RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.11■■■□□ 2.25
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EEA1Q15075 1411 aa29.08■■■□□ 2.25
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.07■■■□□ 2.24
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHROOM2Q13796 1616 aa29.06■■■□□ 2.24
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JPH4Q96JJ6 628 aa29.03■■■□□ 2.24
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRXQ9BXM0 1461 aa29.02■■■□□ 2.24
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29■■■□□ 2.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.96■■■□□ 2.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IQGAP2Q13576 1575 aa28.91■■■□□ 2.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.78■■■□□ 2.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.77■■■□□ 2.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.75■■■□□ 2.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF21BO75037 1637 aa28.72■■■□□ 2.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DISP1Q96F81 1524 aa28.69■■■□□ 2.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.67■■■□□ 2.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPRGP23470 1445 aa28.65■■■□□ 2.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA0556O60303 1618 aa28.63■■■□□ 2.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLGA3Q08378 1498 aa28.63■■■□□ 2.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.57■■■□□ 2.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.54■■■□□ 2.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.5■■■□□ 2.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UACAQ9BZF9 1416 aa28.46■■■□□ 2.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SAMD9Q5K651 1589 aa28.44■■■□□ 2.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.43■■■□□ 2.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 P3H3Q8IVL6 736 aa28.41■■■□□ 2.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAPKBP1O60336 1514 aa28.41■■■□□ 2.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCC2Q92887 1545 aa28.4■■■□□ 2.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.4■■■□□ 2.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.37■■■□□ 2.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.34■■■□□ 2.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DIP2BQ9P265 1576 aa28.33■■■□□ 2.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.31■■■□□ 2.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCA8O94911 1581 aa28.3■■■□□ 2.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.29■■■□□ 2.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.28■■■□□ 2.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASXL2Q76L83 1435 aa28.2■■■□□ 2.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.2■■■□□ 2.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.16■■■□□ 2.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FMN1Q68DA7 1419 aa28.12■■■□□ 2.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARID3CA6NKF2 412 aa28.1■■■□□ 2.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLIP1P30622 1438 aa28.08■■■□□ 2.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP10BO94823 1461 aa28.08■■■□□ 2.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.08■■■□□ 2.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM6BO15054 1643 aa28.07■■■□□ 2.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPOAP1O95153 1857 aa28.06■■■□□ 2.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLI2P10070 1586 aa28■■■□□ 2.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.98■■■□□ 2.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEP162Q5TB80 1403 aa27.96■■■□□ 2.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HECW1Q76N89 1606 aa27.96■■■□□ 2.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.94■■■□□ 2.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNH8Q96L42 1107 aa27.93■■■□□ 2.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.88■■■□□ 2.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.87■■■□□ 2.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.85■■■□□ 2.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.83■■■□□ 2.04
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD109Q6YHK3 1445 aa27.8■■■□□ 2.04
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.8■■■□□ 2.04
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.78■■■□□ 2.04
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.78■■■□□ 2.04
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.74■■■□□ 2.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.74■■■□□ 2.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.68■■■□□ 2.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.65■■■□□ 2.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.63■■■□□ 2.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRL1O94910 1474 aa27.63■■■□□ 2.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF14Q15058 1648 aa27.62■■■□□ 2.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.6■■■□□ 2.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.56■■■□□ 2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEO1Q92859 1461 aa27.56■■■□□ 2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLCH2O75038 1416 aa27.51■■□□□ 1.99
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.51■■□□□ 1.99
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FANCAO15360 1455 aa27.51■■□□□ 1.99
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.49■■□□□ 1.99
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.48■■□□□ 1.99
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.45■■□□□ 1.98
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.44■■□□□ 1.98
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AKNAQ7Z591 1439 aa27.44■■□□□ 1.98
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIAM1Q13009 1591 aa27.43■■□□□ 1.98
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.41■■□□□ 1.98
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.41■■□□□ 1.98
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms