RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 EEA1Q15075 1411 aa25.67■■□□□ 1.7
PGGT1B-202ENST00000379615 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.64■■□□□ 1.7
PGGT1B-202ENST00000379615 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.64■■□□□ 1.69
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.58■■□□□ 1.68
PGGT1B-202ENST00000379615 JPH4Q96JJ6 628 aa25.57■■□□□ 1.68
PGGT1B-202ENST00000379615 PRXQ9BXM0 1461 aa25.53■■□□□ 1.68
PGGT1B-202ENST00000379615 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.53■■□□□ 1.68
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PGGT1B-202ENST00000379615 SHROOM2Q13796 1616 aa25.49■■□□□ 1.67
PGGT1B-202ENST00000379615 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PGGT1B-202ENST00000379615 IQGAP2Q13576 1575 aa25.4■■□□□ 1.66
PGGT1B-202ENST00000379615 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.36■■□□□ 1.65
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF21BO75037 1637 aa25.29■■□□□ 1.64
PGGT1B-202ENST00000379615 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.29■■□□□ 1.64
PGGT1B-202ENST00000379615 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.27■■□□□ 1.64
PGGT1B-202ENST00000379615 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.23■■□□□ 1.63
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA3Q08378 1498 aa25.22■■□□□ 1.63
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRGP23470 1445 aa25.22■■□□□ 1.63
PGGT1B-202ENST00000379615 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PGGT1B-202ENST00000379615 DISP1Q96F81 1524 aa25.2■■□□□ 1.62
PGGT1B-202ENST00000379615 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.16■■□□□ 1.62
PGGT1B-202ENST00000379615 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA0556O60303 1618 aa25.12■■□□□ 1.61
PGGT1B-202ENST00000379615 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
PGGT1B-202ENST00000379615 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.06■■□□□ 1.6
PGGT1B-202ENST00000379615 UACAQ9BZF9 1416 aa25.03■■□□□ 1.6
PGGT1B-202ENST00000379615 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PGGT1B-202ENST00000379615 P3H3Q8IVL6 736 aa25.03■■□□□ 1.6
PGGT1B-202ENST00000379615 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.98■■□□□ 1.59
PGGT1B-202ENST00000379615 SAMD9Q5K651 1589 aa24.98■■□□□ 1.59
PGGT1B-202ENST00000379615 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.98■■□□□ 1.59
PGGT1B-202ENST00000379615 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.96■■□□□ 1.59
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCC2Q92887 1545 aa24.93■■□□□ 1.58
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.92■■□□□ 1.58
PGGT1B-202ENST00000379615 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.89■■□□□ 1.58
PGGT1B-202ENST00000379615 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.88■■□□□ 1.57
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.88■■□□□ 1.57
PGGT1B-202ENST00000379615 DIP2BQ9P265 1576 aa24.86■■□□□ 1.57
PGGT1B-202ENST00000379615 MAPKBP1O60336 1514 aa24.86■■□□□ 1.57
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCA8O94911 1581 aa24.85■■□□□ 1.57
PGGT1B-202ENST00000379615 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.84■■□□□ 1.57
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.81■■□□□ 1.56
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPOAP1O95153 1857 aa24.79■■□□□ 1.56
PGGT1B-202ENST00000379615 FMN1Q68DA7 1419 aa24.78■■□□□ 1.56
PGGT1B-202ENST00000379615 CLIP1P30622 1438 aa24.77■■□□□ 1.56
PGGT1B-202ENST00000379615 ASXL2Q76L83 1435 aa24.77■■□□□ 1.56
PGGT1B-202ENST00000379615 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.76■■□□□ 1.55
PGGT1B-202ENST00000379615 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.75■■□□□ 1.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ARID3CA6NKF2 412 aa24.71■■□□□ 1.55
PGGT1B-202ENST00000379615 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PGGT1B-202ENST00000379615 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP10BO94823 1461 aa24.69■■□□□ 1.54
PGGT1B-202ENST00000379615 KDM6BO15054 1643 aa24.68■■□□□ 1.54
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP162Q5TB80 1403 aa24.66■■□□□ 1.54
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.65■■□□□ 1.54
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.61■■□□□ 1.53
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNH8Q96L42 1107 aa24.61■■□□□ 1.53
PGGT1B-202ENST00000379615 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PGGT1B-202ENST00000379615 GLI2P10070 1586 aa24.59■■□□□ 1.53
PGGT1B-202ENST00000379615 HECW1Q76N89 1606 aa24.57■■□□□ 1.52
PGGT1B-202ENST00000379615 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PGGT1B-202ENST00000379615 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.56■■□□□ 1.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PGGT1B-202ENST00000379615 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.5■■□□□ 1.51
PGGT1B-202ENST00000379615 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.49■■□□□ 1.51
PGGT1B-202ENST00000379615 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.47■■□□□ 1.51
PGGT1B-202ENST00000379615 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PGGT1B-202ENST00000379615 CD109Q6YHK3 1445 aa24.45■■□□□ 1.51
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.43■■□□□ 1.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.42■■□□□ 1.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.4■■□□□ 1.5
PGGT1B-202ENST00000379615 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.37■■□□□ 1.49
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.36■■□□□ 1.49
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.36■■□□□ 1.49
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.32■■□□□ 1.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.29■■□□□ 1.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRL1O94910 1474 aa24.28■■□□□ 1.48
PGGT1B-202ENST00000379615 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
PGGT1B-202ENST00000379615 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.27■■□□□ 1.48
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF14Q15058 1648 aa24.26■■□□□ 1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 APLP2Q06481 763 aa24.24■■□□□ 1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 NEO1Q92859 1461 aa24.22■■□□□ 1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.21■■□□□ 1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 PLCH2O75038 1416 aa24.21■■□□□ 1.47
PGGT1B-202ENST00000379615 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.2■■□□□ 1.46
PGGT1B-202ENST00000379615 FANCAO15360 1455 aa24.18■■□□□ 1.46
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP3K1Q13233 1512 aa24.15■■□□□ 1.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.15■■□□□ 1.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TIAM1Q13009 1591 aa24.14■■□□□ 1.45
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.14■■□□□ 1.45
PGGT1B-202ENST00000379615 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.14■■□□□ 1.45
PGGT1B-202ENST00000379615 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.13■■□□□ 1.45
PGGT1B-202ENST00000379615 AKNAQ7Z591 1439 aa24.13■■□□□ 1.45
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