RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JPH4Q96JJ6 628 aa42.24■■■■■ 4.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.21■■■■■ 4.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.17■■■■■ 4.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.15■■■■■ 4.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRXQ9BXM0 1461 aa42.04■■■■■ 4.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.96■■■■■ 4.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IQGAP2Q13576 1575 aa41.93■■■■■ 4.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EEA1Q15075 1411 aa41.91■■■■■ 4.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.73■■■■■ 4.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DISP1Q96F81 1524 aa41.72■■■■■ 4.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.71■■■■■ 4.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.7■■■■■ 4.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.63■■■■■ 4.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPRGP23470 1445 aa41.63■■■■■ 4.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA0556O60303 1618 aa41.55■■■■■ 4.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.53■■■■■ 4.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF21BO75037 1637 aa41.51■■■■■ 4.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLGA3Q08378 1498 aa41.43■■■■■ 4.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.36■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UACAQ9BZF9 1416 aa41.35■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.32■■■■■ 4.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.31■■■■■ 4.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAPKBP1O60336 1514 aa41.27■■■■■ 4.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCC2Q92887 1545 aa41.27■■■■■ 4.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 P3H3Q8IVL6 736 aa41.26■■■■■ 4.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SAMD9Q5K651 1589 aa41.24■■■■■ 4.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.21■■■■■ 4.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.13■■■■■ 4.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCA8O94911 1581 aa41.12■■■■■ 4.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.12■■■■■ 4.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.07■■■■■ 4.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.04■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.03■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ASXL2Q76L83 1435 aa41.03■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DIP2BQ9P265 1576 aa41.03■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.99■■■■■ 4.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.86■■■■■ 4.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.84■■■■■ 4.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARID3CA6NKF2 412 aa40.83■■■■■ 4.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP10BO94823 1461 aa40.82■■■■■ 4.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.78■■■■■ 4.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLI2P10070 1586 aa40.78■■■■■ 4.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FMN1Q68DA7 1419 aa40.63■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNH8Q96L42 1107 aa40.63■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPOAP1O95153 1857 aa40.62■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.58■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLIP1P30622 1438 aa40.54■■■■■ 4.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.46■■■■■ 4.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD109Q6YHK3 1445 aa40.43■■■■■ 4.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HECW1Q76N89 1606 aa40.42■■■■■ 4.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.4■■■■■ 4.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.4■■■■■ 4.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KDM6BO15054 1643 aa40.37■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.36■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.36■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.34■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP162Q5TB80 1403 aa40.33■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.33■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.27■■■■■ 4.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.2■■■■■ 4.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.17■■■■■ 4.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.14■■■■■ 4.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.11■■■■■ 4.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF14Q15058 1648 aa40.02■■■■■ 4
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.01■■■■■ 4
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEO1Q92859 1461 aa40.01■■■■■ 4
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.99■■■■□ 3.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLCH2O75038 1416 aa39.94■■■■□ 3.98
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FANCAO15360 1455 aa39.93■■■■□ 3.98
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AKNAQ7Z591 1439 aa39.88■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAPGEF3O95398 923 aa39.86■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.82■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.81■■■■□ 3.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.77■■■■□ 3.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.76■■■■□ 3.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.73■■■■□ 3.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.71■■■■□ 3.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADGRL1O94910 1474 aa39.7■■■■□ 3.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.68■■■■□ 3.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.68■■■■□ 3.94
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