RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394917.3

ZNF12-202, Transcript of zinc finger protein 12, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF12, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF12-202ENST00000394917 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.71■■■■■ 4.43
ZNF12-202ENST00000394917 CUL7Q14999 1698 aa42.7■■■■■ 4.43
ZNF12-202ENST00000394917 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.55■■■■■ 4.4
ZNF12-202ENST00000394917 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.53■■■■■ 4.4
ZNF12-202ENST00000394917 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.2■■■■■ 4.35
ZNF12-202ENST00000394917 IQGAP2Q13576 1575 aa42.18■■■■■ 4.34
ZNF12-202ENST00000394917 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.15■■■■■ 4.34
ZNF12-202ENST00000394917 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.15■■■■■ 4.34
ZNF12-202ENST00000394917 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.12■■■■■ 4.33
ZNF12-202ENST00000394917 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
ZNF12-202ENST00000394917 PTPRGP23470 1445 aa42.1■■■■■ 4.33
ZNF12-202ENST00000394917 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.05■■■■■ 4.32
ZNF12-202ENST00000394917 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.04■■■■■ 4.32
ZNF12-202ENST00000394917 MAPKBP1O60336 1514 aa42■■■■■ 4.31
ZNF12-202ENST00000394917 DISP1Q96F81 1524 aa41.96■■■■■ 4.31
ZNF12-202ENST00000394917 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.94■■■■■ 4.3
ZNF12-202ENST00000394917 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.93■■■■■ 4.3
ZNF12-202ENST00000394917 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.92■■■■■ 4.3
ZNF12-202ENST00000394917 PRXQ9BXM0 1461 aa41.85■■■■■ 4.29
ZNF12-202ENST00000394917 DIP2BQ9P265 1576 aa41.84■■■■■ 4.29
ZNF12-202ENST00000394917 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.82■■■■■ 4.29
ZNF12-202ENST00000394917 KIAA0556O60303 1618 aa41.8■■■■■ 4.28
ZNF12-202ENST00000394917 ABCC2Q92887 1545 aa41.79■■■■■ 4.28
ZNF12-202ENST00000394917 UACAQ9BZF9 1416 aa41.78■■■■■ 4.28
ZNF12-202ENST00000394917 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.75■■■■■ 4.27
ZNF12-202ENST00000394917 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.66■■■■■ 4.26
ZNF12-202ENST00000394917 ASXL2Q76L83 1435 aa41.64■■■■■ 4.26
ZNF12-202ENST00000394917 GOLGA3Q08378 1498 aa41.62■■■■■ 4.25
ZNF12-202ENST00000394917 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.59■■■■■ 4.25
ZNF12-202ENST00000394917 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.57■■■■■ 4.25
ZNF12-202ENST00000394917 TSPOAP1O95153 1857 aa41.57■■■■■ 4.24
ZNF12-202ENST00000394917 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
ZNF12-202ENST00000394917 EEA1Q15075 1411 aa41.5■■■■■ 4.23
ZNF12-202ENST00000394917 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
ZNF12-202ENST00000394917 GLI2P10070 1586 aa41.44■■■■■ 4.22
ZNF12-202ENST00000394917 KDM6BO15054 1643 aa41.4■■■■■ 4.22
ZNF12-202ENST00000394917 ABCA8O94911 1581 aa41.39■■■■■ 4.22
ZNF12-202ENST00000394917 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
ZNF12-202ENST00000394917 P3H3Q8IVL6 736 aa41.39■■■■■ 4.22
ZNF12-202ENST00000394917 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
ZNF12-202ENST00000394917 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
ZNF12-202ENST00000394917 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.28■■■■■ 4.2
ZNF12-202ENST00000394917 SAMD9Q5K651 1589 aa41.25■■■■■ 4.19
ZNF12-202ENST00000394917 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.24■■■■■ 4.19
ZNF12-202ENST00000394917 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.23■■■■■ 4.19
ZNF12-202ENST00000394917 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
ZNF12-202ENST00000394917 ARID3CA6NKF2 412 aa41.17■■■■■ 4.18
ZNF12-202ENST00000394917 KIF21BO75037 1637 aa41.15■■■■■ 4.18
ZNF12-202ENST00000394917 KCNH8Q96L42 1107 aa41.14■■■■■ 4.18
ZNF12-202ENST00000394917 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.09■■■■■ 4.17
ZNF12-202ENST00000394917 ATP10BO94823 1461 aa41.08■■■■■ 4.17
ZNF12-202ENST00000394917 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.03■■■■■ 4.16
ZNF12-202ENST00000394917 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.03■■■■■ 4.16
ZNF12-202ENST00000394917 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
ZNF12-202ENST00000394917 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.02■■■■■ 4.16
ZNF12-202ENST00000394917 CD109Q6YHK3 1445 aa41.01■■■■■ 4.15
ZNF12-202ENST00000394917 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.98■■■■■ 4.15
ZNF12-202ENST00000394917 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.93■■■■■ 4.14
ZNF12-202ENST00000394917 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
ZNF12-202ENST00000394917 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
ZNF12-202ENST00000394917 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
ZNF12-202ENST00000394917 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.9■■■■■ 4.14
ZNF12-202ENST00000394917 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
ZNF12-202ENST00000394917 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.84■■■■■ 4.13
ZNF12-202ENST00000394917 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.75■■■■■ 4.11
ZNF12-202ENST00000394917 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.65■■■■■ 4.1
ZNF12-202ENST00000394917 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.64■■■■■ 4.1
ZNF12-202ENST00000394917 ADGRL1O94910 1474 aa40.6■■■■■ 4.09
ZNF12-202ENST00000394917 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.59■■■■■ 4.09
ZNF12-202ENST00000394917 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
ZNF12-202ENST00000394917 FMN1Q68DA7 1419 aa40.55■■■■■ 4.08
ZNF12-202ENST00000394917 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
ZNF12-202ENST00000394917 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.53■■■■■ 4.08
ZNF12-202ENST00000394917 NEO1Q92859 1461 aa40.51■■■■■ 4.07
ZNF12-202ENST00000394917 HECW1Q76N89 1606 aa40.45■■■■■ 4.07
ZNF12-202ENST00000394917 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.06
ZNF12-202ENST00000394917 RAPGEF3O95398 923 aa40.43■■■■■ 4.06
ZNF12-202ENST00000394917 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.39■■■■■ 4.06
ZNF12-202ENST00000394917 FANCAO15360 1455 aa40.32■■■■■ 4.05
ZNF12-202ENST00000394917 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.31■■■■■ 4.04
ZNF12-202ENST00000394917 AKNAQ7Z591 1439 aa40.3■■■■■ 4.04
ZNF12-202ENST00000394917 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
ZNF12-202ENST00000394917 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.26■■■■■ 4.04
ZNF12-202ENST00000394917 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
ZNF12-202ENST00000394917 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.22■■■■■ 4.03
ZNF12-202ENST00000394917 PLCH2O75038 1416 aa40.19■■■■■ 4.02
ZNF12-202ENST00000394917 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
ZNF12-202ENST00000394917 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
ZNF12-202ENST00000394917 RICTORQ6R327 1708 aa40.16■■■■■ 4.02
ZNF12-202ENST00000394917 KIF14Q15058 1648 aa40.16■■■■■ 4.02
ZNF12-202ENST00000394917 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.16■■■■■ 4.02
ZNF12-202ENST00000394917 CLIP1P30622 1438 aa40.15■■■■■ 4.02
ZNF12-202ENST00000394917 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.1■■■■■ 4.01
ZNF12-202ENST00000394917 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.07■■■■■ 4
ZNF12-202ENST00000394917 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.07■■■■■ 4
ZNF12-202ENST00000394917 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.06■■■■■ 4
ZNF12-202ENST00000394917 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.05■■■■■ 4
ZNF12-202ENST00000394917 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
ZNF12-202ENST00000394917 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.02■■■■■ 4
ZNF12-202ENST00000394917 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms