RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428034.1

CLEC3B-202, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLEC3B, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-202ENST00000428034 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.2■■■■■ 4.67
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CLEC3B-202ENST00000428034 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.09■■■■■ 4.65
CLEC3B-202ENST00000428034 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.78■■■■■ 4.6
CLEC3B-202ENST00000428034 IQGAP2Q13576 1575 aa43.71■■■■■ 4.59
CLEC3B-202ENST00000428034 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.66■■■■■ 4.58
CLEC3B-202ENST00000428034 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.66■■■■■ 4.58
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CLEC3B-202ENST00000428034 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.57■■■■■ 4.57
CLEC3B-202ENST00000428034 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.56■■■■■ 4.56
CLEC3B-202ENST00000428034 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
CLEC3B-202ENST00000428034 MAPKBP1O60336 1514 aa43.47■■■■■ 4.55
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CLEC3B-202ENST00000428034 DISP1Q96F81 1524 aa43.45■■■■■ 4.55
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CLEC3B-202ENST00000428034 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.41■■■■■ 4.54
CLEC3B-202ENST00000428034 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.38■■■■■ 4.53
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CLEC3B-202ENST00000428034 UACAQ9BZF9 1416 aa43.28■■■■■ 4.52
CLEC3B-202ENST00000428034 ABCC2Q92887 1545 aa43.27■■■■■ 4.52
CLEC3B-202ENST00000428034 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.27■■■■■ 4.52
CLEC3B-202ENST00000428034 DIP2BQ9P265 1576 aa43.24■■■■■ 4.51
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CLEC3B-202ENST00000428034 ASXL2Q76L83 1435 aa43.07■■■■■ 4.49
CLEC3B-202ENST00000428034 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.06■■■■■ 4.48
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CLEC3B-202ENST00000428034 TSPOAP1O95153 1857 aa42.89■■■■■ 4.46
CLEC3B-202ENST00000428034 ABCA8O94911 1581 aa42.87■■■■■ 4.45
CLEC3B-202ENST00000428034 P3H3Q8IVL6 736 aa42.83■■■■■ 4.45
CLEC3B-202ENST00000428034 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
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CLEC3B-202ENST00000428034 KDM6BO15054 1643 aa42.75■■■■■ 4.43
CLEC3B-202ENST00000428034 KIF21BO75037 1637 aa42.74■■■■■ 4.43
CLEC3B-202ENST00000428034 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.74■■■■■ 4.43
CLEC3B-202ENST00000428034 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
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CLEC3B-202ENST00000428034 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.56■■■■■ 4.4
CLEC3B-202ENST00000428034 KCNH8Q96L42 1107 aa42.56■■■■■ 4.4
CLEC3B-202ENST00000428034 ATP10BO94823 1461 aa42.55■■■■■ 4.4
CLEC3B-202ENST00000428034 ARID3CA6NKF2 412 aa42.54■■■■■ 4.4
CLEC3B-202ENST00000428034 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.51■■■■■ 4.4
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CLEC3B-202ENST00000428034 CD109Q6YHK3 1445 aa42.45■■■■■ 4.39
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CLEC3B-202ENST00000428034 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.42■■■■■ 4.38
CLEC3B-202ENST00000428034 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.38■■■■■ 4.37
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CLEC3B-202ENST00000428034 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.15■■■■■ 4.34
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CLEC3B-202ENST00000428034 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.07■■■■■ 4.33
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CLEC3B-202ENST00000428034 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.79■■■■■ 4.28
CLEC3B-202ENST00000428034 FANCAO15360 1455 aa41.76■■■■■ 4.28
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CLEC3B-202ENST00000428034 CLIP1P30622 1438 aa41.69■■■■■ 4.26
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CLEC3B-202ENST00000428034 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.54■■■■■ 4.24
CLEC3B-202ENST00000428034 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.53■■■■■ 4.24
CLEC3B-202ENST00000428034 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.48■■■■■ 4.23
CLEC3B-202ENST00000428034 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.44■■■■■ 4.23
CLEC3B-202ENST00000428034 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.44■■■■■ 4.22
CLEC3B-202ENST00000428034 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.41■■■■■ 4.22
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