RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405675.7

CSNK1E-205, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 2,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-205ENST00000405675 ARAP1Q96P48 1450 aa44.96■■■■■ 4.79
CSNK1E-205ENST00000405675 ADAMTS12P58397 1594 aa44.95■■■■■ 4.79
CSNK1E-205ENST00000405675 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.9■■■■■ 4.78
CSNK1E-205ENST00000405675 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.82■■■■■ 4.77
CSNK1E-205ENST00000405675 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.75■■■■■ 4.75
CSNK1E-205ENST00000405675 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.75
CSNK1E-205ENST00000405675 APLP2Q06481 763 aa44.64■■■■■ 4.74
CSNK1E-205ENST00000405675 SYNJ2O15056 1496 aa44.61■■■■■ 4.73
CSNK1E-205ENST00000405675 GRIN2AQ12879 1464 aa44.6■■■■■ 4.73
CSNK1E-205ENST00000405675 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
CSNK1E-205ENST00000405675 FBLN2P98095 1184 aa44.55■■■■■ 4.72
CSNK1E-205ENST00000405675 P3H3Q8IVL6 736 aa44.49■■■■■ 4.71
CSNK1E-205ENST00000405675 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.42■■■■■ 4.7
CSNK1E-205ENST00000405675 IQGAP2Q13576 1575 aa44.41■■■■■ 4.7
CSNK1E-205ENST00000405675 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.35■■■■■ 4.69
CSNK1E-205ENST00000405675 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.35■■■■■ 4.69
CSNK1E-205ENST00000405675 CEP170Q5SW79 1584 aa44.34■■■■■ 4.69
CSNK1E-205ENST00000405675 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
CSNK1E-205ENST00000405675 SAMD9Q5K651 1589 aa44.31■■■■■ 4.68
CSNK1E-205ENST00000405675 NUP160Q12769 1436 aa44.27■■■■■ 4.68
CSNK1E-205ENST00000405675 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.19■■■■■ 4.66
CSNK1E-205ENST00000405675 CHD1O14646 1710 aa44.17■■■■■ 4.66
CSNK1E-205ENST00000405675 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
CSNK1E-205ENST00000405675 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
CSNK1E-205ENST00000405675 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
CSNK1E-205ENST00000405675 TIAM1Q13009 1591 aa44.09■■■■■ 4.65
CSNK1E-205ENST00000405675 MAP3K1Q13233 1512 aa44.07■■■■■ 4.65
CSNK1E-205ENST00000405675 FMN1Q68DA7 1419 aa44.06■■■■■ 4.64
CSNK1E-205ENST00000405675 DISP1Q96F81 1524 aa44.03■■■■■ 4.64
CSNK1E-205ENST00000405675 JPH4Q96JJ6 628 aa44.02■■■■■ 4.64
CSNK1E-205ENST00000405675 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
CSNK1E-205ENST00000405675 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
CSNK1E-205ENST00000405675 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.97■■■■■ 4.63
CSNK1E-205ENST00000405675 KIAA0556O60303 1618 aa43.97■■■■■ 4.63
CSNK1E-205ENST00000405675 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.96■■■■■ 4.63
CSNK1E-205ENST00000405675 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
CSNK1E-205ENST00000405675 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.91■■■■■ 4.62
CSNK1E-205ENST00000405675 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.9■■■■■ 4.62
CSNK1E-205ENST00000405675 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
CSNK1E-205ENST00000405675 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.8■■■■■ 4.6
CSNK1E-205ENST00000405675 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
CSNK1E-205ENST00000405675 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.69■■■■■ 4.58
CSNK1E-205ENST00000405675 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.66■■■■■ 4.58
CSNK1E-205ENST00000405675 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.65■■■■■ 4.58
CSNK1E-205ENST00000405675 SHROOM2Q13796 1616 aa43.65■■■■■ 4.58
CSNK1E-205ENST00000405675 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.63■■■■■ 4.57
CSNK1E-205ENST00000405675 HECW1Q76N89 1606 aa43.6■■■■■ 4.57
CSNK1E-205ENST00000405675 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.51■■■■■ 4.56
CSNK1E-205ENST00000405675 ARID3CA6NKF2 412 aa43.51■■■■■ 4.56
CSNK1E-205ENST00000405675 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.5■■■■■ 4.55
CSNK1E-205ENST00000405675 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
CSNK1E-205ENST00000405675 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.49■■■■■ 4.55
CSNK1E-205ENST00000405675 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.48■■■■■ 4.55
CSNK1E-205ENST00000405675 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
CSNK1E-205ENST00000405675 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
CSNK1E-205ENST00000405675 PTPRGP23470 1445 aa43.43■■■■■ 4.54
CSNK1E-205ENST00000405675 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.42■■■■■ 4.54
CSNK1E-205ENST00000405675 OSCARQ8IYS5 282 aa43.4■■■■■ 4.54
CSNK1E-205ENST00000405675 ITGAEP38570 1179 aa43.37■■■■■ 4.53
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCA8O94911 1581 aa43.35■■■■■ 4.53
CSNK1E-205ENST00000405675 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.34■■■■■ 4.53
CSNK1E-205ENST00000405675 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
CSNK1E-205ENST00000405675 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.28■■■■■ 4.52
CSNK1E-205ENST00000405675 NCOA2Q15596 1464 aa43.24■■■■■ 4.51
CSNK1E-205ENST00000405675 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.19■■■■■ 4.5
CSNK1E-205ENST00000405675 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
CSNK1E-205ENST00000405675 UACAQ9BZF9 1416 aa43.16■■■■■ 4.5
CSNK1E-205ENST00000405675 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.5
CSNK1E-205ENST00000405675 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.13■■■■■ 4.5
CSNK1E-205ENST00000405675 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
CSNK1E-205ENST00000405675 ARHGEF11O15085 1522 aa43.12■■■■■ 4.49
CSNK1E-205ENST00000405675 ATP10BO94823 1461 aa43.11■■■■■ 4.49
CSNK1E-205ENST00000405675 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.09■■■■■ 4.49
CSNK1E-205ENST00000405675 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.02■■■■■ 4.48
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCC2Q92887 1545 aa43■■■■■ 4.47
CSNK1E-205ENST00000405675 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
CSNK1E-205ENST00000405675 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.98■■■■■ 4.47
CSNK1E-205ENST00000405675 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.94■■■■■ 4.46
CSNK1E-205ENST00000405675 CLSPNQ9HAW4 1339 aa42.9■■■■■ 4.46
CSNK1E-205ENST00000405675 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.88■■■■■ 4.46
CSNK1E-205ENST00000405675 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.88■■■■■ 4.45
CSNK1E-205ENST00000405675 PTPRKQ15262 1439 aa42.86■■■■■ 4.45
CSNK1E-205ENST00000405675 KIF14Q15058 1648 aa42.82■■■■■ 4.44
CSNK1E-205ENST00000405675 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
CSNK1E-205ENST00000405675 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.79■■■■■ 4.44
CSNK1E-205ENST00000405675 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.74■■■■■ 4.43
CSNK1E-205ENST00000405675 MIA2Q96PC5 1412 aa42.72■■■■■ 4.43
CSNK1E-205ENST00000405675 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
CSNK1E-205ENST00000405675 MAPKBP1O60336 1514 aa42.64■■■■■ 4.42
CSNK1E-205ENST00000405675 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.42
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.63■■■■■ 4.42
CSNK1E-205ENST00000405675 HFM1A2PYH4 1435 aa42.63■■■■■ 4.41
CSNK1E-205ENST00000405675 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
CSNK1E-205ENST00000405675 NAIPQ13075 1403 aa42.55■■■■■ 4.4
CSNK1E-205ENST00000405675 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
CSNK1E-205ENST00000405675 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.54■■■■■ 4.4
CSNK1E-205ENST00000405675 KCNH8Q96L42 1107 aa42.53■■■■■ 4.4
CSNK1E-205ENST00000405675 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.49■■■■■ 4.39
CSNK1E-205ENST00000405675 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.47■■■■■ 4.39
CSNK1E-205ENST00000405675 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms