RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARAP1Q96P48 1450 aa14.52□□□□□ -0.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.52□□□□□ -0.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.51□□□□□ -0.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EEA1Q15075 1411 aa14.49□□□□□ -0.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.47□□□□□ -0.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IQGAP2Q13576 1575 aa14.43□□□□□ -0.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.42□□□□□ -0.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.41□□□□□ -0.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 JPH4Q96JJ6 628 aa14.41□□□□□ -0.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRXQ9BXM0 1461 aa14.41□□□□□ -0.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.39□□□□□ -0.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.38□□□□□ -0.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.37□□□□□ -0.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.35□□□□□ -0.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.32□□□□□ -0.12
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF21BO75037 1637 aa14.3□□□□□ -0.12
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GOLGA3Q08378 1498 aa14.3□□□□□ -0.12
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.28□□□□□ -0.12
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIAA0556O60303 1618 aa14.27□□□□□ -0.12
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DISP1Q96F81 1524 aa14.27□□□□□ -0.12
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTPRGP23470 1445 aa14.25□□□□□ -0.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.23□□□□□ -0.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAPKBP1O60336 1514 aa14.22□□□□□ -0.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.22□□□□□ -0.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SAMD9Q5K651 1589 aa14.18□□□□□ -0.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCC2Q92887 1545 aa14.18□□□□□ -0.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UACAQ9BZF9 1416 aa14.17□□□□□ -0.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.16□□□□□ -0.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.12□□□□□ -0.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCA8O94911 1581 aa14.11□□□□□ -0.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.11□□□□□ -0.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.11□□□□□ -0.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.11□□□□□ -0.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DIP2BQ9P265 1576 aa14.09□□□□□ -0.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GLI2P10070 1586 aa14.05□□□□□ -0.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ASXL2Q76L83 1435 aa14.04□□□□□ -0.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.04□□□□□ -0.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.01□□□□□ -0.17
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FMN1Q68DA7 1419 aa14□□□□□ -0.17
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FHOD3Q2V2M9 1422 aa13.99□□□□□ -0.17
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM69CQ0P6D2 419 aa13.98□□□□□ -0.17
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa13.97□□□□□ -0.17
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.96□□□□□ -0.17
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFAP43Q8NDM7 1665 aa13.95□□□□□ -0.18
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa13.95□□□□□ -0.18
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 P3H3Q8IVL6 736 aa13.95□□□□□ -0.18
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP10BO94823 1461 aa13.94□□□□□ -0.18
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HECW1Q76N89 1606 aa13.94□□□□□ -0.18
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEX14Q8IWB6 1497 aa13.93□□□□□ -0.18
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSPOAP1O95153 1857 aa13.9□□□□□ -0.18
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADRA2BP18089 450 aa13.89□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa13.89□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLIP1P30622 1438 aa13.89□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KDM6BO15054 1643 aa13.88□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.88□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC18Q5T9S5 1454 aa13.86□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FYCO1Q9BQS8 1478 aa13.86□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa13.85□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.85□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD109Q6YHK3 1445 aa13.84□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHLDB1Q86UU1 1377 aa13.83□□□□□ -0.19
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.83□□□□□ -0.2
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.81□□□□□ -0.2
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CEP162Q5TB80 1403 aa13.81□□□□□ -0.2
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNH8Q96L42 1107 aa13.79□□□□□ -0.2
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NEO1Q92859 1461 aa13.79□□□□□ -0.2
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF14Q15058 1648 aa13.78□□□□□ -0.2
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARID3CA6NKF2 412 aa13.77□□□□□ -0.21
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.77□□□□□ -0.21
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa13.77□□□□□ -0.21
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.75□□□□□ -0.21
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.74□□□□□ -0.21
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.73□□□□□ -0.21
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MSH5O43196 834 aa13.7□□□□□ -0.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FANCAO15360 1455 aa13.69□□□□□ -0.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLCH2O75038 1416 aa13.69□□□□□ -0.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.68□□□□□ -0.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.67□□□□□ -0.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PREX2Q70Z35 1606 aa13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms