RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383282.3

NPHP3-202, Transcript of nephrocystin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3, Length 782 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-202ENST00000383282 IGF1RP08069 1367 aa46.06■■■■■ 4.96
NPHP3-202ENST00000383282 CUL7Q14999 1698 aa45.96■■■■■ 4.95
NPHP3-202ENST00000383282 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.91■■■■■ 4.94
NPHP3-202ENST00000383282 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.79■■■■■ 4.92
NPHP3-202ENST00000383282 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.78■■■■■ 4.92
NPHP3-202ENST00000383282 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.6■■■■■ 4.89
NPHP3-202ENST00000383282 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.59■■■■■ 4.89
NPHP3-202ENST00000383282 MAPKBP1O60336 1514 aa45.57■■■■■ 4.89
NPHP3-202ENST00000383282 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.55■■■■■ 4.88
NPHP3-202ENST00000383282 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.55■■■■■ 4.88
NPHP3-202ENST00000383282 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.53■■■■■ 4.88
NPHP3-202ENST00000383282 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.52■■■■■ 4.88
NPHP3-202ENST00000383282 PTPRGP23470 1445 aa45.51■■■■■ 4.88
NPHP3-202ENST00000383282 IQGAP2Q13576 1575 aa45.45■■■■■ 4.87
NPHP3-202ENST00000383282 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.44■■■■■ 4.86
NPHP3-202ENST00000383282 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
NPHP3-202ENST00000383282 DIP2BQ9P265 1576 aa45.39■■■■■ 4.86
NPHP3-202ENST00000383282 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.37■■■■■ 4.85
NPHP3-202ENST00000383282 ABCC2Q92887 1545 aa45.23■■■■■ 4.83
NPHP3-202ENST00000383282 DISP1Q96F81 1524 aa45.21■■■■■ 4.83
NPHP3-202ENST00000383282 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.16■■■■■ 4.82
NPHP3-202ENST00000383282 UACAQ9BZF9 1416 aa45.15■■■■■ 4.82
NPHP3-202ENST00000383282 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.15■■■■■ 4.82
NPHP3-202ENST00000383282 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.08■■■■■ 4.81
NPHP3-202ENST00000383282 ASXL2Q76L83 1435 aa45.07■■■■■ 4.81
NPHP3-202ENST00000383282 KDM6BO15054 1643 aa45.02■■■■■ 4.8
NPHP3-202ENST00000383282 KIAA0556O60303 1618 aa45.02■■■■■ 4.8
NPHP3-202ENST00000383282 TSPOAP1O95153 1857 aa45.02■■■■■ 4.8
NPHP3-202ENST00000383282 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.93■■■■■ 4.78
NPHP3-202ENST00000383282 GLI2P10070 1586 aa44.91■■■■■ 4.78
NPHP3-202ENST00000383282 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.9■■■■■ 4.78
NPHP3-202ENST00000383282 PRXQ9BXM0 1461 aa44.88■■■■■ 4.78
NPHP3-202ENST00000383282 GOLGA3Q08378 1498 aa44.86■■■■■ 4.77
NPHP3-202ENST00000383282 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
NPHP3-202ENST00000383282 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
NPHP3-202ENST00000383282 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
NPHP3-202ENST00000383282 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.65■■■■■ 4.74
NPHP3-202ENST00000383282 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.63■■■■■ 4.73
NPHP3-202ENST00000383282 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.63■■■■■ 4.73
NPHP3-202ENST00000383282 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
NPHP3-202ENST00000383282 ABCA8O94911 1581 aa44.6■■■■■ 4.73
NPHP3-202ENST00000383282 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.59■■■■■ 4.73
NPHP3-202ENST00000383282 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.54■■■■■ 4.72
NPHP3-202ENST00000383282 P3H3Q8IVL6 736 aa44.45■■■■■ 4.71
NPHP3-202ENST00000383282 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
NPHP3-202ENST00000383282 KCNH8Q96L42 1107 aa44.44■■■■■ 4.7
NPHP3-202ENST00000383282 EEA1Q15075 1411 aa44.43■■■■■ 4.7
NPHP3-202ENST00000383282 CD109Q6YHK3 1445 aa44.4■■■■■ 4.7
NPHP3-202ENST00000383282 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.33■■■■■ 4.69
NPHP3-202ENST00000383282 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.32■■■■■ 4.69
NPHP3-202ENST00000383282 ARID3CA6NKF2 412 aa44.29■■■■■ 4.68
NPHP3-202ENST00000383282 SAMD9Q5K651 1589 aa44.29■■■■■ 4.68
NPHP3-202ENST00000383282 ATP10BO94823 1461 aa44.25■■■■■ 4.67
NPHP3-202ENST00000383282 ADGRL1O94910 1474 aa44.21■■■■■ 4.67
NPHP3-202ENST00000383282 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
NPHP3-202ENST00000383282 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.14■■■■■ 4.66
NPHP3-202ENST00000383282 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.11■■■■■ 4.65
NPHP3-202ENST00000383282 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
NPHP3-202ENST00000383282 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.05■■■■■ 4.64
NPHP3-202ENST00000383282 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44■■■■■ 4.63
NPHP3-202ENST00000383282 KIF21BO75037 1637 aa43.99■■■■■ 4.63
NPHP3-202ENST00000383282 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
NPHP3-202ENST00000383282 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.97■■■■■ 4.63
NPHP3-202ENST00000383282 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.96■■■■■ 4.63
NPHP3-202ENST00000383282 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.92■■■■■ 4.62
NPHP3-202ENST00000383282 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.85■■■■■ 4.61
NPHP3-202ENST00000383282 NEO1Q92859 1461 aa43.83■■■■■ 4.61
NPHP3-202ENST00000383282 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
NPHP3-202ENST00000383282 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.75■■■■■ 4.59
NPHP3-202ENST00000383282 RAPGEF3O95398 923 aa43.73■■■■■ 4.59
NPHP3-202ENST00000383282 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.73■■■■■ 4.59
NPHP3-202ENST00000383282 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.58■■■■■ 4.57
NPHP3-202ENST00000383282 FMN1Q68DA7 1419 aa43.57■■■■■ 4.57
NPHP3-202ENST00000383282 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.57■■■■■ 4.57
NPHP3-202ENST00000383282 FANCAO15360 1455 aa43.55■■■■■ 4.56
NPHP3-202ENST00000383282 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
NPHP3-202ENST00000383282 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
NPHP3-202ENST00000383282 AKNAQ7Z591 1439 aa43.54■■■■■ 4.56
NPHP3-202ENST00000383282 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.54■■■■■ 4.56
NPHP3-202ENST00000383282 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
NPHP3-202ENST00000383282 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.52■■■■■ 4.56
NPHP3-202ENST00000383282 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.5■■■■■ 4.55
NPHP3-202ENST00000383282 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.48■■■■■ 4.55
NPHP3-202ENST00000383282 HECW1Q76N89 1606 aa43.46■■■■■ 4.55
NPHP3-202ENST00000383282 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
NPHP3-202ENST00000383282 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
NPHP3-202ENST00000383282 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.38■■■■■ 4.54
NPHP3-202ENST00000383282 RICTORQ6R327 1708 aa43.37■■■■■ 4.53
NPHP3-202ENST00000383282 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.37■■■■■ 4.53
NPHP3-202ENST00000383282 PLCH2O75038 1416 aa43.35■■■■■ 4.53
NPHP3-202ENST00000383282 PTPRMP28827 1452 aa43.35■■■■■ 4.53
NPHP3-202ENST00000383282 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.31■■■■■ 4.52
NPHP3-202ENST00000383282 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.27■■■■■ 4.52
NPHP3-202ENST00000383282 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.24■■■■■ 4.51
NPHP3-202ENST00000383282 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.23■■■■■ 4.51
NPHP3-202ENST00000383282 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.23■■■■■ 4.51
NPHP3-202ENST00000383282 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.22■■■■■ 4.51
NPHP3-202ENST00000383282 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
NPHP3-202ENST00000383282 MADDQ8WXG6 1647 aa43.21■■■■■ 4.51
NPHP3-202ENST00000383282 CLIP1P30622 1438 aa43.21■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms