RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358071.8

RAD9B-201, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAD9B, Length 2,843 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9B-201ENST00000358071 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.04□□□□□ -0.64
RAD9B-201ENST00000358071 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.03□□□□□ -0.64
RAD9B-201ENST00000358071 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RAD9B-201ENST00000358071 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.96□□□□□ -0.65
RAD9B-201ENST00000358071 WDR97A6NE52 1622 aa10.95□□□□□ -0.66
RAD9B-201ENST00000358071 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RAD9B-201ENST00000358071 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.94□□□□□ -0.66
RAD9B-201ENST00000358071 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
RAD9B-201ENST00000358071 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.89□□□□□ -0.67
RAD9B-201ENST00000358071 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
RAD9B-201ENST00000358071 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.88□□□□□ -0.67
RAD9B-201ENST00000358071 PBRM1Q86U86 1689 aa10.88□□□□□ -0.67
RAD9B-201ENST00000358071 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.86□□□□□ -0.67
RAD9B-201ENST00000358071 CUL7Q14999 1698 aa10.85□□□□□ -0.67
RAD9B-201ENST00000358071 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
RAD9B-201ENST00000358071 WDR62O43379 1518 aa10.85□□□□□ -0.67
RAD9B-201ENST00000358071 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
RAD9B-201ENST00000358071 GRIN2BQ13224 1484 aa10.83□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 TIAM1Q13009 1591 aa10.83□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.83□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.82□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.82□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.82□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.81□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 IFT140Q96RY7 1462 aa10.81□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 ADAMTS12P58397 1594 aa10.8□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 MTUS2Q5JR59 1369 aa10.79□□□□□ -0.68
RAD9B-201ENST00000358071 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.77□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 IQGAP2Q13576 1575 aa10.76□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 NEUROD1Q13562 356 aa10.76□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.76□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 GRIN2AQ12879 1464 aa10.76□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 JPH4Q96JJ6 628 aa10.76□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.75□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.75□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.74□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 SAMD9Q5K651 1589 aa10.74□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 CEP170Q5SW79 1584 aa10.74□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 FMN1Q68DA7 1419 aa10.73□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.73□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 PTPRKQ15262 1439 aa10.72□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.72□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 DISP1Q96F81 1524 aa10.72□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.71□□□□□ -0.69
RAD9B-201ENST00000358071 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.69□□□□□ -0.7
RAD9B-201ENST00000358071 FOXD1Q16676 465 aa10.69□□□□□ -0.7
RAD9B-201ENST00000358071 NCOA2Q15596 1464 aa10.69□□□□□ -0.7
RAD9B-201ENST00000358071 SYNJ2O15056 1496 aa10.68□□□□□ -0.7
RAD9B-201ENST00000358071 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
RAD9B-201ENST00000358071 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa10.67□□□□□ -0.7
RAD9B-201ENST00000358071 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
RAD9B-201ENST00000358071 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
RAD9B-201ENST00000358071 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.66□□□□□ -0.7
RAD9B-201ENST00000358071 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.65□□□□□ -0.7
RAD9B-201ENST00000358071 KIAA0556O60303 1618 aa10.65□□□□□ -0.7
RAD9B-201ENST00000358071 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 KCNH8Q96L42 1107 aa10.62□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 CHD1O14646 1710 aa10.62□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 SETD5Q9C0A6 1442 aa10.62□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.61□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 TRIM52Q96A61 297 aa10.61□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 MAP3K1Q13233 1512 aa10.61□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.6□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 MAPKBP1O60336 1514 aa10.59□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 NUP160Q12769 1436 aa10.59□□□□□ -0.71
RAD9B-201ENST00000358071 KDM6BO15054 1643 aa10.58□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 HECW1Q76N89 1606 aa10.58□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 KIF14Q15058 1648 aa10.57□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.57□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 MIER1Q8N108 512 aa10.57□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.56□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.55□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 PTPRGP23470 1445 aa10.54□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa10.54□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10.53□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 CCDC18Q5T9S5 1454 aa10.53□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 NAIPQ13075 1403 aa10.53□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 ATP10BO94823 1461 aa10.53□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 ARHGEF11O15085 1522 aa10.53□□□□□ -0.72
RAD9B-201ENST00000358071 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RAD9B-201ENST00000358071 ABCC5O15440 1437 aa10.48□□□□□ -0.73
RAD9B-201ENST00000358071 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
RAD9B-201ENST00000358071 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
RAD9B-201ENST00000358071 HFM1A2PYH4 1435 aa10.47□□□□□ -0.73
RAD9B-201ENST00000358071 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
RAD9B-201ENST00000358071 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
RAD9B-201ENST00000358071 MPHOSPH9Q99550 1183 aa10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.3 ms