RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356742.9

HVCN1-202, Transcript of hydrogen voltage gated channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HVCN1, Length 2,189 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HVCN1-202ENST00000356742 TIAM1Q13009 1591 aa22.96■■□□□ 1.27
HVCN1-202ENST00000356742 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HVCN1-202ENST00000356742 MAP3K1Q13233 1512 aa22.94■■□□□ 1.26
HVCN1-202ENST00000356742 PBRM1Q86U86 1689 aa22.94■■□□□ 1.26
HVCN1-202ENST00000356742 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.93■■□□□ 1.26
HVCN1-202ENST00000356742 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.92■■□□□ 1.26
HVCN1-202ENST00000356742 P3H3Q8IVL6 736 aa22.91■■□□□ 1.26
HVCN1-202ENST00000356742 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HVCN1-202ENST00000356742 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.9■■□□□ 1.26
HVCN1-202ENST00000356742 WDR62O43379 1518 aa22.87■■□□□ 1.25
HVCN1-202ENST00000356742 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.84■■□□□ 1.25
HVCN1-202ENST00000356742 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
HVCN1-202ENST00000356742 SAMD9Q5K651 1589 aa22.83■■□□□ 1.25
HVCN1-202ENST00000356742 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.83■■□□□ 1.24
HVCN1-202ENST00000356742 ADAMTS12P58397 1594 aa22.81■■□□□ 1.24
HVCN1-202ENST00000356742 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.79■■□□□ 1.24
HVCN1-202ENST00000356742 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.79■■□□□ 1.24
HVCN1-202ENST00000356742 IFT140Q96RY7 1462 aa22.78■■□□□ 1.24
HVCN1-202ENST00000356742 FMN1Q68DA7 1419 aa22.76■■□□□ 1.23
HVCN1-202ENST00000356742 GRIN2BQ13224 1484 aa22.76■■□□□ 1.23
HVCN1-202ENST00000356742 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HVCN1-202ENST00000356742 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.75■■□□□ 1.23
HVCN1-202ENST00000356742 ERCC6Q03468 1493 aa22.74■■□□□ 1.23
HVCN1-202ENST00000356742 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HVCN1-202ENST00000356742 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HVCN1-202ENST00000356742 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.7■■□□□ 1.22
HVCN1-202ENST00000356742 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.68■■□□□ 1.22
HVCN1-202ENST00000356742 IQGAP2Q13576 1575 aa22.68■■□□□ 1.22
HVCN1-202ENST00000356742 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HVCN1-202ENST00000356742 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HVCN1-202ENST00000356742 ITGAEP38570 1179 aa22.6■■□□□ 1.21
HVCN1-202ENST00000356742 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.54■■□□□ 1.2
HVCN1-202ENST00000356742 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.53■■□□□ 1.2
HVCN1-202ENST00000356742 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.52■■□□□ 1.2
HVCN1-202ENST00000356742 GRIN2AQ12879 1464 aa22.52■■□□□ 1.2
HVCN1-202ENST00000356742 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HVCN1-202ENST00000356742 HECW1Q76N89 1606 aa22.51■■□□□ 1.19
HVCN1-202ENST00000356742 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.49■■□□□ 1.19
HVCN1-202ENST00000356742 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
HVCN1-202ENST00000356742 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.48■■□□□ 1.19
HVCN1-202ENST00000356742 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.48■■□□□ 1.19
HVCN1-202ENST00000356742 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.47■■□□□ 1.19
HVCN1-202ENST00000356742 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HVCN1-202ENST00000356742 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.46■■□□□ 1.19
HVCN1-202ENST00000356742 KIAA0556O60303 1618 aa22.45■■□□□ 1.18
HVCN1-202ENST00000356742 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
HVCN1-202ENST00000356742 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.45■■□□□ 1.18
HVCN1-202ENST00000356742 NCOA2Q15596 1464 aa22.44■■□□□ 1.18
HVCN1-202ENST00000356742 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.44■■□□□ 1.18
HVCN1-202ENST00000356742 DISP1Q96F81 1524 aa22.43■■□□□ 1.18
HVCN1-202ENST00000356742 SYNJ2O15056 1496 aa22.42■■□□□ 1.18
HVCN1-202ENST00000356742 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HVCN1-202ENST00000356742 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HVCN1-202ENST00000356742 CEP170Q5SW79 1584 aa22.41■■□□□ 1.18
HVCN1-202ENST00000356742 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HVCN1-202ENST00000356742 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.39■■□□□ 1.17
HVCN1-202ENST00000356742 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HVCN1-202ENST00000356742 ARHGEF11O15085 1522 aa22.38■■□□□ 1.17
HVCN1-202ENST00000356742 MAPKBP1O60336 1514 aa22.35■■□□□ 1.17
HVCN1-202ENST00000356742 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HVCN1-202ENST00000356742 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.32■■□□□ 1.16
HVCN1-202ENST00000356742 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.3■■□□□ 1.16
HVCN1-202ENST00000356742 FBLN2P98095 1184 aa22.3■■□□□ 1.16
HVCN1-202ENST00000356742 NUP160Q12769 1436 aa22.3■■□□□ 1.16
HVCN1-202ENST00000356742 ARID3CA6NKF2 412 aa22.28■■□□□ 1.16
HVCN1-202ENST00000356742 PTPRKQ15262 1439 aa22.28■■□□□ 1.16
HVCN1-202ENST00000356742 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HVCN1-202ENST00000356742 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HVCN1-202ENST00000356742 HFM1A2PYH4 1435 aa22.22■■□□□ 1.15
HVCN1-202ENST00000356742 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.17■■□□□ 1.14
HVCN1-202ENST00000356742 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.17■■□□□ 1.14
HVCN1-202ENST00000356742 JPH4Q96JJ6 628 aa22.16■■□□□ 1.14
HVCN1-202ENST00000356742 NAIPQ13075 1403 aa22.15■■□□□ 1.14
HVCN1-202ENST00000356742 MIA2Q96PC5 1412 aa22.15■■□□□ 1.14
HVCN1-202ENST00000356742 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.11■■□□□ 1.13
HVCN1-202ENST00000356742 CHD1O14646 1710 aa22.11■■□□□ 1.13
HVCN1-202ENST00000356742 UACAQ9BZF9 1416 aa22.09■■□□□ 1.13
HVCN1-202ENST00000356742 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.08■■□□□ 1.13
HVCN1-202ENST00000356742 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
HVCN1-202ENST00000356742 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HVCN1-202ENST00000356742 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HVCN1-202ENST00000356742 ABCA8O94911 1581 aa22.06■■□□□ 1.12
HVCN1-202ENST00000356742 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.05■■□□□ 1.12
HVCN1-202ENST00000356742 AKNAQ7Z591 1439 aa22.04■■□□□ 1.12
HVCN1-202ENST00000356742 NEUROD1Q13562 356 aa22.04■■□□□ 1.12
HVCN1-202ENST00000356742 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.04■■□□□ 1.12
HVCN1-202ENST00000356742 KIF14Q15058 1648 aa22.04■■□□□ 1.12
HVCN1-202ENST00000356742 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.02■■□□□ 1.12
HVCN1-202ENST00000356742 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HVCN1-202ENST00000356742 KDM6BO15054 1643 aa22.01■■□□□ 1.11
HVCN1-202ENST00000356742 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.01■■□□□ 1.11
HVCN1-202ENST00000356742 DAPK1P53355 1430 aa21.99■■□□□ 1.11
HVCN1-202ENST00000356742 MIER1Q8N108 512 aa21.98■■□□□ 1.11
HVCN1-202ENST00000356742 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HVCN1-202ENST00000356742 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.95■■□□□ 1.1
HVCN1-202ENST00000356742 ABCC5O15440 1437 aa21.95■■□□□ 1.1
HVCN1-202ENST00000356742 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HVCN1-202ENST00000356742 ATP10BO94823 1461 aa21.94■■□□□ 1.1
HVCN1-202ENST00000356742 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.94■■□□□ 1.1
HVCN1-202ENST00000356742 SHROOM2Q13796 1616 aa21.94■■□□□ 1.1
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