RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429159.6

MEG3-208, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,608 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-208	ENST00000429159	APLP2	Q06481	763 aa		29.03	■■■□□ 2.24
MEG3-208	ENST00000429159	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.02	■■■□□ 2.24
MEG3-208	ENST00000429159	ARAP1	Q96P48	1450 aa		29.02	■■■□□ 2.24
MEG3-208	ENST00000429159	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		29.01	■■■□□ 2.24
MEG3-208	ENST00000429159	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		28.98	■■■□□ 2.23
MEG3-208	ENST00000429159	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MEG3-208	ENST00000429159	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.89	■■■□□ 2.22
MEG3-208	ENST00000429159	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
MEG3-208	ENST00000429159	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MEG3-208	ENST00000429159	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
MEG3-208	ENST00000429159	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MEG3-208	ENST00000429159	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MEG3-208	ENST00000429159	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MEG3-208	ENST00000429159	FBLN2	P98095	1184 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MEG3-208	ENST00000429159	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MEG3-208	ENST00000429159	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MEG3-208	ENST00000429159	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MEG3-208	ENST00000429159	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MEG3-208	ENST00000429159	NUP160	Q12769	1436 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MEG3-208	ENST00000429159	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MEG3-208	ENST00000429159	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MEG3-208	ENST00000429159	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.63	■■■□□ 2.17
MEG3-208	ENST00000429159	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
MEG3-208	ENST00000429159	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
MEG3-208	ENST00000429159	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.57	■■■□□ 2.16
MEG3-208	ENST00000429159	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
MEG3-208	ENST00000429159	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.53	■■■□□ 2.16
MEG3-208	ENST00000429159	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MEG3-208	ENST00000429159	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MEG3-208	ENST00000429159	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MEG3-208	ENST00000429159	CHD1	O14646	1710 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MEG3-208	ENST00000429159	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MEG3-208	ENST00000429159	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MEG3-208	ENST00000429159	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
MEG3-208	ENST00000429159	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MEG3-208	ENST00000429159	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.43	■■■□□ 2.14
MEG3-208	ENST00000429159	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MEG3-208	ENST00000429159	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.3	■■■□□ 2.12
MEG3-208	ENST00000429159	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
MEG3-208	ENST00000429159	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.28	■■■□□ 2.12
MEG3-208	ENST00000429159	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.12
MEG3-208	ENST00000429159	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
MEG3-208	ENST00000429159	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.26	■■■□□ 2.11
MEG3-208	ENST00000429159	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.24	■■■□□ 2.11
MEG3-208	ENST00000429159	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.24	■■■□□ 2.11
MEG3-208	ENST00000429159	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.21	■■■□□ 2.11
MEG3-208	ENST00000429159	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
MEG3-208	ENST00000429159	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.19	■■■□□ 2.1
MEG3-208	ENST00000429159	HRC	P23327	699 aa		28.18	■■■□□ 2.1
MEG3-208	ENST00000429159	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
MEG3-208	ENST00000429159	PTPRG	P23470	1445 aa		28.16	■■■□□ 2.1
MEG3-208	ENST00000429159	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
MEG3-208	ENST00000429159	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.11	■■■□□ 2.09
MEG3-208	ENST00000429159	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.11	■■■□□ 2.09
MEG3-208	ENST00000429159	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
MEG3-208	ENST00000429159	ABCA8	O94911	1581 aa		28.1	■■■□□ 2.09
MEG3-208	ENST00000429159	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
MEG3-208	ENST00000429159	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
MEG3-208	ENST00000429159	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
MEG3-208	ENST00000429159	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.07	■■■□□ 2.08
MEG3-208	ENST00000429159	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.05	■■■□□ 2.08
MEG3-208	ENST00000429159	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MEG3-208	ENST00000429159	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MEG3-208	ENST00000429159	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28	■■■□□ 2.07
MEG3-208	ENST00000429159	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28	■■■□□ 2.07
MEG3-208	ENST00000429159	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28	■■■□□ 2.07
MEG3-208	ENST00000429159	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.99	■■■□□ 2.07
MEG3-208	ENST00000429159	UACA	Q9BZF9	1416 aa		27.99	■■■□□ 2.07
MEG3-208	ENST00000429159	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
MEG3-208	ENST00000429159	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
MEG3-208	ENST00000429159	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
MEG3-208	ENST00000429159	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MEG3-208	ENST00000429159	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MEG3-208	ENST00000429159	ATP10B	O94823	1461 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MEG3-208	ENST00000429159	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MEG3-208	ENST00000429159	ABCC2	Q92887	1545 aa		27.89	■■■□□ 2.05
MEG3-208	ENST00000429159	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MEG3-208	ENST00000429159	ITGAE	P38570	1179 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MEG3-208	ENST00000429159	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MEG3-208	ENST00000429159	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MEG3-208	ENST00000429159	KIF14	Q15058	1648 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MEG3-208	ENST00000429159	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
MEG3-208	ENST00000429159	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MEG3-208	ENST00000429159	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MEG3-208	ENST00000429159	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MEG3-208	ENST00000429159	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
MEG3-208	ENST00000429159	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
MEG3-208	ENST00000429159	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
MEG3-208	ENST00000429159	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MEG3-208	ENST00000429159	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MEG3-208	ENST00000429159	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MEG3-208	ENST00000429159	HFM1	A2PYH4	1435 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MEG3-208	ENST00000429159	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		27.58	■■■□□ 2
MEG3-208	ENST00000429159	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.56	■■■□□ 2
MEG3-208	ENST00000429159	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.56	■■■□□ 2
MEG3-208	ENST00000429159	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
MEG3-208	ENST00000429159	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
MEG3-208	ENST00000429159	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	27.54	■■■□□ 2
MEG3-208	ENST00000429159	DAPK1	P53355	1430 aa		27.53	■■■□□ 2
MEG3-208	ENST00000429159	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.53	■■■□□ 2

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