RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 JPH4Q96JJ6 628 aa45.58■■■■■ 4.89
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TPGS1-201ENST00000359315 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.57■■■■■ 4.89
TPGS1-201ENST00000359315 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.55■■■■■ 4.88
TPGS1-201ENST00000359315 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.53■■■■■ 4.88
TPGS1-201ENST00000359315 PRXQ9BXM0 1461 aa45.42■■■■■ 4.86
TPGS1-201ENST00000359315 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.32■■■■■ 4.85
TPGS1-201ENST00000359315 IQGAP2Q13576 1575 aa45.29■■■■■ 4.84
TPGS1-201ENST00000359315 EEA1Q15075 1411 aa45.27■■■■■ 4.84
TPGS1-201ENST00000359315 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
TPGS1-201ENST00000359315 DISP1Q96F81 1524 aa45.06■■■■■ 4.8
TPGS1-201ENST00000359315 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.06■■■■■ 4.8
TPGS1-201ENST00000359315 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.03■■■■■ 4.8
TPGS1-201ENST00000359315 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.03■■■■■ 4.8
TPGS1-201ENST00000359315 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.97■■■■■ 4.79
TPGS1-201ENST00000359315 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.95■■■■■ 4.79
TPGS1-201ENST00000359315 PTPRGP23470 1445 aa44.94■■■■■ 4.79
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA0556O60303 1618 aa44.9■■■■■ 4.78
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TPGS1-201ENST00000359315 KIF21BO75037 1637 aa44.86■■■■■ 4.77
TPGS1-201ENST00000359315 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.86■■■■■ 4.77
TPGS1-201ENST00000359315 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.74■■■■■ 4.75
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA3Q08378 1498 aa44.73■■■■■ 4.75
TPGS1-201ENST00000359315 UACAQ9BZF9 1416 aa44.65■■■■■ 4.74
TPGS1-201ENST00000359315 P3H3Q8IVL6 736 aa44.61■■■■■ 4.73
TPGS1-201ENST00000359315 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.6■■■■■ 4.73
TPGS1-201ENST00000359315 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.59■■■■■ 4.73
TPGS1-201ENST00000359315 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
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TPGS1-201ENST00000359315 SAMD9Q5K651 1589 aa44.56■■■■■ 4.72
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TPGS1-201ENST00000359315 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.38■■■■■ 4.69
TPGS1-201ENST00000359315 ASXL2Q76L83 1435 aa44.32■■■■■ 4.68
TPGS1-201ENST00000359315 DIP2BQ9P265 1576 aa44.31■■■■■ 4.68
TPGS1-201ENST00000359315 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.31■■■■■ 4.68
TPGS1-201ENST00000359315 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
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TPGS1-201ENST00000359315 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.29■■■■■ 4.68
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TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.17■■■■■ 4.66
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TPGS1-201ENST00000359315 ATP10BO94823 1461 aa44.08■■■■■ 4.65
TPGS1-201ENST00000359315 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
TPGS1-201ENST00000359315 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
TPGS1-201ENST00000359315 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.05■■■■■ 4.64
TPGS1-201ENST00000359315 GLI2P10070 1586 aa43.99■■■■■ 4.63
TPGS1-201ENST00000359315 FMN1Q68DA7 1419 aa43.88■■■■■ 4.61
TPGS1-201ENST00000359315 KCNH8Q96L42 1107 aa43.86■■■■■ 4.61
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TPGS1-201ENST00000359315 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.81■■■■■ 4.6
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TPGS1-201ENST00000359315 CD109Q6YHK3 1445 aa43.65■■■■■ 4.58
TPGS1-201ENST00000359315 CEP162Q5TB80 1403 aa43.64■■■■■ 4.58
TPGS1-201ENST00000359315 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
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TPGS1-201ENST00000359315 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.59■■■■■ 4.57
TPGS1-201ENST00000359315 KDM6BO15054 1643 aa43.59■■■■■ 4.57
TPGS1-201ENST00000359315 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.57■■■■■ 4.57
TPGS1-201ENST00000359315 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.56■■■■■ 4.56
TPGS1-201ENST00000359315 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.56■■■■■ 4.56
TPGS1-201ENST00000359315 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.55■■■■■ 4.56
TPGS1-201ENST00000359315 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
TPGS1-201ENST00000359315 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.51■■■■■ 4.56
TPGS1-201ENST00000359315 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.45■■■■■ 4.55
TPGS1-201ENST00000359315 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.4■■■■■ 4.54
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TPGS1-201ENST00000359315 KIF14Q15058 1648 aa43.27■■■■■ 4.52
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TPGS1-201ENST00000359315 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.17■■■■■ 4.5
TPGS1-201ENST00000359315 FANCAO15360 1455 aa43.13■■■■■ 4.5
TPGS1-201ENST00000359315 PLCH2O75038 1416 aa43.12■■■■■ 4.49
TPGS1-201ENST00000359315 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.11■■■■■ 4.49
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TPGS1-201ENST00000359315 AKNAQ7Z591 1439 aa43.06■■■■■ 4.48
TPGS1-201ENST00000359315 RAPGEF3O95398 923 aa43.04■■■■■ 4.48
TPGS1-201ENST00000359315 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.99■■■■■ 4.47
TPGS1-201ENST00000359315 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.98■■■■■ 4.47
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.98■■■■■ 4.47
TPGS1-201ENST00000359315 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.95■■■■■ 4.47
TPGS1-201ENST00000359315 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.92■■■■■ 4.46
TPGS1-201ENST00000359315 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.91■■■■■ 4.46
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRL1O94910 1474 aa42.9■■■■■ 4.46
TPGS1-201ENST00000359315 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.87■■■■■ 4.45
TPGS1-201ENST00000359315 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.86■■■■■ 4.45
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