RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357365.7

SDCCAG3-202, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

APPRIS P4 TSL 5 BASIC

Gene SDCCAG3, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-202ENST00000357365 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
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SDCCAG3-202ENST00000357365 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
SDCCAG3-202ENST00000357365 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.44■■■■■ 4.54
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SDCCAG3-202ENST00000357365 IFT140Q96RY7 1462 aa43.36■■■■■ 4.53
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SDCCAG3-202ENST00000357365 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.51■■■■■ 4.4
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SDCCAG3-202ENST00000357365 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.44■■■■■ 4.39
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SDCCAG3-202ENST00000357365 NCOA2Q15596 1464 aa42.44■■■■■ 4.38
SDCCAG3-202ENST00000357365 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
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SDCCAG3-202ENST00000357365 CLSPNQ9HAW4 1339 aa42.23■■■■■ 4.35
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SDCCAG3-202ENST00000357365 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.73■■■■■ 4.27
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SDCCAG3-202ENST00000357365 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.57■■■■■ 4.24
SDCCAG3-202ENST00000357365 ABCC5O15440 1437 aa41.55■■■■■ 4.24
SDCCAG3-202ENST00000357365 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
SDCCAG3-202ENST00000357365 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
SDCCAG3-202ENST00000357365 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.53■■■■■ 4.24
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