RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 JPH4Q96JJ6 628 aa46.43■■■■■ 5.02
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GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.24■■■■■ 4.99
GNPTAB-202ENST00000392919 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.9■■■■■ 4.94
GNPTAB-202ENST00000392919 IQGAP2Q13576 1575 aa45.88■■■■■ 4.93
GNPTAB-202ENST00000392919 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.84■■■■■ 4.93
GNPTAB-202ENST00000392919 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.84■■■■■ 4.93
GNPTAB-202ENST00000392919 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.75■■■■■ 4.91
GNPTAB-202ENST00000392919 PTPRGP23470 1445 aa45.74■■■■■ 4.91
GNPTAB-202ENST00000392919 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.74■■■■■ 4.91
GNPTAB-202ENST00000392919 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.72■■■■■ 4.91
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GNPTAB-202ENST00000392919 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.69■■■■■ 4.9
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GNPTAB-202ENST00000392919 MAPKBP1O60336 1514 aa45.63■■■■■ 4.9
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GNPTAB-202ENST00000392919 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.56■■■■■ 4.88
GNPTAB-202ENST00000392919 PRXQ9BXM0 1461 aa45.56■■■■■ 4.88
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.53■■■■■ 4.88
GNPTAB-202ENST00000392919 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.51■■■■■ 4.88
GNPTAB-202ENST00000392919 DIP2BQ9P265 1576 aa45.48■■■■■ 4.87
GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA0556O60303 1618 aa45.48■■■■■ 4.87
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GNPTAB-202ENST00000392919 UACAQ9BZF9 1416 aa45.41■■■■■ 4.86
GNPTAB-202ENST00000392919 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.38■■■■■ 4.86
GNPTAB-202ENST00000392919 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.33■■■■■ 4.85
GNPTAB-202ENST00000392919 EEA1Q15075 1411 aa45.32■■■■■ 4.85
GNPTAB-202ENST00000392919 ASXL2Q76L83 1435 aa45.25■■■■■ 4.83
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA3Q08378 1498 aa45.23■■■■■ 4.83
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.2■■■■■ 4.83
GNPTAB-202ENST00000392919 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.2■■■■■ 4.83
GNPTAB-202ENST00000392919 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.17■■■■■ 4.82
GNPTAB-202ENST00000392919 TSPOAP1O95153 1857 aa45.17■■■■■ 4.82
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GNPTAB-202ENST00000392919 GLI2P10070 1586 aa45.03■■■■■ 4.8
GNPTAB-202ENST00000392919 P3H3Q8IVL6 736 aa45.02■■■■■ 4.8
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GNPTAB-202ENST00000392919 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
GNPTAB-202ENST00000392919 SAMD9Q5K651 1589 aa44.9■■■■■ 4.78
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.86■■■■■ 4.77
GNPTAB-202ENST00000392919 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.83■■■■■ 4.77
GNPTAB-202ENST00000392919 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF21BO75037 1637 aa44.81■■■■■ 4.76
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GNPTAB-202ENST00000392919 ARID3CA6NKF2 412 aa44.76■■■■■ 4.76
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNH8Q96L42 1107 aa44.7■■■■■ 4.75
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP10BO94823 1461 aa44.68■■■■■ 4.74
GNPTAB-202ENST00000392919 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.65■■■■■ 4.74
GNPTAB-202ENST00000392919 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.65■■■■■ 4.74
GNPTAB-202ENST00000392919 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.63■■■■■ 4.73
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GNPTAB-202ENST00000392919 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.61■■■■■ 4.73
GNPTAB-202ENST00000392919 CD109Q6YHK3 1445 aa44.55■■■■■ 4.72
GNPTAB-202ENST00000392919 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.55■■■■■ 4.72
GNPTAB-202ENST00000392919 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
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GNPTAB-202ENST00000392919 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.49■■■■■ 4.71
GNPTAB-202ENST00000392919 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.47■■■■■ 4.71
GNPTAB-202ENST00000392919 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
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GNPTAB-202ENST00000392919 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.36■■■■■ 4.69
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.32■■■■■ 4.68
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.25■■■■■ 4.67
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.16■■■■■ 4.66
GNPTAB-202ENST00000392919 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
GNPTAB-202ENST00000392919 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.12■■■■■ 4.65
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRL1O94910 1474 aa44.08■■■■■ 4.65
GNPTAB-202ENST00000392919 FMN1Q68DA7 1419 aa44.08■■■■■ 4.65
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
GNPTAB-202ENST00000392919 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.01■■■■■ 4.64
GNPTAB-202ENST00000392919 NEO1Q92859 1461 aa44.01■■■■■ 4.64
GNPTAB-202ENST00000392919 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44■■■■■ 4.63
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GNPTAB-202ENST00000392919 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.98■■■■■ 4.63
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GNPTAB-202ENST00000392919 RAPGEF3O95398 923 aa43.94■■■■■ 4.62
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.85■■■■■ 4.61
GNPTAB-202ENST00000392919 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.84■■■■■ 4.61
GNPTAB-202ENST00000392919 FANCAO15360 1455 aa43.83■■■■■ 4.61
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GNPTAB-202ENST00000392919 AKNAQ7Z591 1439 aa43.8■■■■■ 4.6
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GNPTAB-202ENST00000392919 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
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GNPTAB-202ENST00000392919 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.7■■■■■ 4.59
GNPTAB-202ENST00000392919 RICTORQ6R327 1708 aa43.7■■■■■ 4.59
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP162Q5TB80 1403 aa43.69■■■■■ 4.58
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GNPTAB-202ENST00000392919 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.61■■■■■ 4.57
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.57■■■■■ 4.56
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GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.53■■■■■ 4.56
GNPTAB-202ENST00000392919 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.53■■■■■ 4.56
GNPTAB-202ENST00000392919 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.52■■■■■ 4.56
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