RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392273.7

LATS1-202, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 2,567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-202ENST00000392273 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.53■■□□□ 1.52
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LATS1-202ENST00000392273 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.47■■□□□ 1.51
LATS1-202ENST00000392273 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.517e-7■■■■■ 32.5
LATS1-202ENST00000392273 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.46■■□□□ 1.51
LATS1-202ENST00000392273 PBRM1Q86U86 1689 aa24.46■■□□□ 1.51
LATS1-202ENST00000392273 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
LATS1-202ENST00000392273 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
LATS1-202ENST00000392273 MAP3K1Q13233 1512 aa24.42■■□□□ 1.5
LATS1-202ENST00000392273 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.4■■□□□ 1.5
LATS1-202ENST00000392273 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.39■■□□□ 1.49
LATS1-202ENST00000392273 WDR62O43379 1518 aa24.38■■□□□ 1.49
LATS1-202ENST00000392273 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.37■■□□□ 1.49
LATS1-202ENST00000392273 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
LATS1-202ENST00000392273 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.35■■□□□ 1.49
LATS1-202ENST00000392273 SAMD9Q5K651 1589 aa24.34■■□□□ 1.49
LATS1-202ENST00000392273 ERCC6Q03468 1493 aa24.33■■□□□ 1.49
LATS1-202ENST00000392273 ADAMTS12P58397 1594 aa24.33■■□□□ 1.48
LATS1-202ENST00000392273 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.33■■□□□ 1.48
LATS1-202ENST00000392273 ITGAEP38570 1179 aa24.32■■□□□ 1.48
LATS1-202ENST00000392273 IFT140Q96RY7 1462 aa24.31■■□□□ 1.48
LATS1-202ENST00000392273 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.3■■□□□ 1.48
LATS1-202ENST00000392273 GRIN2BQ13224 1484 aa24.29■■□□□ 1.48
LATS1-202ENST00000392273 FMN1Q68DA7 1419 aa24.29■■□□□ 1.48
LATS1-202ENST00000392273 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.28■■□□□ 1.48
LATS1-202ENST00000392273 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
LATS1-202ENST00000392273 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.22■■□□□ 1.47
LATS1-202ENST00000392273 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
LATS1-202ENST00000392273 IQGAP2Q13576 1575 aa24.2■■□□□ 1.46
LATS1-202ENST00000392273 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
LATS1-202ENST00000392273 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
LATS1-202ENST00000392273 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.1■■□□□ 1.45
LATS1-202ENST00000392273 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.07■■□□□ 1.44
LATS1-202ENST00000392273 GRIN2AQ12879 1464 aa24.05■■□□□ 1.44
LATS1-202ENST00000392273 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.03■■□□□ 1.44
LATS1-202ENST00000392273 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
LATS1-202ENST00000392273 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.01■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.01■■□□□ 1.43
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LATS1-202ENST00000392273 FGD6Q6ZV73 1430 aa24■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 ARID3CA6NKF2 412 aa23.99■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 NCOA2Q15596 1464 aa23.99■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 HECW1Q76N89 1606 aa23.99■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.99■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.97■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 FBLN2P98095 1184 aa23.97■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
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LATS1-202ENST00000392273 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.96■■□□□ 1.43
LATS1-202ENST00000392273 KIAA0556O60303 1618 aa23.95■■□□□ 1.43
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LATS1-202ENST00000392273 CEP170Q5SW79 1584 aa23.93■■□□□ 1.42
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LATS1-202ENST00000392273 PTPRKQ15262 1439 aa23.86■■□□□ 1.41
LATS1-202ENST00000392273 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.83■■□□□ 1.4
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LATS1-202ENST00000392273 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
LATS1-202ENST00000392273 NUP160Q12769 1436 aa23.79■■□□□ 1.4
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LATS1-202ENST00000392273 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.73■■□□□ 1.39
LATS1-202ENST00000392273 HFM1A2PYH4 1435 aa23.72■■□□□ 1.39
LATS1-202ENST00000392273 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.72■■□□□ 1.39
LATS1-202ENST00000392273 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
LATS1-202ENST00000392273 NEUROD1Q13562 356 aa23.69■■□□□ 1.38
LATS1-202ENST00000392273 NAIPQ13075 1403 aa23.68■■□□□ 1.38
LATS1-202ENST00000392273 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.68■■□□□ 1.38
LATS1-202ENST00000392273 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.68■■□□□ 1.38
LATS1-202ENST00000392273 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.65■■□□□ 1.38
LATS1-202ENST00000392273 MIA2Q96PC5 1412 aa23.64■■□□□ 1.37
LATS1-202ENST00000392273 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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LATS1-202ENST00000392273 UACAQ9BZF9 1416 aa23.59■■□□□ 1.37
LATS1-202ENST00000392273 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
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LATS1-202ENST00000392273 ABCC5O15440 1437 aa23.48■■□□□ 1.35
LATS1-202ENST00000392273 AKNAQ7Z591 1439 aa23.48■■□□□ 1.35
LATS1-202ENST00000392273 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.47■■□□□ 1.35
LATS1-202ENST00000392273 ATP10BO94823 1461 aa23.46■■□□□ 1.35
LATS1-202ENST00000392273 TRIM52Q96A61 297 aa23.46■■□□□ 1.35
LATS1-202ENST00000392273 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LATS1-202ENST00000392273 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
LATS1-202ENST00000392273 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.45■■□□□ 1.34
LATS1-202ENST00000392273 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.44■■□□□ 1.34
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