RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.55■■■□□ 2.16
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SNX11-201ENST00000359238 MYT1Q01538 1121 aa28.49■■■□□ 2.15
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SNX11-201ENST00000359238 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.42■■■□□ 2.14
SNX11-201ENST00000359238 ADAMTS12P58397 1594 aa28.42■■■□□ 2.14
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SNX11-201ENST00000359238 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.36■■■□□ 2.13
SNX11-201ENST00000359238 P3H3Q8IVL6 736 aa28.36■■■□□ 2.13
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SNX11-201ENST00000359238 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.24■■■□□ 2.11
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SNX11-201ENST00000359238 MAP3K1Q13233 1512 aa27.89■■■□□ 2.05
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SNX11-201ENST00000359238 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.68■■■□□ 2.02
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SNX11-201ENST00000359238 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.44■■□□□ 1.98
SNX11-201ENST00000359238 ARHGEF11O15085 1522 aa27.42■■□□□ 1.98
SNX11-201ENST00000359238 ABCA8O94911 1581 aa27.4■■□□□ 1.98
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SNX11-201ENST00000359238 PTPRKQ15262 1439 aa27.34■■□□□ 1.97
SNX11-201ENST00000359238 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.33■■□□□ 1.97
SNX11-201ENST00000359238 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SNX11-201ENST00000359238 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.29■■□□□ 1.96
SNX11-201ENST00000359238 ATP10BO94823 1461 aa27.28■■□□□ 1.96
SNX11-201ENST00000359238 OSCARQ8IYS5 282 aa27.28■■□□□ 1.96
SNX11-201ENST00000359238 UACAQ9BZF9 1416 aa27.27■■□□□ 1.96
SNX11-201ENST00000359238 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.26■■□□□ 1.95
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SNX11-201ENST00000359238 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.23■■□□□ 1.95
SNX11-201ENST00000359238 KIF14Q15058 1648 aa27.22■■□□□ 1.95
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SNX11-201ENST00000359238 ABCC2Q92887 1545 aa27.17■■□□□ 1.94
SNX11-201ENST00000359238 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
SNX11-201ENST00000359238 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SNX11-201ENST00000359238 MAPKBP1O60336 1514 aa27.12■■□□□ 1.93
SNX11-201ENST00000359238 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.11■■□□□ 1.93
SNX11-201ENST00000359238 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.09■■□□□ 1.93
SNX11-201ENST00000359238 MIA2Q96PC5 1412 aa27.08■■□□□ 1.93
SNX11-201ENST00000359238 NAIPQ13075 1403 aa27.05■■□□□ 1.92
SNX11-201ENST00000359238 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.04■■□□□ 1.92
SNX11-201ENST00000359238 HFM1A2PYH4 1435 aa27.04■■□□□ 1.92
SNX11-201ENST00000359238 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
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