RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426677.6

TOMM40-203, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-203ENST00000426677 NUP160Q12769 1436 aa38.87■■■■□ 3.81
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TOMM40-203ENST00000426677 IQGAP2Q13576 1575 aa38.72■■■■□ 3.79
TOMM40-203ENST00000426677 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.71■■■■□ 3.79
TOMM40-203ENST00000426677 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.7■■■■□ 3.79
TOMM40-203ENST00000426677 CEP162Q5TB80 1403 aa38.6■■■■□ 3.77
TOMM40-203ENST00000426677 OSCARQ8IYS5 282 aa38.58■■■■□ 3.77
TOMM40-203ENST00000426677 SHROOM2Q13796 1616 aa38.53■■■■□ 3.76
TOMM40-203ENST00000426677 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.5■■■■□ 3.75
TOMM40-203ENST00000426677 CLIP1P30622 1438 aa38.48■■■■□ 3.75
TOMM40-203ENST00000426677 JPH4Q96JJ6 628 aa38.46■■■■□ 3.75
TOMM40-203ENST00000426677 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.46■■■■□ 3.75
TOMM40-203ENST00000426677 SAMD9Q5K651 1589 aa38.46■■■■□ 3.75
TOMM40-203ENST00000426677 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.46■■■■□ 3.75
TOMM40-203ENST00000426677 DISP1Q96F81 1524 aa38.43■■■■□ 3.74
TOMM40-203ENST00000426677 P3H3Q8IVL6 736 aa38.41■■■■□ 3.74
TOMM40-203ENST00000426677 KIAA0556O60303 1618 aa38.38■■■■□ 3.73
TOMM40-203ENST00000426677 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
TOMM40-203ENST00000426677 ARAP1Q96P48 1450 aa38.34■■■■□ 3.73
TOMM40-203ENST00000426677 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.34■■■■□ 3.73
TOMM40-203ENST00000426677 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.33■■■■□ 3.73
TOMM40-203ENST00000426677 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
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TOMM40-203ENST00000426677 ARHGEF11O15085 1522 aa38.12■■■■□ 3.69
TOMM40-203ENST00000426677 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.07■■■■□ 3.69
TOMM40-203ENST00000426677 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.07■■■■□ 3.69
TOMM40-203ENST00000426677 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.07■■■■□ 3.69
TOMM40-203ENST00000426677 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
TOMM40-203ENST00000426677 VPS8Q8N3P4 1428 aa38■■■■□ 3.67
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TOMM40-203ENST00000426677 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.95■■■■□ 3.67
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TOMM40-203ENST00000426677 ABCA8O94911 1581 aa37.88■■■■□ 3.65
TOMM40-203ENST00000426677 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.82■■■■□ 3.65
TOMM40-203ENST00000426677 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.79■■■■□ 3.64
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TOMM40-203ENST00000426677 ARID3CA6NKF2 412 aa37.78■■■■□ 3.64
TOMM40-203ENST00000426677 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
TOMM40-203ENST00000426677 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.76■■■■□ 3.64
TOMM40-203ENST00000426677 UACAQ9BZF9 1416 aa37.75■■■■□ 3.63
TOMM40-203ENST00000426677 HECW1Q76N89 1606 aa37.75■■■■□ 3.63
TOMM40-203ENST00000426677 ABCC2Q92887 1545 aa37.71■■■■□ 3.63
TOMM40-203ENST00000426677 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
TOMM40-203ENST00000426677 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.7■■■■□ 3.63
TOMM40-203ENST00000426677 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.7■■■■□ 3.63
TOMM40-203ENST00000426677 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
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TOMM40-203ENST00000426677 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.62■■■■□ 3.61
TOMM40-203ENST00000426677 TIAM1Q13009 1591 aa37.59■■■■□ 3.61
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TOMM40-203ENST00000426677 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.5■■■■□ 3.59
TOMM40-203ENST00000426677 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.5■■■■□ 3.59
TOMM40-203ENST00000426677 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
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TOMM40-203ENST00000426677 APLP2Q06481 763 aa37.4■■■■□ 3.58
TOMM40-203ENST00000426677 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.37■■■■□ 3.57
TOMM40-203ENST00000426677 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.36■■■■□ 3.57
TOMM40-203ENST00000426677 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
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TOMM40-203ENST00000426677 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.26■■■■□ 3.55
TOMM40-203ENST00000426677 ASXL2Q76L83 1435 aa37.23■■■■□ 3.55
TOMM40-203ENST00000426677 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
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TOMM40-203ENST00000426677 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.17■■■■□ 3.54
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TOMM40-203ENST00000426677 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.07■■■■□ 3.53
TOMM40-203ENST00000426677 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.05■■■■□ 3.527e-7■■■■□ 22.9
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TOMM40-203ENST00000426677 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.93■■■■□ 3.5
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TOMM40-203ENST00000426677 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.85■■■■□ 3.49
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TOMM40-203ENST00000426677 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.83■■■■□ 3.49
TOMM40-203ENST00000426677 GLI2P10070 1586 aa36.8■■■■□ 3.48
TOMM40-203ENST00000426677 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.8■■■■□ 3.48
TOMM40-203ENST00000426677 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.77■■■■□ 3.48
TOMM40-203ENST00000426677 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.77■■■■□ 3.48
TOMM40-203ENST00000426677 TSPOAP1O95153 1857 aa36.76■■■■□ 3.48
TOMM40-203ENST00000426677 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.73■■■■□ 3.47
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