RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421792.2

COX18-202, Transcript of cytochrome c oxidase assembly factor COX18, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene COX18, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX18-202ENST00000421792 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
COX18-202ENST00000421792 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.28■■■□□ 2.44
COX18-202ENST00000421792 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.28■■■□□ 2.44
COX18-202ENST00000421792 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
COX18-202ENST00000421792 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.08■■■□□ 2.41
COX18-202ENST00000421792 IQGAP2Q13576 1575 aa30.06■■■□□ 2.4
COX18-202ENST00000421792 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.02■■■□□ 2.4
COX18-202ENST00000421792 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
COX18-202ENST00000421792 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.9■■■□□ 2.38
COX18-202ENST00000421792 PTPRGP23470 1445 aa29.9■■■□□ 2.38
COX18-202ENST00000421792 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.89■■■□□ 2.38
COX18-202ENST00000421792 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.87■■■□□ 2.37
COX18-202ENST00000421792 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.86■■■□□ 2.37
COX18-202ENST00000421792 MAPKBP1O60336 1514 aa29.86■■■□□ 2.37
COX18-202ENST00000421792 PRXQ9BXM0 1461 aa29.85■■■□□ 2.37
COX18-202ENST00000421792 DISP1Q96F81 1524 aa29.81■■■□□ 2.36
COX18-202ENST00000421792 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.8■■■□□ 2.36
COX18-202ENST00000421792 EEA1Q15075 1411 aa29.78■■■□□ 2.36
COX18-202ENST00000421792 KIAA0556O60303 1618 aa29.74■■■□□ 2.35
COX18-202ENST00000421792 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.74■■■□□ 2.35
COX18-202ENST00000421792 GOLGA3Q08378 1498 aa29.74■■■□□ 2.35
COX18-202ENST00000421792 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.73■■■□□ 2.35
COX18-202ENST00000421792 ABCC2Q92887 1545 aa29.71■■■□□ 2.35
COX18-202ENST00000421792 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.71■■■□□ 2.35
COX18-202ENST00000421792 UACAQ9BZF9 1416 aa29.69■■■□□ 2.34
COX18-202ENST00000421792 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
COX18-202ENST00000421792 DIP2BQ9P265 1576 aa29.67■■■□□ 2.34
COX18-202ENST00000421792 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.64■■■□□ 2.34
COX18-202ENST00000421792 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.59■■■□□ 2.33
COX18-202ENST00000421792 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.56■■■□□ 2.32
COX18-202ENST00000421792 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
COX18-202ENST00000421792 ASXL2Q76L83 1435 aa29.53■■■□□ 2.32
COX18-202ENST00000421792 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
COX18-202ENST00000421792 GLI2P10070 1586 aa29.47■■■□□ 2.31
COX18-202ENST00000421792 KIF21BO75037 1637 aa29.45■■■□□ 2.31
COX18-202ENST00000421792 ABCA8O94911 1581 aa29.44■■■□□ 2.3
COX18-202ENST00000421792 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.44■■■□□ 2.3
COX18-202ENST00000421792 TSPOAP1O95153 1857 aa29.43■■■□□ 2.3
COX18-202ENST00000421792 SAMD9Q5K651 1589 aa29.42■■■□□ 2.3
COX18-202ENST00000421792 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
COX18-202ENST00000421792 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.35■■■□□ 2.29
COX18-202ENST00000421792 KDM6BO15054 1643 aa29.33■■■□□ 2.29
COX18-202ENST00000421792 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.3■■■□□ 2.28
COX18-202ENST00000421792 P3H3Q8IVL6 736 aa29.28■■■□□ 2.28
COX18-202ENST00000421792 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.27■■■□□ 2.28
COX18-202ENST00000421792 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
COX18-202ENST00000421792 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.25■■■□□ 2.27
COX18-202ENST00000421792 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.23■■■□□ 2.27
COX18-202ENST00000421792 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.19■■■□□ 2.26
COX18-202ENST00000421792 ATP10BO94823 1461 aa29.17■■■□□ 2.26
COX18-202ENST00000421792 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
COX18-202ENST00000421792 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.14■■■□□ 2.26
COX18-202ENST00000421792 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
COX18-202ENST00000421792 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
COX18-202ENST00000421792 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.11■■■□□ 2.25
COX18-202ENST00000421792 KCNH8Q96L42 1107 aa29.11■■■□□ 2.25
COX18-202ENST00000421792 CD109Q6YHK3 1445 aa29.11■■■□□ 2.25
COX18-202ENST00000421792 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
COX18-202ENST00000421792 ARID3CA6NKF2 412 aa29.04■■■□□ 2.24
COX18-202ENST00000421792 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
COX18-202ENST00000421792 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
COX18-202ENST00000421792 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.02■■■□□ 2.24
COX18-202ENST00000421792 FMN1Q68DA7 1419 aa29■■■□□ 2.23
COX18-202ENST00000421792 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.96■■■□□ 2.23
COX18-202ENST00000421792 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
COX18-202ENST00000421792 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.95■■■□□ 2.22
COX18-202ENST00000421792 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.94■■■□□ 2.22
COX18-202ENST00000421792 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.94■■■□□ 2.22
COX18-202ENST00000421792 HECW1Q76N89 1606 aa28.89■■■□□ 2.22
COX18-202ENST00000421792 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.88■■■□□ 2.21
COX18-202ENST00000421792 NEO1Q92859 1461 aa28.85■■■□□ 2.21
COX18-202ENST00000421792 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
COX18-202ENST00000421792 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
COX18-202ENST00000421792 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.76■■■□□ 2.19
COX18-202ENST00000421792 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
COX18-202ENST00000421792 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.74■■■□□ 2.19
COX18-202ENST00000421792 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
COX18-202ENST00000421792 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.68■■■□□ 2.18
COX18-202ENST00000421792 ADGRL1O94910 1474 aa28.68■■■□□ 2.18
COX18-202ENST00000421792 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.68■■■□□ 2.18
COX18-202ENST00000421792 FANCAO15360 1455 aa28.67■■■□□ 2.18
COX18-202ENST00000421792 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.66■■■□□ 2.18
COX18-202ENST00000421792 CLIP1P30622 1438 aa28.66■■■□□ 2.18
COX18-202ENST00000421792 KIF14Q15058 1648 aa28.63■■■□□ 2.17
COX18-202ENST00000421792 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
COX18-202ENST00000421792 AKNAQ7Z591 1439 aa28.62■■■□□ 2.17
COX18-202ENST00000421792 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.62■■■□□ 2.17
COX18-202ENST00000421792 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
COX18-202ENST00000421792 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.61■■■□□ 2.17
COX18-202ENST00000421792 PLCH2O75038 1416 aa28.6■■■□□ 2.17
COX18-202ENST00000421792 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.6■■■□□ 2.17
COX18-202ENST00000421792 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
COX18-202ENST00000421792 RAPGEF3O95398 923 aa28.58■■■□□ 2.17
COX18-202ENST00000421792 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.57■■■□□ 2.16
COX18-202ENST00000421792 RICTORQ6R327 1708 aa28.57■■■□□ 2.16
COX18-202ENST00000421792 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.51■■■□□ 2.15
COX18-202ENST00000421792 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.49■■■□□ 2.15
COX18-202ENST00000421792 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.47■■■□□ 2.15
COX18-202ENST00000421792 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.47■■■□□ 2.15
COX18-202ENST00000421792 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms