RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 GRIN2AQ12879 1464 aa32.1■■■□□ 2.73
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HDDC3-202ENST00000394272 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.05■■■□□ 2.72
HDDC3-202ENST00000394272 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
HDDC3-202ENST00000394272 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.99■■■□□ 2.71
HDDC3-202ENST00000394272 IQGAP2Q13576 1575 aa31.97■■■□□ 2.71
HDDC3-202ENST00000394272 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.92■■■□□ 2.7
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HDDC3-202ENST00000394272 CEP170Q5SW79 1584 aa31.92■■■□□ 2.7
HDDC3-202ENST00000394272 NUP160Q12769 1436 aa31.89■■■□□ 2.7
HDDC3-202ENST00000394272 FBLN2P98095 1184 aa31.88■■■□□ 2.69
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HDDC3-202ENST00000394272 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.81■■■□□ 2.68
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HDDC3-202ENST00000394272 KIAA0556O60303 1618 aa31.65■■■□□ 2.66
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HDDC3-202ENST00000394272 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.59■■■□□ 2.65
HDDC3-202ENST00000394272 JPH4Q96JJ6 628 aa31.59■■■□□ 2.65
HDDC3-202ENST00000394272 MAP3K1Q13233 1512 aa31.55■■■□□ 2.64
HDDC3-202ENST00000394272 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.53■■■□□ 2.64
HDDC3-202ENST00000394272 TIAM1Q13009 1591 aa31.51■■■□□ 2.63
HDDC3-202ENST00000394272 SHROOM2Q13796 1616 aa31.5■■■□□ 2.63
HDDC3-202ENST00000394272 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.49■■■□□ 2.63
HDDC3-202ENST00000394272 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.48■■■□□ 2.63
HDDC3-202ENST00000394272 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.48■■■□□ 2.63
HDDC3-202ENST00000394272 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
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HDDC3-202ENST00000394272 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
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HDDC3-202ENST00000394272 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.35■■■□□ 2.61
HDDC3-202ENST00000394272 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.31■■■□□ 2.6
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.29■■■□□ 2.6
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HDDC3-202ENST00000394272 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.25■■■□□ 2.59
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HDDC3-202ENST00000394272 PTPRGP23470 1445 aa31.19■■■□□ 2.58
HDDC3-202ENST00000394272 OSCARQ8IYS5 282 aa31.18■■■□□ 2.58
HDDC3-202ENST00000394272 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
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HDDC3-202ENST00000394272 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.13■■■□□ 2.57
HDDC3-202ENST00000394272 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.13■■■□□ 2.57
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HDDC3-202ENST00000394272 ARHGEF11O15085 1522 aa30.99■■■□□ 2.55
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HDDC3-202ENST00000394272 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.96■■■□□ 2.55
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HDDC3-202ENST00000394272 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
HDDC3-202ENST00000394272 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.91■■■□□ 2.54
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HDDC3-202ENST00000394272 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.85■■■□□ 2.53
HDDC3-202ENST00000394272 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.84■■■□□ 2.53
HDDC3-202ENST00000394272 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.79■■■□□ 2.52
HDDC3-202ENST00000394272 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.79■■■□□ 2.52
HDDC3-202ENST00000394272 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.79■■■□□ 2.52
HDDC3-202ENST00000394272 KIF14Q15058 1648 aa30.77■■■□□ 2.52
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HDDC3-202ENST00000394272 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.71■■■□□ 2.51
HDDC3-202ENST00000394272 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
HDDC3-202ENST00000394272 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
HDDC3-202ENST00000394272 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.67■■■□□ 2.5
HDDC3-202ENST00000394272 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.65■■■□□ 2.5
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HDDC3-202ENST00000394272 ITGAEP38570 1179 aa30.59■■■□□ 2.49
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HDDC3-202ENST00000394272 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.58■■■□□ 2.49
HDDC3-202ENST00000394272 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.58■■■□□ 2.49
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HDDC3-202ENST00000394272 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
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HDDC3-202ENST00000394272 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.48■■■□□ 2.47
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HDDC3-202ENST00000394272 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.46■■■□□ 2.47
HDDC3-202ENST00000394272 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.46■■■□□ 2.47
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
HDDC3-202ENST00000394272 KCNH8Q96L42 1107 aa30.42■■■□□ 2.46
HDDC3-202ENST00000394272 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
HDDC3-202ENST00000394272 ASXL2Q76L83 1435 aa30.42■■■□□ 2.46
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