RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEP162Q5TB80 1403 aa44.51■■■■■ 4.72
TRAPPC10-202ENST00000380221 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEP170Q5SW79 1584 aa44.48■■■■■ 4.71
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUP160Q12769 1436 aa44.44■■■■■ 4.7
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.36■■■■■ 4.69
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLIP1P30622 1438 aa44.35■■■■■ 4.69
TRAPPC10-202ENST00000380221 IQGAP2Q13576 1575 aa44.33■■■■■ 4.69
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.18■■■■■ 4.66
TRAPPC10-202ENST00000380221 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.11■■■■■ 4.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 JPH4Q96JJ6 628 aa44.08■■■■■ 4.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.07■■■■■ 4.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.07■■■■■ 4.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 P3H3Q8IVL6 736 aa44.07■■■■■ 4.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 SAMD9Q5K651 1589 aa44.06■■■■■ 4.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 OSCARQ8IYS5 282 aa44.04■■■■■ 4.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARAP1Q96P48 1450 aa44.04■■■■■ 4.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 DISP1Q96F81 1524 aa43.95■■■■■ 4.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.95■■■■■ 4.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 SHROOM2Q13796 1616 aa43.93■■■■■ 4.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIAA0556O60303 1618 aa43.9■■■■■ 4.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.86■■■■■ 4.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.84■■■■■ 4.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.83■■■■■ 4.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.72■■■■■ 4.59
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
TRAPPC10-202ENST00000380221 FMN1Q68DA7 1419 aa43.68■■■■■ 4.58
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.5■■■■■ 4.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTPRGP23470 1445 aa43.49■■■■■ 4.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.46■■■■■ 4.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.41■■■■■ 4.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.38■■■■■ 4.53
TRAPPC10-202ENST00000380221 APLP2Q06481 763 aa43.36■■■■■ 4.53
TRAPPC10-202ENST00000380221 HECW1Q76N89 1606 aa43.33■■■■■ 4.53
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCA8O94911 1581 aa43.32■■■■■ 4.53
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGEF11O15085 1522 aa43.32■■■■■ 4.53
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.3■■■■■ 4.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 UACAQ9BZF9 1416 aa43.23■■■■■ 4.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 TIAM1Q13009 1591 aa43.22■■■■■ 4.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARID3CA6NKF2 412 aa43.22■■■■■ 4.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAP3K1Q13233 1512 aa43.19■■■■■ 4.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.19■■■■■ 4.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.19■■■■■ 4.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.19■■■■■ 4.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.18■■■■■ 4.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.15■■■■■ 4.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCC2Q92887 1545 aa43.12■■■■■ 4.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.05■■■■■ 4.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.03■■■■■ 4.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP10BO94823 1461 aa43.02■■■■■ 4.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.01■■■■■ 4.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.94■■■■■ 4.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.94■■■■■ 4.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.92■■■■■ 4.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.88■■■■■ 4.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.84■■■■■ 4.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.77■■■■■ 4.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
TRAPPC10-202ENST00000380221 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.68■■■■■ 4.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.67■■■■■ 4.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCOA2Q15596 1464 aa42.66■■■■■ 4.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.63■■■■■ 4.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.61■■■■■ 4.41
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF14Q15058 1648 aa42.6■■■■■ 4.41
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASXL2Q76L83 1435 aa42.53■■■■■ 4.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.51■■■■■ 4.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNH8Q96L42 1107 aa42.5■■■■■ 4.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.42■■■■■ 4.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.42■■■■■ 4.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.4■■■■■ 4.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAPKBP1O60336 1514 aa42.39■■■■■ 4.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.38■■■■■ 4.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.34■■■■■ 4.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.33■■■■■ 4.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.29■■■■■ 4.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.28■■■■■ 4.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 MIA2Q96PC5 1412 aa42.23■■■■■ 4.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.2■■■■■ 4.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.2■■■■■ 4.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.19■■■■■ 4.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 PREX2Q70Z35 1606 aa42.18■■■■■ 4.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.16■■■■■ 4.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
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