RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368102.5

SNHG28-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SNHG28, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28-201ENST00000368102 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SNHG28-201ENST00000368102 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SNHG28-201ENST00000368102 CUL7Q14999 1698 aa20.82■□□□□ 0.92
SNHG28-201ENST00000368102 P3H3Q8IVL6 736 aa20.82■□□□□ 0.92
SNHG28-201ENST00000368102 ERCC6Q03468 1493 aa20.82■□□□□ 0.92
SNHG28-201ENST00000368102 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SNHG28-201ENST00000368102 WDR97A6NE52 1622 aa20.81■□□□□ 0.92
SNHG28-201ENST00000368102 MIER1Q8N108 512 aa20.78■□□□□ 0.92
SNHG28-201ENST00000368102 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.77■□□□□ 0.92
SNHG28-201ENST00000368102 MAP3K1Q13233 1512 aa20.77■□□□□ 0.92
SNHG28-201ENST00000368102 TIAM1Q13009 1591 aa20.77■□□□□ 0.91
SNHG28-201ENST00000368102 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.76■□□□□ 0.91
SNHG28-201ENST00000368102 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.76■□□□□ 0.91
SNHG28-201ENST00000368102 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.74■□□□□ 0.91
SNHG28-201ENST00000368102 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.74■□□□□ 0.91
SNHG28-201ENST00000368102 ITGAEP38570 1179 aa20.73■□□□□ 0.91
SNHG28-201ENST00000368102 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.71■□□□□ 0.91
SNHG28-201ENST00000368102 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.7■□□□□ 0.9
SNHG28-201ENST00000368102 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SNHG28-201ENST00000368102 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SNHG28-201ENST00000368102 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SNHG28-201ENST00000368102 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.69■□□□□ 0.9
SNHG28-201ENST00000368102 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SNHG28-201ENST00000368102 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.63■□□□□ 0.89
SNHG28-201ENST00000368102 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.63■□□□□ 0.89
SNHG28-201ENST00000368102 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.62■□□□□ 0.89
SNHG28-201ENST00000368102 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.62■□□□□ 0.89
SNHG28-201ENST00000368102 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
SNHG28-201ENST00000368102 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.61■□□□□ 0.89
SNHG28-201ENST00000368102 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.6■□□□□ 0.89
SNHG28-201ENST00000368102 FMN1Q68DA7 1419 aa20.59■□□□□ 0.89
SNHG28-201ENST00000368102 SAMD9Q5K651 1589 aa20.54■□□□□ 0.88
SNHG28-201ENST00000368102 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SNHG28-201ENST00000368102 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.53■□□□□ 0.88
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SNHG28-201ENST00000368102 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SNHG28-201ENST00000368102 PBRM1Q86U86 1689 aa20.5■□□□□ 0.87
SNHG28-201ENST00000368102 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.48■□□□□ 0.87
SNHG28-201ENST00000368102 GRIN2BQ13224 1484 aa20.48■□□□□ 0.87
SNHG28-201ENST00000368102 WDR62O43379 1518 aa20.47■□□□□ 0.87
SNHG28-201ENST00000368102 IFT140Q96RY7 1462 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG28-201ENST00000368102 ADAMTS12P58397 1594 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG28-201ENST00000368102 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.44■□□□□ 0.86
SNHG28-201ENST00000368102 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.44■□□□□ 0.86
SNHG28-201ENST00000368102 IQGAP2Q13576 1575 aa20.39■□□□□ 0.86
SNHG28-201ENST00000368102 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
SNHG28-201ENST00000368102 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.37■□□□□ 0.85
SNHG28-201ENST00000368102 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.37■□□□□ 0.85
SNHG28-201ENST00000368102 MAPKBP1O60336 1514 aa20.37■□□□□ 0.85
SNHG28-201ENST00000368102 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.33■□□□□ 0.84
SNHG28-201ENST00000368102 FBLN2P98095 1184 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG28-201ENST00000368102 NCOA2Q15596 1464 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG28-201ENST00000368102 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG28-201ENST00000368102 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG28-201ENST00000368102 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG28-201ENST00000368102 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG28-201ENST00000368102 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SNHG28-201ENST00000368102 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG28-201ENST00000368102 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG28-201ENST00000368102 KCNH8Q96L42 1107 aa20.26■□□□□ 0.83
SNHG28-201ENST00000368102 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SNHG28-201ENST00000368102 HECW1Q76N89 1606 aa20.26■□□□□ 0.83
SNHG28-201ENST00000368102 GRIN2AQ12879 1464 aa20.25■□□□□ 0.83
SNHG28-201ENST00000368102 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SNHG28-201ENST00000368102 PTPRKQ15262 1439 aa20.24■□□□□ 0.83
SNHG28-201ENST00000368102 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SNHG28-201ENST00000368102 ARHGEF11O15085 1522 aa20.22■□□□□ 0.83
SNHG28-201ENST00000368102 ARID3CA6NKF2 412 aa20.21■□□□□ 0.83
SNHG28-201ENST00000368102 DISP1Q96F81 1524 aa20.21■□□□□ 0.83
SNHG28-201ENST00000368102 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SNHG28-201ENST00000368102 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SNHG28-201ENST00000368102 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SNHG28-201ENST00000368102 HFM1A2PYH4 1435 aa20.18■□□□□ 0.82
SNHG28-201ENST00000368102 KIAA0556O60303 1618 aa20.17■□□□□ 0.82
SNHG28-201ENST00000368102 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.16■□□□□ 0.82
SNHG28-201ENST00000368102 SYNJ2O15056 1496 aa20.15■□□□□ 0.82
SNHG28-201ENST00000368102 NAIPQ13075 1403 aa20.13■□□□□ 0.81
SNHG28-201ENST00000368102 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SNHG28-201ENST00000368102 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SNHG28-201ENST00000368102 CEP170Q5SW79 1584 aa20.1■□□□□ 0.81
SNHG28-201ENST00000368102 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SNHG28-201ENST00000368102 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG28-201ENST00000368102 UACAQ9BZF9 1416 aa20.08■□□□□ 0.81
SNHG28-201ENST00000368102 MIA2Q96PC5 1412 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG28-201ENST00000368102 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG28-201ENST00000368102 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SNHG28-201ENST00000368102 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG28-201ENST00000368102 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG28-201ENST00000368102 NUP160Q12769 1436 aa20.04■□□□□ 0.8
SNHG28-201ENST00000368102 JPH4Q96JJ6 628 aa20.04■□□□□ 0.8
SNHG28-201ENST00000368102 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SNHG28-201ENST00000368102 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SNHG28-201ENST00000368102 PLB1Q6P1J6 1458 aa20■□□□□ 0.79
SNHG28-201ENST00000368102 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20■□□□□ 0.79
SNHG28-201ENST00000368102 AKNAQ7Z591 1439 aa19.97■□□□□ 0.79
SNHG28-201ENST00000368102 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SNHG28-201ENST00000368102 TONSLQ96HA7 1378 aa19.96■□□□□ 0.79
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SNHG28-201ENST00000368102 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG28-201ENST00000368102 GCC2Q8IWJ2 1684 aa19.93■□□□□ 0.78
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