RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.18■■■■■ 5.3
ECHS1-201ENST00000368547 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.17■■■■■ 5.3
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.15■■■■■ 5.3
ECHS1-201ENST00000368547 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.13■■■■■ 5.3
ECHS1-201ENST00000368547 IQGAP2Q13576 1575 aa48.06■■■■■ 5.28
ECHS1-201ENST00000368547 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.92■■■■■ 5.26
ECHS1-201ENST00000368547 SHROOM2Q13796 1616 aa47.91■■■■■ 5.26
ECHS1-201ENST00000368547 JPH4Q96JJ6 628 aa47.89■■■■■ 5.26
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.89■■■■■ 5.26
ECHS1-201ENST00000368547 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.8■■■■■ 5.24
ECHS1-201ENST00000368547 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
ECHS1-201ENST00000368547 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.73■■■■■ 5.23
ECHS1-201ENST00000368547 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.66■■■■■ 5.22
ECHS1-201ENST00000368547 DISP1Q96F81 1524 aa47.64■■■■■ 5.22
ECHS1-201ENST00000368547 SAMD9Q5K651 1589 aa47.61■■■■■ 5.21
ECHS1-201ENST00000368547 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.6■■■■■ 5.21
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0556O60303 1618 aa47.59■■■■■ 5.21
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF11O15085 1522 aa47.57■■■■■ 5.21
ECHS1-201ENST00000368547 CEP162Q5TB80 1403 aa47.57■■■■■ 5.21
ECHS1-201ENST00000368547 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.55■■■■■ 5.2
ECHS1-201ENST00000368547 CLIP1P30622 1438 aa47.53■■■■■ 5.2
ECHS1-201ENST00000368547 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.5■■■■■ 5.19
ECHS1-201ENST00000368547 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.5■■■■■ 5.19
ECHS1-201ENST00000368547 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.5■■■■■ 5.19
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.5■■■■■ 5.19
ECHS1-201ENST00000368547 P3H3Q8IVL6 736 aa47.49■■■■■ 5.19
ECHS1-201ENST00000368547 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.38■■■■■ 5.18
ECHS1-201ENST00000368547 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.32■■■■■ 5.17
ECHS1-201ENST00000368547 ARAP1Q96P48 1450 aa47.29■■■■■ 5.16
ECHS1-201ENST00000368547 PTPRGP23470 1445 aa47.27■■■■■ 5.16
ECHS1-201ENST00000368547 FMN1Q68DA7 1419 aa47.1■■■■■ 5.13
ECHS1-201ENST00000368547 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.09■■■■■ 5.13
ECHS1-201ENST00000368547 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.04■■■■■ 5.12
ECHS1-201ENST00000368547 ABCA8O94911 1581 aa47■■■■■ 5.11
ECHS1-201ENST00000368547 UACAQ9BZF9 1416 aa46.99■■■■■ 5.11
ECHS1-201ENST00000368547 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.97■■■■■ 5.11
ECHS1-201ENST00000368547 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.91■■■■■ 5.1
ECHS1-201ENST00000368547 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.9■■■■■ 5.1
ECHS1-201ENST00000368547 ABCC2Q92887 1545 aa46.9■■■■■ 5.1
ECHS1-201ENST00000368547 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
ECHS1-201ENST00000368547 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.87■■■■■ 5.09
ECHS1-201ENST00000368547 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.84■■■■■ 5.09
ECHS1-201ENST00000368547 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.8■■■■■ 5.08
ECHS1-201ENST00000368547 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.8■■■■■ 5.08
ECHS1-201ENST00000368547 HECW1Q76N89 1606 aa46.79■■■■■ 5.08
ECHS1-201ENST00000368547 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP46.78■■■■■ 5.08
ECHS1-201ENST00000368547 ARID3CA6NKF2 412 aa46.7■■■■■ 5.07
ECHS1-201ENST00000368547 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.7■■■■■ 5.07
ECHS1-201ENST00000368547 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.66■■■■■ 5.06
ECHS1-201ENST00000368547 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.06
ECHS1-201ENST00000368547 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.05
ECHS1-201ENST00000368547 ATP10BO94823 1461 aa46.62■■■■■ 5.05
ECHS1-201ENST00000368547 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.59■■■■■ 5.05
ECHS1-201ENST00000368547 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.55■■■■■ 5.04
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.42■■■■■ 5.02
ECHS1-201ENST00000368547 TIAM1Q13009 1591 aa46.4■■■■■ 5.02
ECHS1-201ENST00000368547 APLP2Q06481 763 aa46.37■■■■■ 5.01
ECHS1-201ENST00000368547 MAPKBP1O60336 1514 aa46.37■■■■■ 5.01
ECHS1-201ENST00000368547 MAP3K1Q13233 1512 aa46.35■■■■■ 5.01
ECHS1-201ENST00000368547 ASXL2Q76L83 1435 aa46.34■■■■■ 5.01
ECHS1-201ENST00000368547 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.32■■■■■ 5
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.29■■■■■ 5
ECHS1-201ENST00000368547 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.27■■■■■ 5
ECHS1-201ENST00000368547 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.26■■■■■ 5
ECHS1-201ENST00000368547 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.19■■■■■ 4.98
ECHS1-201ENST00000368547 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.19■■■■■ 4.98
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa46.17■■■■■ 4.98
ECHS1-201ENST00000368547 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP46.17■■■■■ 4.98
ECHS1-201ENST00000368547 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.14■■■■■ 4.98
ECHS1-201ENST00000368547 KCNH8Q96L42 1107 aa46.13■■■■■ 4.97
ECHS1-201ENST00000368547 KIF14Q15058 1648 aa46.05■■■■■ 4.96
ECHS1-201ENST00000368547 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.02■■■■■ 4.96
ECHS1-201ENST00000368547 DIP2BQ9P265 1576 aa46.02■■■■■ 4.96
ECHS1-201ENST00000368547 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.99■■■■■ 4.95
ECHS1-201ENST00000368547 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
ECHS1-201ENST00000368547 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.95■■■■■ 4.95
ECHS1-201ENST00000368547 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.93■■■■■ 4.94
ECHS1-201ENST00000368547 GLI2P10070 1586 aa45.92■■■■■ 4.94
ECHS1-201ENST00000368547 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.91■■■■■ 4.94
ECHS1-201ENST00000368547 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.9■■■■■ 4.94
ECHS1-201ENST00000368547 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.9■■■■■ 4.94
ECHS1-201ENST00000368547 NCOA2Q15596 1464 aa45.88■■■■■ 4.93
ECHS1-201ENST00000368547 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
ECHS1-201ENST00000368547 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.8■■■■■ 4.92
ECHS1-201ENST00000368547 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.75■■■■■ 4.91
ECHS1-201ENST00000368547 CD109Q6YHK3 1445 aa45.73■■■■■ 4.91
ECHS1-201ENST00000368547 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.73■■■■■ 4.91
ECHS1-201ENST00000368547 CCNB3Q8WWL7 1395 aa45.73■■■■■ 4.91
ECHS1-201ENST00000368547 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
ECHS1-201ENST00000368547 TSPOAP1O95153 1857 aa45.67■■■■■ 4.9
ECHS1-201ENST00000368547 PREX2Q70Z35 1606 aa45.66■■■■■ 4.9
ECHS1-201ENST00000368547 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.65■■■■■ 4.9
ECHS1-201ENST00000368547 ITSN2Q9NZM3 1697 aa45.65■■■■■ 4.9
ECHS1-201ENST00000368547 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa45.64■■■■■ 4.9
ECHS1-201ENST00000368547 PLCH2O75038 1416 aa45.64■■■■■ 4.9
ECHS1-201ENST00000368547 MYOM3Q5VTT5 1437 aa45.59■■■■■ 4.89
ECHS1-201ENST00000368547 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms