RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000374548.5

EDA-202, Transcript of ectodysplasin A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene EDA, Length 1,116 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDA-202ENST00000374548 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.7■■■■■ 4.59
EDA-202ENST00000374548 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
EDA-202ENST00000374548 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
EDA-202ENST00000374548 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.6■■■■■ 4.57
EDA-202ENST00000374548 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.45■■■■■ 4.55
EDA-202ENST00000374548 IQGAP2Q13576 1575 aa43.29■■■■■ 4.52
EDA-202ENST00000374548 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.22■■■■■ 4.51
EDA-202ENST00000374548 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
EDA-202ENST00000374548 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.15■■■■■ 4.5
EDA-202ENST00000374548 PTPRGP23470 1445 aa43.12■■■■■ 4.49
EDA-202ENST00000374548 PRXQ9BXM0 1461 aa43.12■■■■■ 4.49
EDA-202ENST00000374548 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.09■■■■■ 4.49
EDA-202ENST00000374548 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.09■■■■■ 4.49
EDA-202ENST00000374548 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.02■■■■■ 4.48
EDA-202ENST00000374548 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.01■■■■■ 4.48
EDA-202ENST00000374548 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.01■■■■■ 4.48
EDA-202ENST00000374548 EEA1Q15075 1411 aa42.99■■■■■ 4.47
EDA-202ENST00000374548 DISP1Q96F81 1524 aa42.99■■■■■ 4.47
EDA-202ENST00000374548 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
EDA-202ENST00000374548 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.92■■■■■ 4.46
EDA-202ENST00000374548 KIAA0556O60303 1618 aa42.87■■■■■ 4.45
EDA-202ENST00000374548 MAPKBP1O60336 1514 aa42.81■■■■■ 4.44
EDA-202ENST00000374548 GOLGA3Q08378 1498 aa42.81■■■■■ 4.44
EDA-202ENST00000374548 UACAQ9BZF9 1416 aa42.8■■■■■ 4.44
EDA-202ENST00000374548 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.75■■■■■ 4.43
EDA-202ENST00000374548 ABCC2Q92887 1545 aa42.73■■■■■ 4.43
EDA-202ENST00000374548 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.73■■■■■ 4.43
EDA-202ENST00000374548 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.72■■■■■ 4.43
EDA-202ENST00000374548 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.71■■■■■ 4.43
EDA-202ENST00000374548 P3H3Q8IVL6 736 aa42.6■■■■■ 4.41
EDA-202ENST00000374548 DIP2BQ9P265 1576 aa42.6■■■■■ 4.41
EDA-202ENST00000374548 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
EDA-202ENST00000374548 ASXL2Q76L83 1435 aa42.54■■■■■ 4.4
EDA-202ENST00000374548 KIF21BO75037 1637 aa42.54■■■■■ 4.4
EDA-202ENST00000374548 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.53■■■■■ 4.4
EDA-202ENST00000374548 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.51■■■■■ 4.4
EDA-202ENST00000374548 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.49■■■■■ 4.39
EDA-202ENST00000374548 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
EDA-202ENST00000374548 ABCA8O94911 1581 aa42.42■■■■■ 4.38
EDA-202ENST00000374548 SAMD9Q5K651 1589 aa42.4■■■■■ 4.38
EDA-202ENST00000374548 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
EDA-202ENST00000374548 TSPOAP1O95153 1857 aa42.34■■■■■ 4.37
EDA-202ENST00000374548 GLI2P10070 1586 aa42.27■■■■■ 4.36
EDA-202ENST00000374548 ARID3CA6NKF2 412 aa42.26■■■■■ 4.36
EDA-202ENST00000374548 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
EDA-202ENST00000374548 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.23■■■■■ 4.35
EDA-202ENST00000374548 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.23■■■■■ 4.35
EDA-202ENST00000374548 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.17■■■■■ 4.34
EDA-202ENST00000374548 KCNH8Q96L42 1107 aa42.17■■■■■ 4.34
EDA-202ENST00000374548 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.15■■■■■ 4.34
EDA-202ENST00000374548 ATP10BO94823 1461 aa42.11■■■■■ 4.33
EDA-202ENST00000374548 KDM6BO15054 1643 aa42.1■■■■■ 4.33
EDA-202ENST00000374548 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
EDA-202ENST00000374548 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
EDA-202ENST00000374548 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.06■■■■■ 4.32
EDA-202ENST00000374548 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
EDA-202ENST00000374548 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.98■■■■■ 4.31
EDA-202ENST00000374548 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
EDA-202ENST00000374548 CD109Q6YHK3 1445 aa41.95■■■■■ 4.31
EDA-202ENST00000374548 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.9■■■■■ 4.3
EDA-202ENST00000374548 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.9■■■■■ 4.3
EDA-202ENST00000374548 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
EDA-202ENST00000374548 FMN1Q68DA7 1419 aa41.84■■■■■ 4.29
EDA-202ENST00000374548 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.82■■■■■ 4.29
EDA-202ENST00000374548 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.8■■■■■ 4.28
EDA-202ENST00000374548 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
EDA-202ENST00000374548 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
EDA-202ENST00000374548 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.7■■■■■ 4.27
EDA-202ENST00000374548 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
EDA-202ENST00000374548 HECW1Q76N89 1606 aa41.66■■■■■ 4.26
EDA-202ENST00000374548 CLIP1P30622 1438 aa41.56■■■■■ 4.24
EDA-202ENST00000374548 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
EDA-202ENST00000374548 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.5■■■■■ 4.23
EDA-202ENST00000374548 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
EDA-202ENST00000374548 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.45■■■■■ 4.23
EDA-202ENST00000374548 NEO1Q92859 1461 aa41.45■■■■■ 4.23
EDA-202ENST00000374548 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.44■■■■■ 4.22
EDA-202ENST00000374548 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
EDA-202ENST00000374548 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.39■■■■■ 4.22
EDA-202ENST00000374548 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.35■■■■■ 4.21
EDA-202ENST00000374548 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.35■■■■■ 4.21
EDA-202ENST00000374548 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.34■■■■■ 4.21
EDA-202ENST00000374548 RAPGEF3O95398 923 aa41.33■■■■■ 4.21
EDA-202ENST00000374548 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
EDA-202ENST00000374548 FANCAO15360 1455 aa41.32■■■■■ 4.2
EDA-202ENST00000374548 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.3■■■■■ 4.2
EDA-202ENST00000374548 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.29■■■■■ 4.2
EDA-202ENST00000374548 AKNAQ7Z591 1439 aa41.28■■■■■ 4.2
EDA-202ENST00000374548 KIF14Q15058 1648 aa41.27■■■■■ 4.2
EDA-202ENST00000374548 CEP162Q5TB80 1403 aa41.25■■■■■ 4.19
EDA-202ENST00000374548 PLCH2O75038 1416 aa41.24■■■■■ 4.19
EDA-202ENST00000374548 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.23■■■■■ 4.19
EDA-202ENST00000374548 ADGRL1O94910 1474 aa41.21■■■■■ 4.19
EDA-202ENST00000374548 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
EDA-202ENST00000374548 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.17■■■■■ 4.18
EDA-202ENST00000374548 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.16■■■■■ 4.18
EDA-202ENST00000374548 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.12■■■■■ 4.17
EDA-202ENST00000374548 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.07■■■■■ 4.16
EDA-202ENST00000374548 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.06■■■■■ 4.16
EDA-202ENST00000374548 RICTORQ6R327 1708 aa41.04■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.6 ms