RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.28□□□□□ -0.28
SGMS1-201ENST00000361543 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.26□□□□□ -0.29
SGMS1-201ENST00000361543 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SGMS1-201ENST00000361543 IGF1RP08069 1367 aa13.21□□□□□ -0.29
SGMS1-201ENST00000361543 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.2□□□□□ -0.3
SGMS1-201ENST00000361543 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa13.15□□□□□ -0.3
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SGMS1-201ENST00000361543 IQGAP2Q13576 1575 aa13.11□□□□□ -0.31
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SGMS1-201ENST00000361543 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.06□□□□□ -0.32
SGMS1-201ENST00000361543 KIF13AQ9H1H9 1805 aa13.04□□□□□ -0.32
SGMS1-201ENST00000361543 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.01□□□□□ -0.33
SGMS1-201ENST00000361543 UGGT2Q9NYU1 1516 aa13.01□□□□□ -0.33
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0556O60303 1618 aa12.99□□□□□ -0.33
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SGMS1-201ENST00000361543 MAPKBP1O60336 1514 aa12.98□□□□□ -0.33
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SGMS1-201ENST00000361543 EEA1Q15075 1411 aa12.93□□□□□ -0.34
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SGMS1-201ENST00000361543 ABCC2Q92887 1545 aa12.92□□□□□ -0.34
SGMS1-201ENST00000361543 ABCC10Q5T3U5 1492 aa12.91□□□□□ -0.34
SGMS1-201ENST00000361543 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
SGMS1-201ENST00000361543 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa12.91□□□□□ -0.34
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA3Q08378 1498 aa12.91□□□□□ -0.34
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SGMS1-201ENST00000361543 KIF21BO75037 1637 aa12.88□□□□□ -0.35
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SGMS1-201ENST00000361543 ASXL2Q76L83 1435 aa12.83□□□□□ -0.36
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SGMS1-201ENST00000361543 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.83□□□□□ -0.36
SGMS1-201ENST00000361543 GLI2P10070 1586 aa12.81□□□□□ -0.36
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SGMS1-201ENST00000361543 KDM6BO15054 1643 aa12.78□□□□□ -0.36
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SGMS1-201ENST00000361543 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa12.77□□□□□ -0.37
SGMS1-201ENST00000361543 WDR7Q9Y4E6 1490 aa12.76□□□□□ -0.37
SGMS1-201ENST00000361543 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.76□□□□□ -0.37
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SGMS1-201ENST00000361543 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.63□□□□□ -0.39
SGMS1-201ENST00000361543 CD109Q6YHK3 1445 aa12.62□□□□□ -0.39
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.62□□□□□ -0.39
SGMS1-201ENST00000361543 KCNH8Q96L42 1107 aa12.62□□□□□ -0.39
SGMS1-201ENST00000361543 HECW1Q76N89 1606 aa12.62□□□□□ -0.39
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SGMS1-201ENST00000361543 FMN1Q68DA7 1419 aa12.59□□□□□ -0.39
SGMS1-201ENST00000361543 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
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SGMS1-201ENST00000361543 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
SGMS1-201ENST00000361543 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.58□□□□□ -0.4
SGMS1-201ENST00000361543 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.57□□□□□ -0.4
SGMS1-201ENST00000361543 TTC37Q6PGP7 1564 aa12.56□□□□□ -0.4
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SGMS1-201ENST00000361543 CFAP74Q9C0B2 1584 aa12.55□□□□□ -0.4
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SGMS1-201ENST00000361543 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa12.5□□□□□ -0.41
SGMS1-201ENST00000361543 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.49□□□□□ -0.41
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SGMS1-201ENST00000361543 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.47□□□□□ -0.41
SGMS1-201ENST00000361543 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.47□□□□□ -0.41
SGMS1-201ENST00000361543 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.47□□□□□ -0.41
SGMS1-201ENST00000361543 FANCAO15360 1455 aa12.46□□□□□ -0.41
SGMS1-201ENST00000361543 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa12.43□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 AKNAQ7Z591 1439 aa12.43□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 PREX2Q70Z35 1606 aa12.42□□□□□ -0.42
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