RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 ARAP1Q96P48 1450 aa46.21■■■■■ 4.99
LMO2-202ENST00000395833 SYNJ2O15056 1496 aa46.05■■■■■ 4.96
LMO2-202ENST00000395833 GRIN2AQ12879 1464 aa46.05■■■■■ 4.96
LMO2-202ENST00000395833 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
LMO2-202ENST00000395833 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.99■■■■■ 4.95
LMO2-202ENST00000395833 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.99■■■■■ 4.95
LMO2-202ENST00000395833 FBLN2P98095 1184 aa45.91■■■■■ 4.94
LMO2-202ENST00000395833 IQGAP2Q13576 1575 aa45.91■■■■■ 4.94
LMO2-202ENST00000395833 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.9■■■■■ 4.94
LMO2-202ENST00000395833 P3H3Q8IVL6 736 aa45.88■■■■■ 4.94
LMO2-202ENST00000395833 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.88■■■■■ 4.94
LMO2-202ENST00000395833 APLP2Q06481 763 aa45.85■■■■■ 4.93
LMO2-202ENST00000395833 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.82■■■■■ 4.93
LMO2-202ENST00000395833 SAMD9Q5K651 1589 aa45.81■■■■■ 4.92
LMO2-202ENST00000395833 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.8■■■■■ 4.92
LMO2-202ENST00000395833 CEP170Q5SW79 1584 aa45.75■■■■■ 4.91
LMO2-202ENST00000395833 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
LMO2-202ENST00000395833 NUP160Q12769 1436 aa45.69■■■■■ 4.9
LMO2-202ENST00000395833 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.66■■■■■ 4.9
LMO2-202ENST00000395833 CHD1O14646 1710 aa45.59■■■■■ 4.89
LMO2-202ENST00000395833 FMN1Q68DA7 1419 aa45.58■■■■■ 4.89
LMO2-202ENST00000395833 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
LMO2-202ENST00000395833 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.48■■■■■ 4.87
LMO2-202ENST00000395833 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.47■■■■■ 4.87
LMO2-202ENST00000395833 KIAA0556O60303 1618 aa45.44■■■■■ 4.87
LMO2-202ENST00000395833 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.44■■■■■ 4.86
LMO2-202ENST00000395833 DISP1Q96F81 1524 aa45.43■■■■■ 4.86
LMO2-202ENST00000395833 MAP3K1Q13233 1512 aa45.38■■■■■ 4.86
LMO2-202ENST00000395833 TIAM1Q13009 1591 aa45.38■■■■■ 4.85
LMO2-202ENST00000395833 JPH4Q96JJ6 628 aa45.36■■■■■ 4.85
LMO2-202ENST00000395833 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
LMO2-202ENST00000395833 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.3■■■■■ 4.84
LMO2-202ENST00000395833 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.28■■■■■ 4.84
LMO2-202ENST00000395833 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa45.16■■■■■ 4.82
LMO2-202ENST00000395833 HECW1Q76N89 1606 aa45.15■■■■■ 4.82
LMO2-202ENST00000395833 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.1■■■■■ 4.81
LMO2-202ENST00000395833 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.09■■■■■ 4.81
LMO2-202ENST00000395833 SHROOM2Q13796 1616 aa45.06■■■■■ 4.8
LMO2-202ENST00000395833 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.04■■■■■ 4.8
LMO2-202ENST00000395833 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.04■■■■■ 4.8
LMO2-202ENST00000395833 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45■■■■■ 4.79
LMO2-202ENST00000395833 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
LMO2-202ENST00000395833 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.92■■■■■ 4.78
LMO2-202ENST00000395833 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.87■■■■■ 4.77
LMO2-202ENST00000395833 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
LMO2-202ENST00000395833 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
LMO2-202ENST00000395833 ARID3CA6NKF2 412 aa44.85■■■■■ 4.77
LMO2-202ENST00000395833 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.82■■■■■ 4.77
LMO2-202ENST00000395833 PTPRGP23470 1445 aa44.82■■■■■ 4.77
LMO2-202ENST00000395833 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
LMO2-202ENST00000395833 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.78■■■■■ 4.76
LMO2-202ENST00000395833 ABCA8O94911 1581 aa44.77■■■■■ 4.76
LMO2-202ENST00000395833 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.75■■■■■ 4.75
LMO2-202ENST00000395833 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.74■■■■■ 4.75
LMO2-202ENST00000395833 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.7■■■■■ 4.75
LMO2-202ENST00000395833 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.74
LMO2-202ENST00000395833 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
LMO2-202ENST00000395833 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
LMO2-202ENST00000395833 OSCARQ8IYS5 282 aa44.66■■■■■ 4.74
LMO2-202ENST00000395833 NCOA2Q15596 1464 aa44.64■■■■■ 4.74
LMO2-202ENST00000395833 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.59■■■■■ 4.73
LMO2-202ENST00000395833 UACAQ9BZF9 1416 aa44.56■■■■■ 4.72
LMO2-202ENST00000395833 ARHGEF11O15085 1522 aa44.5■■■■■ 4.71
LMO2-202ENST00000395833 ATP10BO94823 1461 aa44.48■■■■■ 4.71
LMO2-202ENST00000395833 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.45■■■■■ 4.71
LMO2-202ENST00000395833 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.45■■■■■ 4.71
LMO2-202ENST00000395833 HRCP23327 699 aa44.45■■■■■ 4.71
LMO2-202ENST00000395833 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
LMO2-202ENST00000395833 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.7
LMO2-202ENST00000395833 ABCC2Q92887 1545 aa44.41■■■■■ 4.7
LMO2-202ENST00000395833 ITGAEP38570 1179 aa44.35■■■■■ 4.69
LMO2-202ENST00000395833 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.33■■■■■ 4.69
LMO2-202ENST00000395833 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP44.32■■■■■ 4.691e-6■■■■■ 32.9
LMO2-202ENST00000395833 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.29■■■■■ 4.68
LMO2-202ENST00000395833 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.28■■■■■ 4.68
LMO2-202ENST00000395833 KIF14Q15058 1648 aa44.23■■■■■ 4.67
LMO2-202ENST00000395833 PTPN23Q9H3S7 1636 aa44.23■■■■■ 4.67
LMO2-202ENST00000395833 MIA2Q96PC5 1412 aa44.19■■■■■ 4.66
LMO2-202ENST00000395833 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
LMO2-202ENST00000395833 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
LMO2-202ENST00000395833 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
LMO2-202ENST00000395833 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.1■■■■■ 4.65
LMO2-202ENST00000395833 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.08■■■■■ 4.65
LMO2-202ENST00000395833 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.03■■■■■ 4.64
LMO2-202ENST00000395833 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
LMO2-202ENST00000395833 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
LMO2-202ENST00000395833 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
LMO2-202ENST00000395833 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.92■■■■■ 4.62
LMO2-202ENST00000395833 PTPRKQ15262 1439 aa43.9■■■■■ 4.62
LMO2-202ENST00000395833 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.89■■■■■ 4.62
LMO2-202ENST00000395833 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.86■■■■■ 4.61
LMO2-202ENST00000395833 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.85■■■■■ 4.61
LMO2-202ENST00000395833 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.84■■■■■ 4.61
LMO2-202ENST00000395833 KCNH8Q96L42 1107 aa43.83■■■■■ 4.61
LMO2-202ENST00000395833 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.61
LMO2-202ENST00000395833 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.81■■■■■ 4.6
LMO2-202ENST00000395833 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.8■■■■■ 4.6
LMO2-202ENST00000395833 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
LMO2-202ENST00000395833 PREX2Q70Z35 1606 aa43.76■■■■■ 4.6
LMO2-202ENST00000395833 DAPK1P53355 1430 aa43.75■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms