RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 JPH4Q96JJ6 628 aa26.33■■□□□ 1.81
CITED1-204ENST00000427412 MAPKBP1O60336 1514 aa26.32■■□□□ 1.8
CITED1-204ENST00000427412 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.3■■□□□ 1.8
CITED1-204ENST00000427412 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CITED1-204ENST00000427412 DIP2BQ9P265 1576 aa26.27■■□□□ 1.8
CITED1-204ENST00000427412 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.25■■□□□ 1.79
CITED1-204ENST00000427412 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.24■■□□□ 1.79
CITED1-204ENST00000427412 KIF27Q86VH2 1401 aa26.21■■□□□ 1.79
CITED1-204ENST00000427412 IGF1RP08069 1367 aa26.19■■□□□ 1.78
CITED1-204ENST00000427412 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
CITED1-204ENST00000427412 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.06■■□□□ 1.76
CITED1-204ENST00000427412 TSPOAP1O95153 1857 aa26.06■■□□□ 1.76
CITED1-204ENST00000427412 KDM6BO15054 1643 aa26.05■■□□□ 1.76
CITED1-204ENST00000427412 IQGAP2Q13576 1575 aa26.03■■□□□ 1.76
CITED1-204ENST00000427412 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26■■□□□ 1.75
CITED1-204ENST00000427412 ABCC2Q92887 1545 aa25.96■■□□□ 1.75
CITED1-204ENST00000427412 PTPRGP23470 1445 aa25.96■■□□□ 1.75
CITED1-204ENST00000427412 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.95■■□□□ 1.74
CITED1-204ENST00000427412 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.94■■□□□ 1.74
CITED1-204ENST00000427412 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CITED1-204ENST00000427412 GLI2P10070 1586 aa25.91■■□□□ 1.74
CITED1-204ENST00000427412 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.91■■□□□ 1.74
CITED1-204ENST00000427412 DISP1Q96F81 1524 aa25.89■■□□□ 1.74
CITED1-204ENST00000427412 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.86■■□□□ 1.73
CITED1-204ENST00000427412 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.85■■□□□ 1.73
CITED1-204ENST00000427412 ASXL2Q76L83 1435 aa25.84■■□□□ 1.73
CITED1-204ENST00000427412 KIAA0556O60303 1618 aa25.82■■□□□ 1.72
CITED1-204ENST00000427412 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.81■■□□□ 1.72
CITED1-204ENST00000427412 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.8■■□□□ 1.72
CITED1-204ENST00000427412 UACAQ9BZF9 1416 aa25.8■■□□□ 1.72
CITED1-204ENST00000427412 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.8■■□□□ 1.72
CITED1-204ENST00000427412 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.79■■□□□ 1.72
CITED1-204ENST00000427412 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CITED1-204ENST00000427412 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CITED1-204ENST00000427412 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CITED1-204ENST00000427412 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.72■■□□□ 1.71
CITED1-204ENST00000427412 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.64■■□□□ 1.69
CITED1-204ENST00000427412 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CITED1-204ENST00000427412 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.6■■□□□ 1.69
CITED1-204ENST00000427412 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.58■■□□□ 1.69
CITED1-204ENST00000427412 ABCA8O94911 1581 aa25.58■■□□□ 1.69
CITED1-204ENST00000427412 ADGRL1O94910 1474 aa25.57■■□□□ 1.68
CITED1-204ENST00000427412 GOLGA3Q08378 1498 aa25.57■■□□□ 1.68
CITED1-204ENST00000427412 PRXQ9BXM0 1461 aa25.53■■□□□ 1.68
CITED1-204ENST00000427412 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.48■■□□□ 1.67
CITED1-204ENST00000427412 CD109Q6YHK3 1445 aa25.39■■□□□ 1.66
CITED1-204ENST00000427412 SAMD9Q5K651 1589 aa25.37■■□□□ 1.65
CITED1-204ENST00000427412 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.34■■□□□ 1.65
CITED1-204ENST00000427412 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.33■■□□□ 1.65
CITED1-204ENST00000427412 KIF21BO75037 1637 aa25.31■■□□□ 1.64
CITED1-204ENST00000427412 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.28■■□□□ 1.64
CITED1-204ENST00000427412 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.28■■□□□ 1.64
CITED1-204ENST00000427412 ATP10BO94823 1461 aa25.27■■□□□ 1.64
CITED1-204ENST00000427412 KCNH8Q96L42 1107 aa25.23■■□□□ 1.63
CITED1-204ENST00000427412 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.16■■□□□ 1.62
CITED1-204ENST00000427412 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.14■■□□□ 1.62
CITED1-204ENST00000427412 NEO1Q92859 1461 aa25.14■■□□□ 1.61
CITED1-204ENST00000427412 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.13■■□□□ 1.61
CITED1-204ENST00000427412 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CITED1-204ENST00000427412 EEA1Q15075 1411 aa25.12■■□□□ 1.61
CITED1-204ENST00000427412 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CITED1-204ENST00000427412 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CITED1-204ENST00000427412 P3H3Q8IVL6 736 aa25.1■■□□□ 1.61
CITED1-204ENST00000427412 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.1■■□□□ 1.61
CITED1-204ENST00000427412 ARID3CA6NKF2 412 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-204ENST00000427412 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-204ENST00000427412 RICTORQ6R327 1708 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-204ENST00000427412 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.03■■□□□ 1.6
CITED1-204ENST00000427412 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.03■■□□□ 1.6
CITED1-204ENST00000427412 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.03■■□□□ 1.6
CITED1-204ENST00000427412 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.03■■□□□ 1.6
CITED1-204ENST00000427412 PTPRMP28827 1452 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED1-204ENST00000427412 MADDQ8WXG6 1647 aa24.98■■□□□ 1.59
CITED1-204ENST00000427412 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.96■■□□□ 1.59
CITED1-204ENST00000427412 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
CITED1-204ENST00000427412 RAPGEF3O95398 923 aa24.95■■□□□ 1.58
CITED1-204ENST00000427412 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED1-204ENST00000427412 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CITED1-204ENST00000427412 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CITED1-204ENST00000427412 FANCAO15360 1455 aa24.89■■□□□ 1.58
CITED1-204ENST00000427412 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CITED1-204ENST00000427412 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CITED1-204ENST00000427412 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CITED1-204ENST00000427412 AKNAQ7Z591 1439 aa24.87■■□□□ 1.57
CITED1-204ENST00000427412 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.87■■□□□ 1.57
CITED1-204ENST00000427412 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.85■■□□□ 1.57
CITED1-204ENST00000427412 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CITED1-204ENST00000427412 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.83■■□□□ 1.57
CITED1-204ENST00000427412 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.82■■□□□ 1.56
CITED1-204ENST00000427412 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-204ENST00000427412 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-204ENST00000427412 HECW1Q76N89 1606 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-204ENST00000427412 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CITED1-204ENST00000427412 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.79■■□□□ 1.56
CITED1-204ENST00000427412 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.77■■□□□ 1.56
CITED1-204ENST00000427412 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CITED1-204ENST00000427412 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.74■■□□□ 1.55
CITED1-204ENST00000427412 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.74■■□□□ 1.55
CITED1-204ENST00000427412 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.72■■□□□ 1.55
CITED1-204ENST00000427412 PLCH2O75038 1416 aa24.72■■□□□ 1.55
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