RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397620.6

MEIS2-204, Transcript of Meis homeobox 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MEIS2, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS2-204ENST00000397620 P3H3Q8IVL6 736 aa36.09■■■■□ 3.37
MEIS2-204ENST00000397620 MAP3K1Q13233 1512 aa36.07■■■■□ 3.36
MEIS2-204ENST00000397620 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
MEIS2-204ENST00000397620 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.04■■■■□ 3.36
MEIS2-204ENST00000397620 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.04■■■■□ 3.36
MEIS2-204ENST00000397620 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.03■■■■□ 3.36
MEIS2-204ENST00000397620 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.98■■■■□ 3.35
MEIS2-204ENST00000397620 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.98■■■■□ 3.35
MEIS2-204ENST00000397620 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.94■■■■□ 3.34
MEIS2-204ENST00000397620 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.93■■■■□ 3.34
MEIS2-204ENST00000397620 PBRM1Q86U86 1689 aa35.92■■■■□ 3.34
MEIS2-204ENST00000397620 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.86■■■■□ 3.33
MEIS2-204ENST00000397620 SAMD9Q5K651 1589 aa35.84■■■■□ 3.33
MEIS2-204ENST00000397620 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.83■■■■□ 3.33
MEIS2-204ENST00000397620 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.82■■■■□ 3.324e-8■■■■□ 22.5
MEIS2-204ENST00000397620 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
MEIS2-204ENST00000397620 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.76■■■■□ 3.32
MEIS2-204ENST00000397620 WDR62O43379 1518 aa35.75■■■■□ 3.31
MEIS2-204ENST00000397620 FMN1Q68DA7 1419 aa35.74■■■■□ 3.31
MEIS2-204ENST00000397620 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.74■■■■□ 3.31
MEIS2-204ENST00000397620 ADAMTS12P58397 1594 aa35.73■■■■□ 3.31
MEIS2-204ENST00000397620 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
MEIS2-204ENST00000397620 ITGAEP38570 1179 aa35.69■■■■□ 3.3
MEIS2-204ENST00000397620 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
MEIS2-204ENST00000397620 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.66■■■■□ 3.3
MEIS2-204ENST00000397620 IFT140Q96RY7 1462 aa35.66■■■■□ 3.3
MEIS2-204ENST00000397620 GRIN2BQ13224 1484 aa35.65■■■■□ 3.3
MEIS2-204ENST00000397620 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.56■■■■□ 3.28
MEIS2-204ENST00000397620 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
MEIS2-204ENST00000397620 IQGAP2Q13576 1575 aa35.55■■■■□ 3.28
MEIS2-204ENST00000397620 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
MEIS2-204ENST00000397620 ERCC6Q03468 1493 aa35.53■■■■□ 3.28
MEIS2-204ENST00000397620 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
MEIS2-204ENST00000397620 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
MEIS2-204ENST00000397620 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
MEIS2-204ENST00000397620 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.47■■■■□ 3.27
MEIS2-204ENST00000397620 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.43■■■■□ 3.26
MEIS2-204ENST00000397620 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.38■■■■□ 3.25
MEIS2-204ENST00000397620 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.35■■■■□ 3.25
MEIS2-204ENST00000397620 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.34■■■■□ 3.25
MEIS2-204ENST00000397620 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.33■■■■□ 3.25
MEIS2-204ENST00000397620 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.31■■■■□ 3.24
MEIS2-204ENST00000397620 NCOA2Q15596 1464 aa35.31■■■■□ 3.24
MEIS2-204ENST00000397620 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.31■■■■□ 3.24
MEIS2-204ENST00000397620 HECW1Q76N89 1606 aa35.31■■■■□ 3.24
MEIS2-204ENST00000397620 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
MEIS2-204ENST00000397620 GRIN2AQ12879 1464 aa35.29■■■■□ 3.24
MEIS2-204ENST00000397620 MAPKBP1O60336 1514 aa35.28■■■■□ 3.24
MEIS2-204ENST00000397620 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.27■■■■□ 3.24
MEIS2-204ENST00000397620 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.26■■■■□ 3.24
MEIS2-204ENST00000397620 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.21■■■■□ 3.23
MEIS2-204ENST00000397620 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
MEIS2-204ENST00000397620 KIAA0556O60303 1618 aa35.2■■■■□ 3.23
MEIS2-204ENST00000397620 DISP1Q96F81 1524 aa35.19■■■■□ 3.22
MEIS2-204ENST00000397620 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
MEIS2-204ENST00000397620 ARHGEF11O15085 1522 aa35.18■■■■□ 3.22
MEIS2-204ENST00000397620 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
MEIS2-204ENST00000397620 PTPRKQ15262 1439 aa35.13■■■■□ 3.21
MEIS2-204ENST00000397620 CEP170Q5SW79 1584 aa35.11■■■■□ 3.21
MEIS2-204ENST00000397620 SYNJ2O15056 1496 aa35.1■■■■□ 3.21
MEIS2-204ENST00000397620 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.1■■■■□ 3.21
MEIS2-204ENST00000397620 ARID3CA6NKF2 412 aa35.07■■■■□ 3.2
MEIS2-204ENST00000397620 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
MEIS2-204ENST00000397620 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.98■■■■□ 3.19
MEIS2-204ENST00000397620 HFM1A2PYH4 1435 aa34.98■■■■□ 3.19
MEIS2-204ENST00000397620 FBLN2P98095 1184 aa34.97■■■■□ 3.19
MEIS2-204ENST00000397620 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
MEIS2-204ENST00000397620 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
MEIS2-204ENST00000397620 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.93■■■■□ 3.18
MEIS2-204ENST00000397620 NUP160Q12769 1436 aa34.92■■■■□ 3.18
MEIS2-204ENST00000397620 NAIPQ13075 1403 aa34.91■■■■□ 3.18
MEIS2-204ENST00000397620 MIER1Q8N108 512 aa34.9■■■■□ 3.18
MEIS2-204ENST00000397620 NEUROD1Q13562 356 aa34.84■■■■□ 3.17
MEIS2-204ENST00000397620 MIA2Q96PC5 1412 aa34.84■■■■□ 3.17
MEIS2-204ENST00000397620 UACAQ9BZF9 1416 aa34.8■■■■□ 3.16
MEIS2-204ENST00000397620 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.8■■■■□ 3.16
MEIS2-204ENST00000397620 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
MEIS2-204ENST00000397620 JPH4Q96JJ6 628 aa34.78■■■■□ 3.16
MEIS2-204ENST00000397620 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.77■■■■□ 3.16
MEIS2-204ENST00000397620 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
MEIS2-204ENST00000397620 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.75■■■■□ 3.15
MEIS2-204ENST00000397620 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.75■■■■□ 3.15
MEIS2-204ENST00000397620 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.73■■■■□ 3.15
MEIS2-204ENST00000397620 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
MEIS2-204ENST00000397620 KDM6BO15054 1643 aa34.68■■■■□ 3.14
MEIS2-204ENST00000397620 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
MEIS2-204ENST00000397620 AKNAQ7Z591 1439 aa34.67■■■■□ 3.14
MEIS2-204ENST00000397620 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
MEIS2-204ENST00000397620 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.65■■■■□ 3.14
MEIS2-204ENST00000397620 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
MEIS2-204ENST00000397620 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
MEIS2-204ENST00000397620 KIF14Q15058 1648 aa34.6■■■■□ 3.13
MEIS2-204ENST00000397620 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
MEIS2-204ENST00000397620 DAPK1P53355 1430 aa34.59■■■■□ 3.13
MEIS2-204ENST00000397620 ABCA8O94911 1581 aa34.59■■■■□ 3.13
MEIS2-204ENST00000397620 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
MEIS2-204ENST00000397620 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.58■■■■□ 3.13
MEIS2-204ENST00000397620 CHD1O14646 1710 aa34.57■■■■□ 3.12
MEIS2-204ENST00000397620 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
MEIS2-204ENST00000397620 ABCC5O15440 1437 aa34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms