RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423717.1

EPDR1-202, Transcript of ependymin related 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EPDR1, Length 638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1-202ENST00000423717 EEA1Q15075 1411 aa37.73■■■■□ 3.63
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EPDR1-202ENST00000423717 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.59■■■■□ 3.61
EPDR1-202ENST00000423717 JPH4Q96JJ6 628 aa37.58■■■■□ 3.61
EPDR1-202ENST00000423717 SHROOM2Q13796 1616 aa37.55■■■■□ 3.6
EPDR1-202ENST00000423717 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.53■■■■□ 3.6
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EPDR1-202ENST00000423717 IQGAP2Q13576 1575 aa37.46■■■■□ 3.59
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EPDR1-202ENST00000423717 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.43■■■■□ 3.58
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EPDR1-202ENST00000423717 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.2■■■■□ 3.55
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EPDR1-202ENST00000423717 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.79■■■■□ 3.32
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EPDR1-202ENST00000423717 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.53■■■■□ 3.28
EPDR1-202ENST00000423717 AKNAQ7Z591 1439 aa35.52■■■■□ 3.28
EPDR1-202ENST00000423717 MAP3K1Q13233 1512 aa35.52■■■■□ 3.28
EPDR1-202ENST00000423717 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.51■■■■□ 3.28
EPDR1-202ENST00000423717 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.51■■■■□ 3.27
EPDR1-202ENST00000423717 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.5■■■■□ 3.27
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