□□□ 0.74
SENP3-202ENST00000429205 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.7■□□□□ 0.74
SENP3-202ENST00000429205 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
SENP3-202ENST00000429205 NEUROD1Q13562 356 aa19.68■□□□□ 0.74
SENP3-202ENST00000429205 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
SENP3-202ENST00000429205 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.66■□□□□ 0.74
SENP3-202ENST00000429205 ARHGEF11O15085 1522 aa19.63■□□□□ 0.73
SENP3-202ENST00000429205 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.63■□□□□ 0.73
SENP3-202ENST00000429205 SHROOM2Q13796 1616 aa19.63■□□□□ 0.73
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SENP3-202ENST00000429205 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.59■□□□□ 0.73
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SENP3-202ENST00000429205 MIA2Q96PC5 1412 aa19.48■□□□□ 0.71
SENP3-202ENST00000429205 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
SENP3-202ENST00000429205 UACAQ9BZF9 1416 aa19.47■□□□□ 0.71
SENP3-202ENST00000429205 KIF14Q15058 1648 aa19.45■□□□□ 0.7
SENP3-202ENST00000429205 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.45■□□□□ 0.7
SENP3-202ENST00000429205 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.42■□□□□ 0.7
SENP3-202ENST00000429205 ADCY10Q96PN6 1610 aa19.41■□□□□ 0.7
SENP3-202ENST00000429205 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.7
SENP3-202ENST00000429205 ABCC2Q92887 1545 aa19.39■□□□□ 0.69
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