RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414510.5

PTPA-210, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPA, Length 1,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPA-210ENST00000414510 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.23■■■■■ 4.19
PTPA-210ENST00000414510 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
PTPA-210ENST00000414510 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.2■■■■■ 4.19
PTPA-210ENST00000414510 JPH4Q96JJ6 628 aa41.19■■■■■ 4.18
PTPA-210ENST00000414510 IQGAP2Q13576 1575 aa41.05■■■■■ 4.16
PTPA-210ENST00000414510 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.05■■■■■ 4.16
PTPA-210ENST00000414510 PRXQ9BXM0 1461 aa41.02■■■■■ 4.16
PTPA-210ENST00000414510 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.94■■■■■ 4.14
PTPA-210ENST00000414510 EEA1Q15075 1411 aa40.9■■■■■ 4.14
PTPA-210ENST00000414510 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.88■■■■■ 4.13
PTPA-210ENST00000414510 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
PTPA-210ENST00000414510 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.78■■■■■ 4.12
PTPA-210ENST00000414510 DISP1Q96F81 1524 aa40.77■■■■■ 4.12
PTPA-210ENST00000414510 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.76■■■■■ 4.11
PTPA-210ENST00000414510 KIAA0556O60303 1618 aa40.7■■■■■ 4.11
PTPA-210ENST00000414510 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.68■■■■■ 4.1
PTPA-210ENST00000414510 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.66■■■■■ 4.1
PTPA-210ENST00000414510 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PTPA-210ENST00000414510 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PTPA-210ENST00000414510 PTPRGP23470 1445 aa40.64■■■■■ 4.1
PTPA-210ENST00000414510 KIF21BO75037 1637 aa40.61■■■■■ 4.09
PTPA-210ENST00000414510 GOLGA3Q08378 1498 aa40.49■■■■■ 4.07
PTPA-210ENST00000414510 UACAQ9BZF9 1416 aa40.39■■■■■ 4.06
PTPA-210ENST00000414510 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.38■■■■■ 4.05
PTPA-210ENST00000414510 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.38■■■■■ 4.05
PTPA-210ENST00000414510 MAPKBP1O60336 1514 aa40.37■■■■■ 4.05
PTPA-210ENST00000414510 ABCC2Q92887 1545 aa40.37■■■■■ 4.05
PTPA-210ENST00000414510 SAMD9Q5K651 1589 aa40.36■■■■■ 4.05
PTPA-210ENST00000414510 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.36■■■■■ 4.05
PTPA-210ENST00000414510 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.34■■■■■ 4.05
PTPA-210ENST00000414510 P3H3Q8IVL6 736 aa40.29■■■■■ 4.04
PTPA-210ENST00000414510 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.28■■■■■ 4.04
PTPA-210ENST00000414510 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
PTPA-210ENST00000414510 ABCA8O94911 1581 aa40.23■■■■■ 4.03
PTPA-210ENST00000414510 DIP2BQ9P265 1576 aa40.21■■■■■ 4.03
PTPA-210ENST00000414510 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
PTPA-210ENST00000414510 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.19■■■■■ 4.03
PTPA-210ENST00000414510 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.19■■■■■ 4.02
PTPA-210ENST00000414510 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
PTPA-210ENST00000414510 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.12■■■■■ 4.01
PTPA-210ENST00000414510 ASXL2Q76L83 1435 aa40.11■■■■■ 4.01
PTPA-210ENST00000414510 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.09■■■■■ 4.01
PTPA-210ENST00000414510 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.08■■■■■ 4.01
PTPA-210ENST00000414510 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.01■■■■■ 4
PTPA-210ENST00000414510 TSPOAP1O95153 1857 aa39.93■■■■□ 3.98
PTPA-210ENST00000414510 ARID3CA6NKF2 412 aa39.92■■■■□ 3.98
PTPA-210ENST00000414510 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.91■■■■□ 3.98
PTPA-210ENST00000414510 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
PTPA-210ENST00000414510 GLI2P10070 1586 aa39.89■■■■□ 3.98
PTPA-210ENST00000414510 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.88■■■■□ 3.98
PTPA-210ENST00000414510 ATP10BO94823 1461 aa39.86■■■■□ 3.97
PTPA-210ENST00000414510 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
PTPA-210ENST00000414510 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
PTPA-210ENST00000414510 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.76■■■■□ 3.96
PTPA-210ENST00000414510 FMN1Q68DA7 1419 aa39.67■■■■□ 3.94
PTPA-210ENST00000414510 KCNH8Q96L42 1107 aa39.66■■■■□ 3.94
PTPA-210ENST00000414510 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
PTPA-210ENST00000414510 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
PTPA-210ENST00000414510 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.61■■■■□ 3.93
PTPA-210ENST00000414510 HECW1Q76N89 1606 aa39.61■■■■□ 3.93
PTPA-210ENST00000414510 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
PTPA-210ENST00000414510 KDM6BO15054 1643 aa39.59■■■■□ 3.93
PTPA-210ENST00000414510 CLIP1P30622 1438 aa39.58■■■■□ 3.93
PTPA-210ENST00000414510 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
PTPA-210ENST00000414510 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.51■■■■□ 3.91
PTPA-210ENST00000414510 CD109Q6YHK3 1445 aa39.5■■■■□ 3.91
PTPA-210ENST00000414510 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
PTPA-210ENST00000414510 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.49■■■■□ 3.91
PTPA-210ENST00000414510 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.49■■■■□ 3.91
PTPA-210ENST00000414510 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.44■■■■□ 3.9
PTPA-210ENST00000414510 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.4■■■■□ 3.9
PTPA-210ENST00000414510 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.4■■■■□ 3.9
PTPA-210ENST00000414510 CEP162Q5TB80 1403 aa39.4■■■■□ 3.9
PTPA-210ENST00000414510 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.38■■■■□ 3.89
PTPA-210ENST00000414510 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
PTPA-210ENST00000414510 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.3■■■■□ 3.88
PTPA-210ENST00000414510 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.3■■■■□ 3.88
PTPA-210ENST00000414510 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.3■■■■□ 3.88
PTPA-210ENST00000414510 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.24■■■■□ 3.87
PTPA-210ENST00000414510 KIF14Q15058 1648 aa39.22■■■■□ 3.87
PTPA-210ENST00000414510 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
PTPA-210ENST00000414510 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
PTPA-210ENST00000414510 NEO1Q92859 1461 aa39.11■■■■□ 3.85
PTPA-210ENST00000414510 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.09■■■■□ 3.85
PTPA-210ENST00000414510 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.07■■■■□ 3.85
PTPA-210ENST00000414510 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.04■■■■□ 3.84
PTPA-210ENST00000414510 FANCAO15360 1455 aa39.04■■■■□ 3.84
PTPA-210ENST00000414510 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.01■■■■□ 3.84
PTPA-210ENST00000414510 PLCH2O75038 1416 aa38.98■■■■□ 3.83
PTPA-210ENST00000414510 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.98■■■■□ 3.83
PTPA-210ENST00000414510 AKNAQ7Z591 1439 aa38.96■■■■□ 3.83
PTPA-210ENST00000414510 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.91■■■■□ 3.82
PTPA-210ENST00000414510 RAPGEF3O95398 923 aa38.9■■■■□ 3.82
PTPA-210ENST00000414510 RICTORQ6R327 1708 aa38.89■■■■□ 3.82
PTPA-210ENST00000414510 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.89■■■■□ 3.82
PTPA-210ENST00000414510 PREX2Q70Z35 1606 aa38.87■■■■□ 3.81
PTPA-210ENST00000414510 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.87■■■■□ 3.81
PTPA-210ENST00000414510 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.85■■■■□ 3.81
PTPA-210ENST00000414510 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
PTPA-210ENST00000414510 ADGRL1O94910 1474 aa38.84■■■■□ 3.81
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