RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
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SNX15-202ENST00000377244 CEP162Q5TB80 1403 aa40.88■■■■■ 4.14
SNX15-202ENST00000377244 NUP160Q12769 1436 aa40.82■■■■■ 4.13
SNX15-202ENST00000377244 IQGAP2Q13576 1575 aa40.74■■■■■ 4.11
SNX15-202ENST00000377244 CLIP1P30622 1438 aa40.73■■■■■ 4.11
SNX15-202ENST00000377244 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.73■■■■■ 4.11
SNX15-202ENST00000377244 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.59■■■■■ 4.09
SNX15-202ENST00000377244 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.51■■■■■ 4.08
SNX15-202ENST00000377244 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.51■■■■■ 4.08
SNX15-202ENST00000377244 P3H3Q8IVL6 736 aa40.49■■■■■ 4.07
SNX15-202ENST00000377244 SAMD9Q5K651 1589 aa40.48■■■■■ 4.07
SNX15-202ENST00000377244 ARAP1Q96P48 1450 aa40.47■■■■■ 4.07
SNX15-202ENST00000377244 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.47■■■■■ 4.07
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SNX15-202ENST00000377244 OSCARQ8IYS5 282 aa40.42■■■■■ 4.06
SNX15-202ENST00000377244 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.4■■■■■ 4.06
SNX15-202ENST00000377244 DISP1Q96F81 1524 aa40.39■■■■■ 4.06
SNX15-202ENST00000377244 SHROOM2Q13796 1616 aa40.37■■■■■ 4.05
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SNX15-202ENST00000377244 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.23■■■■■ 4.03
SNX15-202ENST00000377244 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.23■■■■■ 4.03
SNX15-202ENST00000377244 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
SNX15-202ENST00000377244 FMN1Q68DA7 1419 aa40.09■■■■■ 4.01
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SNX15-202ENST00000377244 ARHGEF11O15085 1522 aa39.83■■■■□ 3.97
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SNX15-202ENST00000377244 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.71■■■■□ 3.95
SNX15-202ENST00000377244 TIAM1Q13009 1591 aa39.7■■■■□ 3.95
SNX15-202ENST00000377244 UACAQ9BZF9 1416 aa39.7■■■■□ 3.95
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SNX15-202ENST00000377244 ABCC2Q92887 1545 aa39.62■■■■□ 3.93
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SNX15-202ENST00000377244 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.35■■■■□ 3.89
SNX15-202ENST00000377244 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
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SNX15-202ENST00000377244 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
SNX15-202ENST00000377244 NCOA2Q15596 1464 aa39.18■■■■□ 3.86
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SNX15-202ENST00000377244 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.16■■■■□ 3.86
SNX15-202ENST00000377244 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.15■■■■□ 3.86
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SNX15-202ENST00000377244 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.94■■■■□ 3.82
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SNX15-202ENST00000377244 MIA2Q96PC5 1412 aa38.75■■■■□ 3.79
SNX15-202ENST00000377244 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.74■■■■□ 3.79
SNX15-202ENST00000377244 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
SNX15-202ENST00000377244 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
SNX15-202ENST00000377244 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
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