RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SPNS1-204ENST00000352260 APLP2Q06481 763 aa28.39■■■□□ 2.13
SPNS1-204ENST00000352260 PBRM1Q86U86 1689 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-204ENST00000352260 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-204ENST00000352260 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-204ENST00000352260 GRIN2BQ13224 1484 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-204ENST00000352260 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SPNS1-204ENST00000352260 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.23■■■□□ 2.11
SPNS1-204ENST00000352260 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.23■■■□□ 2.11
SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTS12P58397 1594 aa28.22■■■□□ 2.11
SPNS1-204ENST00000352260 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.14■■■□□ 2.1
SPNS1-204ENST00000352260 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
SPNS1-204ENST00000352260 P3H3Q8IVL6 736 aa28.14■■■□□ 2.09
SPNS1-204ENST00000352260 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.13■■■□□ 2.09
SPNS1-204ENST00000352260 SAMD9Q5K651 1589 aa28.09■■■□□ 2.09
SPNS1-204ENST00000352260 MAP3K1Q13233 1512 aa28.09■■■□□ 2.09
SPNS1-204ENST00000352260 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SPNS1-204ENST00000352260 TIAM1Q13009 1591 aa28.06■■■□□ 2.08
SPNS1-204ENST00000352260 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SPNS1-204ENST00000352260 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.05■■■□□ 2.08
SPNS1-204ENST00000352260 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28■■■□□ 2.07
SPNS1-204ENST00000352260 OSCARQ8IYS5 282 aa27.99■■■□□ 2.07
SPNS1-204ENST00000352260 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.99■■■□□ 2.07
SPNS1-204ENST00000352260 IQGAP2Q13576 1575 aa27.98■■■□□ 2.07
SPNS1-204ENST00000352260 FMN1Q68DA7 1419 aa27.98■■■□□ 2.07
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.98■■■□□ 2.07
SPNS1-204ENST00000352260 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
SPNS1-204ENST00000352260 FBLN2P98095 1184 aa27.96■■■□□ 2.07
SPNS1-204ENST00000352260 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.93■■■□□ 2.06
SPNS1-204ENST00000352260 GRIN2AQ12879 1464 aa27.92■■■□□ 2.06
SPNS1-204ENST00000352260 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SPNS1-204ENST00000352260 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SPNS1-204ENST00000352260 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
SPNS1-204ENST00000352260 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-204ENST00000352260 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-204ENST00000352260 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-204ENST00000352260 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-204ENST00000352260 SYNJ2O15056 1496 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-204ENST00000352260 CHD1O14646 1710 aa27.82■■■□□ 2.04
SPNS1-204ENST00000352260 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.78■■■□□ 2.04
SPNS1-204ENST00000352260 NEUROD1Q13562 356 aa27.77■■■□□ 2.04
SPNS1-204ENST00000352260 CEP170Q5SW79 1584 aa27.75■■■□□ 2.03
SPNS1-204ENST00000352260 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.75■■■□□ 2.03
SPNS1-204ENST00000352260 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.73■■■□□ 2.03
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA0556O60303 1618 aa27.71■■■□□ 2.03
SPNS1-204ENST00000352260 DISP1Q96F81 1524 aa27.7■■■□□ 2.03
SPNS1-204ENST00000352260 NUP160Q12769 1436 aa27.69■■■□□ 2.02
SPNS1-204ENST00000352260 HECW1Q76N89 1606 aa27.66■■■□□ 2.02
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.64■■■□□ 2.01
SPNS1-204ENST00000352260 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.63■■■□□ 2.01
SPNS1-204ENST00000352260 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.62■■■□□ 2.01
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SPNS1-204ENST00000352260 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.58■■■□□ 2.01
SPNS1-204ENST00000352260 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.58■■■□□ 2.01
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SPNS1-204ENST00000352260 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.53■■■□□ 2
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SPNS1-204ENST00000352260 JPH4Q96JJ6 628 aa27.51■■□□□ 1.99
SPNS1-204ENST00000352260 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SPNS1-204ENST00000352260 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SPNS1-204ENST00000352260 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.48■■□□□ 1.99
SPNS1-204ENST00000352260 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
SPNS1-204ENST00000352260 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.47■■□□□ 1.99
SPNS1-204ENST00000352260 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.47■■□□□ 1.99
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF11O15085 1522 aa27.47■■□□□ 1.99
SPNS1-204ENST00000352260 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SPNS1-204ENST00000352260 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.42■■□□□ 1.98
SPNS1-204ENST00000352260 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.42■■□□□ 1.98
SPNS1-204ENST00000352260 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.42■■□□□ 1.98
SPNS1-204ENST00000352260 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.42■■□□□ 1.98
SPNS1-204ENST00000352260 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
SPNS1-204ENST00000352260 ARID3CA6NKF2 412 aa27.39■■□□□ 1.98
SPNS1-204ENST00000352260 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS1-204ENST00000352260 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.33■■□□□ 1.97
SPNS1-204ENST00000352260 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.33■■□□□ 1.97
SPNS1-204ENST00000352260 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS1-204ENST00000352260 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.3■■□□□ 1.96
SPNS1-204ENST00000352260 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SPNS1-204ENST00000352260 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.29■■□□□ 1.96
SPNS1-204ENST00000352260 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.29■■□□□ 1.96
SPNS1-204ENST00000352260 SHROOM2Q13796 1616 aa27.29■■□□□ 1.96
SPNS1-204ENST00000352260 ABCA8O94911 1581 aa27.28■■□□□ 1.96
SPNS1-204ENST00000352260 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SPNS1-204ENST00000352260 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SPNS1-204ENST00000352260 PTPRKQ15262 1439 aa27.22■■□□□ 1.95
SPNS1-204ENST00000352260 MIA2Q96PC5 1412 aa27.21■■□□□ 1.95
SPNS1-204ENST00000352260 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
SPNS1-204ENST00000352260 PTPRGP23470 1445 aa27.17■■□□□ 1.94
SPNS1-204ENST00000352260 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-204ENST00000352260 ATP10BO94823 1461 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-204ENST00000352260 HFM1A2PYH4 1435 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-204ENST00000352260 MAPKBP1O60336 1514 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-204ENST00000352260 KIF14Q15058 1648 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-204ENST00000352260 NAIPQ13075 1403 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS1-204ENST00000352260 UACAQ9BZF9 1416 aa27.03■■□□□ 1.92
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