RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418189.5

HDAC11-209, Transcript of histone deacetylase 11, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC11, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11-209ENST00000418189 CUL7Q14999 1698 aa43.08■■■■■ 4.49
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HDAC11-209ENST00000418189 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.78■■■■■ 4.44
HDAC11-209ENST00000418189 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.69■■■■■ 4.42
HDAC11-209ENST00000418189 MAPKBP1O60336 1514 aa42.63■■■■■ 4.42
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HDAC11-209ENST00000418189 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.15■■■■■ 4.34
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HDAC11-209ENST00000418189 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.65■■■■■ 4.26
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HDAC11-209ENST00000418189 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
HDAC11-209ENST00000418189 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.54■■■■■ 4.24
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HDAC11-209ENST00000418189 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
HDAC11-209ENST00000418189 P3H3Q8IVL6 736 aa41.46■■■■■ 4.23
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HDAC11-209ENST00000418189 CD109Q6YHK3 1445 aa41.44■■■■■ 4.22
HDAC11-209ENST00000418189 KCNH8Q96L42 1107 aa41.41■■■■■ 4.22
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HDAC11-209ENST00000418189 NEO1Q92859 1461 aa40.98■■■■■ 4.15
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HDAC11-209ENST00000418189 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.89■■■■■ 4.14
HDAC11-209ENST00000418189 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
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HDAC11-209ENST00000418189 RAPGEF3O95398 923 aa40.79■■■■■ 4.12
HDAC11-209ENST00000418189 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.78■■■■■ 4.12
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HDAC11-209ENST00000418189 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.71■■■■■ 4.11
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HDAC11-209ENST00000418189 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.45■■■■■ 4.07
HDAC11-209ENST00000418189 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
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HDAC11-209ENST00000418189 KIF14Q15058 1648 aa40.43■■■■■ 4.06
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HDAC11-209ENST00000418189 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
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