RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394534.6

AKAP9-204, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene AKAP9, Length 5,652 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-204ENST00000394534 CLIP1P30622 1438 aa8.6□□□□□ -1.03
AKAP9-204ENST00000394534 ADAMTS12P58397 1594 aa8.6□□□□□ -1.03
AKAP9-204ENST00000394534 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.6□□□□□ -1.03
AKAP9-204ENST00000394534 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.59□□□□□ -1.03
AKAP9-204ENST00000394534 GRIN2AQ12879 1464 aa8.59□□□□□ -1.03
AKAP9-204ENST00000394534 KIF21BO75037 1637 aa8.58□□□□□ -1.04
AKAP9-204ENST00000394534 SYNJ2O15056 1496 aa8.58□□□□□ -1.04
AKAP9-204ENST00000394534 JPH4Q96JJ6 628 aa8.58□□□□□ -1.04
AKAP9-204ENST00000394534 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.57□□□□□ -1.04
AKAP9-204ENST00000394534 OSCARQ8IYS5 282 aa8.57□□□□□ -1.04
AKAP9-204ENST00000394534 CEP170Q5SW79 1584 aa8.56□□□□□ -1.04
AKAP9-204ENST00000394534 CUL7Q14999 1698 aa8.56□□□□□ -1.04
AKAP9-204ENST00000394534 APLP2Q06481 763 aa8.55□□□□□ -1.04
AKAP9-204ENST00000394534 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
AKAP9-204ENST00000394534 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.54□□□□□ -1.04
AKAP9-204ENST00000394534 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.53□□□□□ -1.04
AKAP9-204ENST00000394534 ARAP1Q96P48 1450 aa8.52□□□□□ -1.05
AKAP9-204ENST00000394534 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
AKAP9-204ENST00000394534 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.52□□□□□ -1.05
AKAP9-204ENST00000394534 ITGAEP38570 1179 aa8.51□□□□□ -1.05
AKAP9-204ENST00000394534 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.51□□□□□ -1.05
AKAP9-204ENST00000394534 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.5□□□□□ -1.05
AKAP9-204ENST00000394534 IQGAP2Q13576 1575 aa8.5□□□□□ -1.05
AKAP9-204ENST00000394534 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
AKAP9-204ENST00000394534 KCNH8Q96L42 1107 aa8.49□□□□□ -1.05
AKAP9-204ENST00000394534 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.46□□□□□ -1.05
AKAP9-204ENST00000394534 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.46□□□□□ -1.06
AKAP9-204ENST00000394534 NUP160Q12769 1436 aa8.45□□□□□ -1.06
AKAP9-204ENST00000394534 DISP1Q96F81 1524 aa8.43□□□□□ -1.06
AKAP9-204ENST00000394534 PTPRGP23470 1445 aa8.43□□□□□ -1.06
AKAP9-204ENST00000394534 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
AKAP9-204ENST00000394534 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
AKAP9-204ENST00000394534 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.42□□□□□ -1.06
AKAP9-204ENST00000394534 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
AKAP9-204ENST00000394534 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.42□□□□□ -1.06
AKAP9-204ENST00000394534 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
AKAP9-204ENST00000394534 KIAA0556O60303 1618 aa8.41□□□□□ -1.06
AKAP9-204ENST00000394534 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.38□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.37□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.37□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 ARHGEF11O15085 1522 aa8.36□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 SAMD9Q5K651 1589 aa8.36□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 FMN1Q68DA7 1419 aa8.36□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.35□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.35□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.34□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.34□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.34□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.34□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.34□□□□□ -1.07
AKAP9-204ENST00000394534 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.34□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.32□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 UACAQ9BZF9 1416 aa8.32□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.31□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.3□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 SHROOM2Q13796 1616 aa8.3□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 ATP10BO94823 1461 aa8.29□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.29□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.29□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 HECW1Q76N89 1606 aa8.29□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 TIAM1Q13009 1591 aa8.29□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.28□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.28□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.27□□□□□ -1.08
AKAP9-204ENST00000394534 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.27□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 KIF14Q15058 1648 aa8.26□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.26□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.25□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 ABCC2Q92887 1545 aa8.25□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 ABCA8O94911 1581 aa8.25□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.25□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 TSPOAP1O95153 1857 aa8.25□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 NCOA2Q15596 1464 aa8.24□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 ASXL2Q76L83 1435 aa8.24□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.22□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.21□□□□□ -1.09
AKAP9-204ENST00000394534 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 RAPGEF3O95398 923 aa8.2□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 AFAP1Q8N556 730 aa8.19□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.19□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.19□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.11e-7■■□□□ 13.7
AKAP9-204ENST00000394534 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.18□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 TRIM52Q96A61 297 aa8.18□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.17□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 MLECQ14165 292 aa8.16□□□□□ -1.1
AKAP9-204ENST00000394534 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms