RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419349.1

GPX1-201, Transcript of glutathione peroxidase 1, humanhuman

BASIC

Gene GPX1, Length 1,106 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPX1-201ENST00000419349 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
GPX1-201ENST00000419349 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.17■■■■■ 4.5
GPX1-201ENST00000419349 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.99■■■■■ 4.47
GPX1-201ENST00000419349 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.99■■■■■ 4.47
GPX1-201ENST00000419349 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.65■■■■■ 4.42
GPX1-201ENST00000419349 IQGAP2Q13576 1575 aa42.65■■■■■ 4.42
GPX1-201ENST00000419349 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.64■■■■■ 4.42
GPX1-201ENST00000419349 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.61■■■■■ 4.41
GPX1-201ENST00000419349 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.58■■■■■ 4.41
GPX1-201ENST00000419349 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.55■■■■■ 4.4
GPX1-201ENST00000419349 PTPRGP23470 1445 aa42.54■■■■■ 4.4
GPX1-201ENST00000419349 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
GPX1-201ENST00000419349 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.5■■■■■ 4.39
GPX1-201ENST00000419349 MAPKBP1O60336 1514 aa42.47■■■■■ 4.39
GPX1-201ENST00000419349 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.4■■■■■ 4.38
GPX1-201ENST00000419349 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.39■■■■■ 4.38
GPX1-201ENST00000419349 DISP1Q96F81 1524 aa42.39■■■■■ 4.38
GPX1-201ENST00000419349 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.36■■■■■ 4.37
GPX1-201ENST00000419349 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.31■■■■■ 4.36
GPX1-201ENST00000419349 DIP2BQ9P265 1576 aa42.31■■■■■ 4.36
GPX1-201ENST00000419349 PRXQ9BXM0 1461 aa42.27■■■■■ 4.36
GPX1-201ENST00000419349 ABCC2Q92887 1545 aa42.25■■■■■ 4.35
GPX1-201ENST00000419349 KIAA0556O60303 1618 aa42.24■■■■■ 4.35
GPX1-201ENST00000419349 UACAQ9BZF9 1416 aa42.22■■■■■ 4.35
GPX1-201ENST00000419349 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.2■■■■■ 4.35
GPX1-201ENST00000419349 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.08■■■■■ 4.33
GPX1-201ENST00000419349 ASXL2Q76L83 1435 aa42.08■■■■■ 4.33
GPX1-201ENST00000419349 GOLGA3Q08378 1498 aa42.08■■■■■ 4.33
GPX1-201ENST00000419349 TSPOAP1O95153 1857 aa42.06■■■■■ 4.32
GPX1-201ENST00000419349 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.05■■■■■ 4.32
GPX1-201ENST00000419349 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.01■■■■■ 4.32
GPX1-201ENST00000419349 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
GPX1-201ENST00000419349 EEA1Q15075 1411 aa41.94■■■■■ 4.3
GPX1-201ENST00000419349 GLI2P10070 1586 aa41.91■■■■■ 4.3
GPX1-201ENST00000419349 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
GPX1-201ENST00000419349 KDM6BO15054 1643 aa41.87■■■■■ 4.29
GPX1-201ENST00000419349 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
GPX1-201ENST00000419349 ABCA8O94911 1581 aa41.83■■■■■ 4.29
GPX1-201ENST00000419349 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
GPX1-201ENST00000419349 P3H3Q8IVL6 736 aa41.8■■■■■ 4.28
GPX1-201ENST00000419349 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
GPX1-201ENST00000419349 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.72■■■■■ 4.27
GPX1-201ENST00000419349 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.7■■■■■ 4.27
GPX1-201ENST00000419349 SAMD9Q5K651 1589 aa41.68■■■■■ 4.26
GPX1-201ENST00000419349 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
GPX1-201ENST00000419349 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.61■■■■■ 4.25
GPX1-201ENST00000419349 KIF21BO75037 1637 aa41.58■■■■■ 4.25
GPX1-201ENST00000419349 KCNH8Q96L42 1107 aa41.58■■■■■ 4.25
GPX1-201ENST00000419349 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.57■■■■■ 4.25
GPX1-201ENST00000419349 ARID3CA6NKF2 412 aa41.56■■■■■ 4.24
GPX1-201ENST00000419349 ATP10BO94823 1461 aa41.49■■■■■ 4.23
GPX1-201ENST00000419349 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.48■■■■■ 4.23
GPX1-201ENST00000419349 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.47■■■■■ 4.23
GPX1-201ENST00000419349 CD109Q6YHK3 1445 aa41.45■■■■■ 4.23
GPX1-201ENST00000419349 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
GPX1-201ENST00000419349 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.44■■■■■ 4.22
GPX1-201ENST00000419349 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.39■■■■■ 4.22
GPX1-201ENST00000419349 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.37■■■■■ 4.21
GPX1-201ENST00000419349 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
GPX1-201ENST00000419349 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
GPX1-201ENST00000419349 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.34■■■■■ 4.21
GPX1-201ENST00000419349 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
GPX1-201ENST00000419349 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
GPX1-201ENST00000419349 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.28■■■■■ 4.2
GPX1-201ENST00000419349 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.21■■■■■ 4.19
GPX1-201ENST00000419349 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.1■■■■■ 4.17
GPX1-201ENST00000419349 ADGRL1O94910 1474 aa41.05■■■■■ 4.16
GPX1-201ENST00000419349 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.04■■■■■ 4.16
GPX1-201ENST00000419349 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.02■■■■■ 4.16
GPX1-201ENST00000419349 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41■■■■■ 4.15
GPX1-201ENST00000419349 FMN1Q68DA7 1419 aa40.99■■■■■ 4.15
GPX1-201ENST00000419349 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
GPX1-201ENST00000419349 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
GPX1-201ENST00000419349 NEO1Q92859 1461 aa40.95■■■■■ 4.15
GPX1-201ENST00000419349 HECW1Q76N89 1606 aa40.89■■■■■ 4.14
GPX1-201ENST00000419349 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.87■■■■■ 4.13
GPX1-201ENST00000419349 RAPGEF3O95398 923 aa40.85■■■■■ 4.13
GPX1-201ENST00000419349 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.81■■■■■ 4.12
GPX1-201ENST00000419349 FANCAO15360 1455 aa40.76■■■■■ 4.12
GPX1-201ENST00000419349 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.75■■■■■ 4.11
GPX1-201ENST00000419349 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
GPX1-201ENST00000419349 AKNAQ7Z591 1439 aa40.73■■■■■ 4.11
GPX1-201ENST00000419349 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.73■■■■■ 4.11
GPX1-201ENST00000419349 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
GPX1-201ENST00000419349 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.66■■■■■ 4.1
GPX1-201ENST00000419349 RICTORQ6R327 1708 aa40.63■■■■■ 4.09
GPX1-201ENST00000419349 PLCH2O75038 1416 aa40.61■■■■■ 4.09
GPX1-201ENST00000419349 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
GPX1-201ENST00000419349 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
GPX1-201ENST00000419349 KIF14Q15058 1648 aa40.58■■■■■ 4.09
GPX1-201ENST00000419349 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.58■■■■■ 4.09
GPX1-201ENST00000419349 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.57■■■■■ 4.09
GPX1-201ENST00000419349 CLIP1P30622 1438 aa40.55■■■■■ 4.08
GPX1-201ENST00000419349 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.5■■■■■ 4.07
GPX1-201ENST00000419349 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.5■■■■■ 4.07
GPX1-201ENST00000419349 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
GPX1-201ENST00000419349 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.49■■■■■ 4.07
GPX1-201ENST00000419349 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.48■■■■■ 4.07
GPX1-201ENST00000419349 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.46■■■■■ 4.07
GPX1-201ENST00000419349 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.44■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms