RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.5■■■■□ 3.27
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP3K1Q13233 1512 aa35.48■■■■□ 3.27
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.45■■■■□ 3.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.41■■■■□ 3.26
AMIGO1-201ENST00000369862 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.4■■■■□ 3.26
AMIGO1-201ENST00000369862 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.39■■■■□ 3.26
AMIGO1-201ENST00000369862 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.39■■■■□ 3.26
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.38■■■■□ 3.26
AMIGO1-201ENST00000369862 P3H3Q8IVL6 736 aa35.37■■■■□ 3.25
AMIGO1-201ENST00000369862 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
AMIGO1-201ENST00000369862 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.34■■■■□ 3.25
AMIGO1-201ENST00000369862 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.33■■■■□ 3.25
AMIGO1-201ENST00000369862 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.33■■■■□ 3.25
AMIGO1-201ENST00000369862 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.31■■■■□ 3.24
AMIGO1-201ENST00000369862 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
AMIGO1-201ENST00000369862 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.3■■■■□ 3.24
AMIGO1-201ENST00000369862 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.21■■■■□ 3.23
AMIGO1-201ENST00000369862 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.19■■■■□ 3.22
AMIGO1-201ENST00000369862 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.18■■■■□ 3.22
AMIGO1-201ENST00000369862 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.17■■■■□ 3.22
AMIGO1-201ENST00000369862 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.22
AMIGO1-201ENST00000369862 ITGAEP38570 1179 aa35.14■■■■□ 3.22
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
AMIGO1-201ENST00000369862 SAMD9Q5K651 1589 aa35.09■■■■□ 3.21
AMIGO1-201ENST00000369862 FMN1Q68DA7 1419 aa35.06■■■■□ 3.2
AMIGO1-201ENST00000369862 MIER1Q8N108 512 aa35.06■■■■□ 3.2
AMIGO1-201ENST00000369862 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.05■■■■□ 3.2
AMIGO1-201ENST00000369862 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.01■■■■□ 3.2
AMIGO1-201ENST00000369862 PBRM1Q86U86 1689 aa35■■■■□ 3.19
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.98■■■■□ 3.19
AMIGO1-201ENST00000369862 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.92■■■■□ 3.18
AMIGO1-201ENST00000369862 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.89■■■■□ 3.18
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIN2BQ13224 1484 aa34.87■■■■□ 3.17
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAMTS12P58397 1594 aa34.86■■■■□ 3.17
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPKBP1O60336 1514 aa34.82■■■■□ 3.16
AMIGO1-201ENST00000369862 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.79■■■■□ 3.16
AMIGO1-201ENST00000369862 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR62O43379 1518 aa34.77■■■■□ 3.16
AMIGO1-201ENST00000369862 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.77■■■■□ 3.16
AMIGO1-201ENST00000369862 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.76■■■■□ 3.15
AMIGO1-201ENST00000369862 IQGAP2Q13576 1575 aa34.75■■■■□ 3.15
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
AMIGO1-201ENST00000369862 IFT140Q96RY7 1462 aa34.74■■■■□ 3.15
AMIGO1-201ENST00000369862 NCOA2Q15596 1464 aa34.66■■■■□ 3.14
AMIGO1-201ENST00000369862 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.64■■■■□ 3.14
AMIGO1-201ENST00000369862 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
AMIGO1-201ENST00000369862 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.61■■■■□ 3.13
AMIGO1-201ENST00000369862 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.59■■■■□ 3.13
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.58■■■■□ 3.13
AMIGO1-201ENST00000369862 HECW1Q76N89 1606 aa34.58■■■■□ 3.13
AMIGO1-201ENST00000369862 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.56■■■■□ 3.12
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPRKQ15262 1439 aa34.55■■■■□ 3.12
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF11O15085 1522 aa34.55■■■■□ 3.12
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
AMIGO1-201ENST00000369862 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
AMIGO1-201ENST00000369862 ERCC6Q03468 1493 aa34.49■■■■□ 3.11
AMIGO1-201ENST00000369862 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.47■■■■□ 3.11
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.46■■■■□ 3.11
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.45■■■■□ 3.11
AMIGO1-201ENST00000369862 HFM1A2PYH4 1435 aa34.44■■■■□ 3.1
AMIGO1-201ENST00000369862 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIN2AQ12879 1464 aa34.43■■■■□ 3.1
AMIGO1-201ENST00000369862 DISP1Q96F81 1524 aa34.4■■■■□ 3.1
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA0556O60303 1618 aa34.4■■■■□ 3.1
AMIGO1-201ENST00000369862 NAIPQ13075 1403 aa34.35■■■■□ 3.09
AMIGO1-201ENST00000369862 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
AMIGO1-201ENST00000369862 MYT1Q01538 1121 aa34.34■■■■□ 3.09
AMIGO1-201ENST00000369862 ARID3CA6NKF2 412 aa34.31■■■■□ 3.08
AMIGO1-201ENST00000369862 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
AMIGO1-201ENST00000369862 UACAQ9BZF9 1416 aa34.3■■■■□ 3.08
AMIGO1-201ENST00000369862 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.27■■■■□ 3.08
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP170Q5SW79 1584 aa34.23■■■■□ 3.07
AMIGO1-201ENST00000369862 SYNJ2O15056 1496 aa34.23■■■■□ 3.07
AMIGO1-201ENST00000369862 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
AMIGO1-201ENST00000369862 MIA2Q96PC5 1412 aa34.21■■■■□ 3.07
AMIGO1-201ENST00000369862 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.21■■■■□ 3.07
AMIGO1-201ENST00000369862 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
AMIGO1-201ENST00000369862 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.17■■■■□ 3.06
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
AMIGO1-201ENST00000369862 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.14■■■■□ 3.06
AMIGO1-201ENST00000369862 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.14■■■■□ 3.06
AMIGO1-201ENST00000369862 AKNAQ7Z591 1439 aa34.1■■■■□ 3.05
AMIGO1-201ENST00000369862 FBLN2P98095 1184 aa34.08■■■■□ 3.05
AMIGO1-201ENST00000369862 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
AMIGO1-201ENST00000369862 NUP160Q12769 1436 aa34.07■■■■□ 3.04
AMIGO1-201ENST00000369862 KDM6BO15054 1643 aa34.07■■■■□ 3.04
AMIGO1-201ENST00000369862 TONSLQ96HA7 1378 aa34.04■■■■□ 3.04
AMIGO1-201ENST00000369862 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.02■■■■□ 3.04
AMIGO1-201ENST00000369862 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
AMIGO1-201ENST00000369862 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
AMIGO1-201ENST00000369862 JPH4Q96JJ6 628 aa33.96■■■■□ 3.03
AMIGO1-201ENST00000369862 DAPK1P53355 1430 aa33.96■■■■□ 3.03
AMIGO1-201ENST00000369862 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
AMIGO1-201ENST00000369862 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
AMIGO1-201ENST00000369862 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
AMIGO1-201ENST00000369862 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.94■■■■□ 3.02
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