RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 BCANQ96GW7 911 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 PRDM2Q13029 1718 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.27□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 SYNJ1O43426 1573 aa6.27□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 PLPPR3Q6T4P5 718 aa6.26□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.26□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.25□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCC8Q09428 1581 aa6.25□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNH8Q96L42 1107 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 CFTRP13569 1480 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF27Q86VH2 1401 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPY4P0CV99 314 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPY10P0CW01 314 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 KDM6BO15054 1643 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 EEA1Q15075 1411 aa6.17□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 TOP2BQ02880 1626 aa6.17□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 SOGA1O94964 1423 aa6.17□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.16□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 MAPKBP1O60336 1514 aa6.16□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.16□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 ADGRL1O94910 1474 aa6.15□□□□□ -1.42
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.15□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.15□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 NEUROD1Q13562 356 aa6.15□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 SYNJ2O15056 1496 aa6.14□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.14□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 TOPBP1Q92547 1522 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 DIP2BQ9P265 1576 aa6.12□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 CLIP1P30622 1438 aa6.12□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.11□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.11□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 SHROOM2Q13796 1616 aa6.1□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA3Q08378 1498 aa6.1□□□□□ -1.43
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 ILDR2Q71H61 639 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 JPH4Q96JJ6 628 aa6.07□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 WIZO95785 1651 aa6.06□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 GLI2P10070 1586 aa6.06□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.06□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 C14orf37Q86TY3 774 aa6.06□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 MLECQ14165 292 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 GRIN2BQ13224 1484 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 NEFMP07197 916 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 27.6
ANKRD28-202ENST00000412318 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP170Q5SW79 1584 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.02□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.02□□□□□ -1.44
ANKRD28-202ENST00000412318 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP162Q5TB80 1403 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 NCLP19338 710 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 TONSLQ96HA7 1378 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 PBRM1Q86U86 1689 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPRGP23470 1445 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 NUP160Q12769 1436 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 GGT6Q6P531 493 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 KANK1Q14678 1352 aa5.98□□□□□ -1.45
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