RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
SH3BP1-201ENST00000357436 ITGAEP38570 1179 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP1-201ENST00000357436 ERCC6Q03468 1493 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP1-201ENST00000357436 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.92■■■□□ 2.06
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
SH3BP1-201ENST00000357436 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR97A6NE52 1622 aa27.88■■■□□ 2.05
SH3BP1-201ENST00000357436 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.86■■■□□ 2.05
SH3BP1-201ENST00000357436 NEUROD1Q13562 356 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP1-201ENST00000357436 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
SH3BP1-201ENST00000357436 ARID3CA6NKF2 412 aa27.8■■■□□ 2.04
SH3BP1-201ENST00000357436 CUL7Q14999 1698 aa27.77■■■□□ 2.04
SH3BP1-201ENST00000357436 FBLN2P98095 1184 aa27.76■■■□□ 2.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.75■■■□□ 2.03
SH3BP1-201ENST00000357436 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP3K1Q13233 1512 aa27.66■■■□□ 2.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.64■■■□□ 2.02
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR62O43379 1518 aa27.64■■■□□ 2.01
SH3BP1-201ENST00000357436 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
SH3BP1-201ENST00000357436 TIAM1Q13009 1591 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP1-201ENST00000357436 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP1-201ENST00000357436 GRIN2BQ13224 1484 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP1-201ENST00000357436 IFT140Q96RY7 1462 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP1-201ENST00000357436 PBRM1Q86U86 1689 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP1-201ENST00000357436 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.59■■■□□ 2.01
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SH3BP1-201ENST00000357436 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP1-201ENST00000357436 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
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SH3BP1-201ENST00000357436 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
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SH3BP1-201ENST00000357436 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP1-201ENST00000357436 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP1-201ENST00000357436 FMN1Q68DA7 1419 aa27.45■■□□□ 1.99
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP1-201ENST00000357436 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP1-201ENST00000357436 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP1-201ENST00000357436 SAMD9Q5K651 1589 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP1-201ENST00000357436 IQGAP2Q13576 1575 aa27.39■■□□□ 1.97
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP1-201ENST00000357436 GRIN2AQ12879 1464 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP1-201ENST00000357436 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP1-201ENST00000357436 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPKBP1O60336 1514 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP1-201ENST00000357436 JPH4Q96JJ6 628 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP1-201ENST00000357436 DISP1Q96F81 1524 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP1-201ENST00000357436 SYNJ2O15056 1496 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP170Q5SW79 1584 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP1-201ENST00000357436 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
SH3BP1-201ENST00000357436 NCOA2Q15596 1464 aa27.17■■□□□ 1.94
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SH3BP1-201ENST00000357436 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BP1-201ENST00000357436 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SH3BP1-201ENST00000357436 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP1-201ENST00000357436 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPRKQ15262 1439 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA0556O60303 1618 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP1-201ENST00000357436 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP1-201ENST00000357436 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BP1-201ENST00000357436 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
SH3BP1-201ENST00000357436 HECW1Q76N89 1606 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP1-201ENST00000357436 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
SH3BP1-201ENST00000357436 NUP160Q12769 1436 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP1-201ENST00000357436 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP1-201ENST00000357436 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SH3BP1-201ENST00000357436 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
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SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SH3BP1-201ENST00000357436 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP1-201ENST00000357436 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP1-201ENST00000357436 HFM1A2PYH4 1435 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF11O15085 1522 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM52Q96A61 297 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SH3BP1-201ENST00000357436 CHD1O14646 1710 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP1-201ENST00000357436 NAIPQ13075 1403 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP1-201ENST00000357436 UACAQ9BZF9 1416 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP1-201ENST00000357436 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPRGP23470 1445 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXD1Q16676 465 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1-201ENST00000357436 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1-201ENST00000357436 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF14Q15058 1648 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP1-201ENST00000357436 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
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