RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399469.2

HIVEP1-202, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene HIVEP1, Length 2,085 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-202ENST00000399469 GRIN2AQ12879 1464 aa11.87□□□□□ -0.51
HIVEP1-202ENST00000399469 CLIP1P30622 1438 aa11.87□□□□□ -0.51
HIVEP1-202ENST00000399469 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 CHD1O14646 1710 aa11.83□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 IQGAP2Q13576 1575 aa11.82□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.82□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 MYT1Q01538 1121 aa11.8□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.8□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 NUP160Q12769 1436 aa11.79□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 CEP170Q5SW79 1584 aa11.79□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.78□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 SAMD9Q5K651 1589 aa11.77□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 FBLN2P98095 1184 aa11.77□□□□□ -0.52
HIVEP1-202ENST00000399469 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HIVEP1-202ENST00000399469 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.76□□□□□ -0.53
HIVEP1-202ENST00000399469 ARAP1Q96P48 1450 aa11.76□□□□□ -0.53
HIVEP1-202ENST00000399469 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.75□□□□□ -0.53
HIVEP1-202ENST00000399469 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.75□□□□□ -0.53
HIVEP1-202ENST00000399469 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HIVEP1-202ENST00000399469 KIAA0556O60303 1618 aa11.7□□□□□ -0.54
HIVEP1-202ENST00000399469 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HIVEP1-202ENST00000399469 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.69□□□□□ -0.54
HIVEP1-202ENST00000399469 FMN1Q68DA7 1419 aa11.69□□□□□ -0.54
HIVEP1-202ENST00000399469 SHROOM2Q13796 1616 aa11.68□□□□□ -0.54
HIVEP1-202ENST00000399469 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.67□□□□□ -0.54
HIVEP1-202ENST00000399469 DISP1Q96F81 1524 aa11.67□□□□□ -0.54
HIVEP1-202ENST00000399469 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.67□□□□□ -0.54
HIVEP1-202ENST00000399469 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HIVEP1-202ENST00000399469 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.65□□□□□ -0.54
HIVEP1-202ENST00000399469 APLP2Q06481 763 aa11.64□□□□□ -0.55
HIVEP1-202ENST00000399469 JPH4Q96JJ6 628 aa11.64□□□□□ -0.55
HIVEP1-202ENST00000399469 P3H3Q8IVL6 736 aa11.64□□□□□ -0.55
HIVEP1-202ENST00000399469 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.63□□□□□ -0.55
HIVEP1-202ENST00000399469 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HIVEP1-202ENST00000399469 MAP3K1Q13233 1512 aa11.61□□□□□ -0.55
HIVEP1-202ENST00000399469 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HIVEP1-202ENST00000399469 HECW1Q76N89 1606 aa11.6□□□□□ -0.55
HIVEP1-202ENST00000399469 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.6□□□□□ -0.55
HIVEP1-202ENST00000399469 TIAM1Q13009 1591 aa11.58□□□□□ -0.55
HIVEP1-202ENST00000399469 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
HIVEP1-202ENST00000399469 OSCARQ8IYS5 282 aa11.58□□□□□ -0.56
HIVEP1-202ENST00000399469 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.57□□□□□ -0.56
HIVEP1-202ENST00000399469 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.56□□□□□ -0.56
HIVEP1-202ENST00000399469 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.55□□□□□ -0.56
HIVEP1-202ENST00000399469 PTPRGP23470 1445 aa11.52□□□□□ -0.56
HIVEP1-202ENST00000399469 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 ABCA8O94911 1581 aa11.52□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.52□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.51□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.5□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.49□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.48□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 UACAQ9BZF9 1416 aa11.47□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 ABCC2Q92887 1545 aa11.47□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HIVEP1-202ENST00000399469 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.46□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.45□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.42□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 ARHGEF11O15085 1522 aa11.42□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.41□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 PCGF6Q9BYE7 350 aa11.4□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 ATP10BO94823 1461 aa11.4□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.4□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
HIVEP1-202ENST00000399469 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 NCOA2Q15596 1464 aa11.39□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 ARID3CA6NKF2 412 aa11.39□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.38□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa11.37□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa11.37□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 KIF14Q15058 1648 aa11.37□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.37□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.36□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.36□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.36□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.35□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.34□□□□□ -0.59
HIVEP1-202ENST00000399469 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.33□□□□□ -0.6
HIVEP1-202ENST00000399469 POTEDQ86YR6 584 aa11.31□□□□□ -0.6
HIVEP1-202ENST00000399469 ARXQ96QS3 562 aa11.31□□□□□ -0.6
HIVEP1-202ENST00000399469 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
HIVEP1-202ENST00000399469 MIA2Q96PC5 1412 aa11.31□□□□□ -0.6
HIVEP1-202ENST00000399469 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.3□□□□□ -0.6
HIVEP1-202ENST00000399469 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.3□□□□□ -0.6
HIVEP1-202ENST00000399469 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.29□□□□□ -0.6
HIVEP1-202ENST00000399469 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
HIVEP1-202ENST00000399469 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms