RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.37■■■□□ 2.29
USP11-202ENST00000377078 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
USP11-202ENST00000377078 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.34■■■□□ 2.29
USP11-202ENST00000377078 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.3■■■□□ 2.28
USP11-202ENST00000377078 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.12■■■□□ 2.25
USP11-202ENST00000377078 IQGAP2Q13576 1575 aa29.08■■■□□ 2.25
USP11-202ENST00000377078 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.07■■■□□ 2.24
USP11-202ENST00000377078 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
USP11-202ENST00000377078 PTPRGP23470 1445 aa28.98■■■□□ 2.23
USP11-202ENST00000377078 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.96■■■□□ 2.23
USP11-202ENST00000377078 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.92■■■□□ 2.22
USP11-202ENST00000377078 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
USP11-202ENST00000377078 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.89■■■□□ 2.22
USP11-202ENST00000377078 PRXQ9BXM0 1461 aa28.88■■■□□ 2.21
USP11-202ENST00000377078 MAPKBP1O60336 1514 aa28.87■■■□□ 2.21
USP11-202ENST00000377078 DISP1Q96F81 1524 aa28.85■■■□□ 2.21
USP11-202ENST00000377078 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.83■■■□□ 2.21
USP11-202ENST00000377078 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.79■■■□□ 2.2
USP11-202ENST00000377078 EEA1Q15075 1411 aa28.79■■■□□ 2.2
USP11-202ENST00000377078 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.79■■■□□ 2.2
USP11-202ENST00000377078 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.78■■■□□ 2.2
USP11-202ENST00000377078 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.78■■■□□ 2.2
USP11-202ENST00000377078 KIAA0556O60303 1618 aa28.78■■■□□ 2.2
USP11-202ENST00000377078 GOLGA3Q08378 1498 aa28.77■■■□□ 2.2
USP11-202ENST00000377078 ABCC2Q92887 1545 aa28.76■■■□□ 2.19
USP11-202ENST00000377078 UACAQ9BZF9 1416 aa28.76■■■□□ 2.19
USP11-202ENST00000377078 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.75■■■□□ 2.19
USP11-202ENST00000377078 DIP2BQ9P265 1576 aa28.71■■■□□ 2.19
USP11-202ENST00000377078 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
USP11-202ENST00000377078 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.65■■■□□ 2.18
USP11-202ENST00000377078 ASXL2Q76L83 1435 aa28.61■■■□□ 2.17
USP11-202ENST00000377078 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.59■■■□□ 2.17
USP11-202ENST00000377078 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.53■■■□□ 2.16
USP11-202ENST00000377078 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
USP11-202ENST00000377078 GLI2P10070 1586 aa28.49■■■□□ 2.15
USP11-202ENST00000377078 ABCA8O94911 1581 aa28.48■■■□□ 2.15
USP11-202ENST00000377078 TSPOAP1O95153 1857 aa28.47■■■□□ 2.15
USP11-202ENST00000377078 P3H3Q8IVL6 736 aa28.46■■■□□ 2.15
USP11-202ENST00000377078 KIF21BO75037 1637 aa28.46■■■□□ 2.15
USP11-202ENST00000377078 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
USP11-202ENST00000377078 SAMD9Q5K651 1589 aa28.43■■■□□ 2.14
USP11-202ENST00000377078 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.42■■■□□ 2.14
USP11-202ENST00000377078 KDM6BO15054 1643 aa28.4■■■□□ 2.14
USP11-202ENST00000377078 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
USP11-202ENST00000377078 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
USP11-202ENST00000377078 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.32■■■□□ 2.12
USP11-202ENST00000377078 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.32■■■□□ 2.12
USP11-202ENST00000377078 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
USP11-202ENST00000377078 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.29■■■□□ 2.12
USP11-202ENST00000377078 KCNH8Q96L42 1107 aa28.28■■■□□ 2.12
USP11-202ENST00000377078 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
USP11-202ENST00000377078 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.27■■■□□ 2.12
USP11-202ENST00000377078 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.26■■■□□ 2.12
USP11-202ENST00000377078 ARID3CA6NKF2 412 aa28.26■■■□□ 2.11
USP11-202ENST00000377078 ATP10BO94823 1461 aa28.25■■■□□ 2.11
USP11-202ENST00000377078 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.24■■■□□ 2.11
USP11-202ENST00000377078 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
USP11-202ENST00000377078 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
USP11-202ENST00000377078 CD109Q6YHK3 1445 aa28.21■■■□□ 2.11
USP11-202ENST00000377078 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.2■■■□□ 2.11
USP11-202ENST00000377078 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.16■■■□□ 2.1
USP11-202ENST00000377078 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
USP11-202ENST00000377078 FMN1Q68DA7 1419 aa28.07■■■□□ 2.08
USP11-202ENST00000377078 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
USP11-202ENST00000377078 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.06■■■□□ 2.08
USP11-202ENST00000377078 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.04■■■□□ 2.08
USP11-202ENST00000377078 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.02■■■□□ 2.08
USP11-202ENST00000377078 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.99■■■□□ 2.07
USP11-202ENST00000377078 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
USP11-202ENST00000377078 HECW1Q76N89 1606 aa27.95■■■□□ 2.06
USP11-202ENST00000377078 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.92■■■□□ 2.06
USP11-202ENST00000377078 NEO1Q92859 1461 aa27.91■■■□□ 2.06
USP11-202ENST00000377078 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
USP11-202ENST00000377078 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.9■■■□□ 2.06
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USP11-202ENST00000377078 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
USP11-202ENST00000377078 ADGRL1O94910 1474 aa27.82■■■□□ 2.04
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USP11-202ENST00000377078 FANCAO15360 1455 aa27.77■■■□□ 2.04
USP11-202ENST00000377078 CLIP1P30622 1438 aa27.77■■■□□ 2.04
USP11-202ENST00000377078 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.77■■■□□ 2.04
USP11-202ENST00000377078 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.75■■■□□ 2.03
USP11-202ENST00000377078 RAPGEF3O95398 923 aa27.75■■■□□ 2.03
USP11-202ENST00000377078 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.73■■■□□ 2.03
USP11-202ENST00000377078 AKNAQ7Z591 1439 aa27.73■■■□□ 2.03
USP11-202ENST00000377078 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
USP11-202ENST00000377078 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
USP11-202ENST00000377078 KIF14Q15058 1648 aa27.7■■■□□ 2.03
USP11-202ENST00000377078 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
USP11-202ENST00000377078 PLCH2O75038 1416 aa27.69■■■□□ 2.02
USP11-202ENST00000377078 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.68■■■□□ 2.02
USP11-202ENST00000377078 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.65■■■□□ 2.02
USP11-202ENST00000377078 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.64■■■□□ 2.02
USP11-202ENST00000377078 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.64■■■□□ 2.01
USP11-202ENST00000377078 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.63■■■□□ 2.01
USP11-202ENST00000377078 RICTORQ6R327 1708 aa27.6■■■□□ 2.01
USP11-202ENST00000377078 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.57■■■□□ 2
USP11-202ENST00000377078 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.57■■■□□ 2
USP11-202ENST00000377078 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
USP11-202ENST00000377078 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.55■■■□□ 2
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