RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395067.6

MSANTD3-203, Transcript of Myb/SANT DNA binding domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSANTD3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3-203ENST00000395067 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.21■■■■■ 5.47
MSANTD3-203ENST00000395067 JPH4Q96JJ6 628 aa49.15■■■■■ 5.46
MSANTD3-203ENST00000395067 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.09■■■■■ 5.45
MSANTD3-203ENST00000395067 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.07■■■■■ 5.45
MSANTD3-203ENST00000395067 IQGAP2Q13576 1575 aa48.77■■■■■ 5.4
MSANTD3-203ENST00000395067 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.74■■■■■ 5.39
MSANTD3-203ENST00000395067 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.7■■■■■ 5.39
MSANTD3-203ENST00000395067 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.63■■■■■ 5.37
MSANTD3-203ENST00000395067 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.52■■■■■ 5.36
MSANTD3-203ENST00000395067 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.5■■■■■ 5.35
MSANTD3-203ENST00000395067 DISP1Q96F81 1524 aa48.49■■■■■ 5.35
MSANTD3-203ENST00000395067 PTPRGP23470 1445 aa48.46■■■■■ 5.35
MSANTD3-203ENST00000395067 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.45■■■■■ 5.35
MSANTD3-203ENST00000395067 MAPKBP1O60336 1514 aa48.45■■■■■ 5.35
MSANTD3-203ENST00000395067 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.44■■■■■ 5.35
MSANTD3-203ENST00000395067 PRXQ9BXM0 1461 aa48.42■■■■■ 5.34
MSANTD3-203ENST00000395067 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.41■■■■■ 5.34
MSANTD3-203ENST00000395067 KIAA0556O60303 1618 aa48.36■■■■■ 5.33
MSANTD3-203ENST00000395067 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.34■■■■■ 5.33
MSANTD3-203ENST00000395067 DIP2BQ9P265 1576 aa48.31■■■■■ 5.32
MSANTD3-203ENST00000395067 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.3■■■■■ 5.32
MSANTD3-203ENST00000395067 ABCC2Q92887 1545 aa48.21■■■■■ 5.31
MSANTD3-203ENST00000395067 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.16■■■■■ 5.3
MSANTD3-203ENST00000395067 UACAQ9BZF9 1416 aa48.15■■■■■ 5.3
MSANTD3-203ENST00000395067 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.14■■■■■ 5.3
MSANTD3-203ENST00000395067 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.07■■■■■ 5.29
MSANTD3-203ENST00000395067 TSPOAP1O95153 1857 aa48.03■■■■■ 5.28
MSANTD3-203ENST00000395067 GOLGA3Q08378 1498 aa48.01■■■■■ 5.28
MSANTD3-203ENST00000395067 EEA1Q15075 1411 aa48■■■■■ 5.27
MSANTD3-203ENST00000395067 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.98■■■■■ 5.27
MSANTD3-203ENST00000395067 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.97■■■■■ 5.27
MSANTD3-203ENST00000395067 ASXL2Q76L83 1435 aa47.97■■■■■ 5.27
MSANTD3-203ENST00000395067 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.92■■■■■ 5.26
MSANTD3-203ENST00000395067 ABCA8O94911 1581 aa47.85■■■■■ 5.25
MSANTD3-203ENST00000395067 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.84■■■■■ 5.25
MSANTD3-203ENST00000395067 GLI2P10070 1586 aa47.81■■■■■ 5.24
MSANTD3-203ENST00000395067 SAMD9Q5K651 1589 aa47.79■■■■■ 5.24
MSANTD3-203ENST00000395067 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
MSANTD3-203ENST00000395067 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.75■■■■■ 5.23
MSANTD3-203ENST00000395067 KIF21BO75037 1637 aa47.73■■■■■ 5.23
MSANTD3-203ENST00000395067 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
MSANTD3-203ENST00000395067 KDM6BO15054 1643 aa47.71■■■■■ 5.23
MSANTD3-203ENST00000395067 P3H3Q8IVL6 736 aa47.68■■■■■ 5.22
MSANTD3-203ENST00000395067 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.65■■■■■ 5.22
MSANTD3-203ENST00000395067 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.61■■■■■ 5.21
MSANTD3-203ENST00000395067 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.48■■■■■ 5.19
MSANTD3-203ENST00000395067 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.47■■■■■ 5.19
MSANTD3-203ENST00000395067 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.42■■■■■ 5.18
MSANTD3-203ENST00000395067 ARID3CA6NKF2 412 aa47.4■■■■■ 5.18
MSANTD3-203ENST00000395067 ATP10BO94823 1461 aa47.4■■■■■ 5.18
MSANTD3-203ENST00000395067 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.38■■■■■ 5.17
MSANTD3-203ENST00000395067 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.33■■■■■ 5.17
MSANTD3-203ENST00000395067 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.33■■■■■ 5.17
MSANTD3-203ENST00000395067 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.32■■■■■ 5.16
MSANTD3-203ENST00000395067 KCNH8Q96L42 1107 aa47.29■■■■■ 5.16
MSANTD3-203ENST00000395067 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.28■■■■■ 5.16
MSANTD3-203ENST00000395067 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
MSANTD3-203ENST00000395067 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.24■■■■■ 5.15
MSANTD3-203ENST00000395067 CD109Q6YHK3 1445 aa47.21■■■■■ 5.15
MSANTD3-203ENST00000395067 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.18■■■■■ 5.14
MSANTD3-203ENST00000395067 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
MSANTD3-203ENST00000395067 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.11■■■■■ 5.13
MSANTD3-203ENST00000395067 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.03■■■■■ 5.12
MSANTD3-203ENST00000395067 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
MSANTD3-203ENST00000395067 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
MSANTD3-203ENST00000395067 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
MSANTD3-203ENST00000395067 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa46.89■■■■■ 5.1
MSANTD3-203ENST00000395067 FMN1Q68DA7 1419 aa46.83■■■■■ 5.09
MSANTD3-203ENST00000395067 HECW1Q76N89 1606 aa46.83■■■■■ 5.09
MSANTD3-203ENST00000395067 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.8■■■■■ 5.08
MSANTD3-203ENST00000395067 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.76■■■■■ 5.08
MSANTD3-203ENST00000395067 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.76■■■■■ 5.08
MSANTD3-203ENST00000395067 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.74■■■■■ 5.07
MSANTD3-203ENST00000395067 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.74■■■■■ 5.072e-7■■■■□ 26.2
MSANTD3-203ENST00000395067 ADGRL1O94910 1474 aa46.71■■■■■ 5.07
MSANTD3-203ENST00000395067 NEO1Q92859 1461 aa46.69■■■■■ 5.06
MSANTD3-203ENST00000395067 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
MSANTD3-203ENST00000395067 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.62■■■■■ 5.05
MSANTD3-203ENST00000395067 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.62■■■■■ 5.05
MSANTD3-203ENST00000395067 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
MSANTD3-203ENST00000395067 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.53■■■■■ 5.04
MSANTD3-203ENST00000395067 RAPGEF3O95398 923 aa46.51■■■■■ 5.04
MSANTD3-203ENST00000395067 FANCAO15360 1455 aa46.51■■■■■ 5.04
MSANTD3-203ENST00000395067 KIF14Q15058 1648 aa46.51■■■■■ 5.04
MSANTD3-203ENST00000395067 RICTORQ6R327 1708 aa46.49■■■■■ 5.03
MSANTD3-203ENST00000395067 AKNAQ7Z591 1439 aa46.44■■■■■ 5.03
MSANTD3-203ENST00000395067 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.44■■■■■ 5.02
MSANTD3-203ENST00000395067 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.43■■■■■ 5.02
MSANTD3-203ENST00000395067 CLIP1P30622 1438 aa46.42■■■■■ 5.02
MSANTD3-203ENST00000395067 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.39■■■■■ 5.02
MSANTD3-203ENST00000395067 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
MSANTD3-203ENST00000395067 PLCH2O75038 1416 aa46.35■■■■■ 5.01
MSANTD3-203ENST00000395067 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.34■■■■■ 5.01
MSANTD3-203ENST00000395067 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.32■■■■■ 5.01
MSANTD3-203ENST00000395067 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.31■■■■■ 5
MSANTD3-203ENST00000395067 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.28■■■■■ 5
MSANTD3-203ENST00000395067 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.24■■■■■ 4.99
MSANTD3-203ENST00000395067 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa46.2■■■■■ 4.99
MSANTD3-203ENST00000395067 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.15■■■■■ 4.98
MSANTD3-203ENST00000395067 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.15■■■■■ 4.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms