RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376504.3

PTF1A-201, Transcript of pancreas associated transcription factor 1a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTF1A, Length 1,537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1A-201ENST00000376504 CEP170Q5SW79 1584 aa51.69■■■■■ 5.86
PTF1A-201ENST00000376504 NUP160Q12769 1436 aa51.67■■■■■ 5.86
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PTF1A-201ENST00000376504 IQGAP2Q13576 1575 aa51.45■■■■■ 5.83
PTF1A-201ENST00000376504 CEP162Q5TB80 1403 aa51.36■■■■■ 5.81
PTF1A-201ENST00000376504 CLASP1Q7Z460 1538 aa51.34■■■■■ 5.81
PTF1A-201ENST00000376504 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP51.25■■■■■ 5.79
PTF1A-201ENST00000376504 OSCARQ8IYS5 282 aa51.23■■■■■ 5.79
PTF1A-201ENST00000376504 CLIP1P30622 1438 aa51.22■■■■■ 5.79
PTF1A-201ENST00000376504 UGGT2Q9NYU1 1516 aa51.22■■■■■ 5.79
PTF1A-201ENST00000376504 SHROOM2Q13796 1616 aa51.15■■■■■ 5.78
PTF1A-201ENST00000376504 SAMD9Q5K651 1589 aa51.12■■■■■ 5.77
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PTF1A-201ENST00000376504 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa51.12■■■■■ 5.77
PTF1A-201ENST00000376504 EFCAB5A4FU69 1503 aa51.09■■■■■ 5.77
PTF1A-201ENST00000376504 DISP1Q96F81 1524 aa51.01■■■■■ 5.76
PTF1A-201ENST00000376504 KIAA0556O60303 1618 aa50.97■■■■■ 5.75
PTF1A-201ENST00000376504 ARAP1Q96P48 1450 aa50.94■■■■■ 5.74
PTF1A-201ENST00000376504 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP50.92■■■■■ 5.74
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PTF1A-201ENST00000376504 FHOD3Q2V2M9 1422 aa50.86■■■■■ 5.73
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PTF1A-201ENST00000376504 ERCC6L2Q5T890 1561 aa50.83■■■■■ 5.73
PTF1A-201ENST00000376504 VPS8Q8N3P4 1428 aa50.63■■■■■ 5.7
PTF1A-201ENST00000376504 FMN1Q68DA7 1419 aa50.56■■■■■ 5.68
PTF1A-201ENST00000376504 ARHGEF11O15085 1522 aa50.48■■■■■ 5.67
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PTF1A-201ENST00000376504 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.37■■■■■ 5.65
PTF1A-201ENST00000376504 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.37■■■■■ 5.65
PTF1A-201ENST00000376504 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa50.37■■■■■ 5.65
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PTF1A-201ENST00000376504 PLB1Q6P1J6 1458 aa50.32■■■■■ 5.65
PTF1A-201ENST00000376504 FYCO1Q9BQS8 1478 aa50.32■■■■■ 5.65
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PTF1A-201ENST00000376504 HECW1Q76N89 1606 aa50.22■■■■■ 5.63
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PTF1A-201ENST00000376504 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP50.15■■■■■ 5.62
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PTF1A-201ENST00000376504 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa50.07■■■■■ 5.61
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PTF1A-201ENST00000376504 TIAM1Q13009 1591 aa50■■■■■ 5.59
PTF1A-201ENST00000376504 MAP3K1Q13233 1512 aa49.99■■■■■ 5.59
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PTF1A-201ENST00000376504 ARID3CA6NKF2 412 aa49.92■■■■■ 5.58
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PTF1A-201ENST00000376504 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP49.58■■■■■ 5.53
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PTF1A-201ENST00000376504 WDR7Q9Y4E6 1490 aa49.38■■■■■ 5.5
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PTF1A-201ENST00000376504 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.84■■■■■ 5.41
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PTF1A-201ENST00000376504 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP48.82■■■■■ 5.41
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