RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000350771.7

H2AFV-204, Transcript of H2A histone family member V, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene H2AFV, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFV-204ENST00000350771 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.59■■■■■ 4.57
H2AFV-204ENST00000350771 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
H2AFV-204ENST00000350771 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.56■■■■■ 4.56
H2AFV-204ENST00000350771 EEA1Q15075 1411 aa43.56■■■■■ 4.56
H2AFV-204ENST00000350771 PRXQ9BXM0 1461 aa43.53■■■■■ 4.56
H2AFV-204ENST00000350771 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.44■■■■■ 4.54
H2AFV-204ENST00000350771 JPH4Q96JJ6 628 aa43.42■■■■■ 4.54
H2AFV-204ENST00000350771 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.39■■■■■ 4.54
H2AFV-204ENST00000350771 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
H2AFV-204ENST00000350771 IQGAP2Q13576 1575 aa43.32■■■■■ 4.52
H2AFV-204ENST00000350771 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.21■■■■■ 4.51
H2AFV-204ENST00000350771 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.13■■■■■ 4.5
H2AFV-204ENST00000350771 KIF21BO75037 1637 aa43.11■■■■■ 4.49
H2AFV-204ENST00000350771 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
H2AFV-204ENST00000350771 DISP1Q96F81 1524 aa43.03■■■■■ 4.48
H2AFV-204ENST00000350771 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.03■■■■■ 4.48
H2AFV-204ENST00000350771 KIAA0556O60303 1618 aa42.92■■■■■ 4.46
H2AFV-204ENST00000350771 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.9■■■■■ 4.46
H2AFV-204ENST00000350771 PTPRGP23470 1445 aa42.84■■■■■ 4.45
H2AFV-204ENST00000350771 GOLGA3Q08378 1498 aa42.84■■■■■ 4.45
H2AFV-204ENST00000350771 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.75■■■■■ 4.43
H2AFV-204ENST00000350771 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.73■■■■■ 4.43
H2AFV-204ENST00000350771 SAMD9Q5K651 1589 aa42.71■■■■■ 4.43
H2AFV-204ENST00000350771 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.68■■■■■ 4.42
H2AFV-204ENST00000350771 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.62■■■■■ 4.41
H2AFV-204ENST00000350771 UACAQ9BZF9 1416 aa42.59■■■■■ 4.41
H2AFV-204ENST00000350771 MAPKBP1O60336 1514 aa42.59■■■■■ 4.41
H2AFV-204ENST00000350771 ABCC2Q92887 1545 aa42.55■■■■■ 4.4
H2AFV-204ENST00000350771 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
H2AFV-204ENST00000350771 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
H2AFV-204ENST00000350771 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.51■■■■■ 4.4
H2AFV-204ENST00000350771 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.49■■■■■ 4.39
H2AFV-204ENST00000350771 ABCA8O94911 1581 aa42.47■■■■■ 4.39
H2AFV-204ENST00000350771 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.45■■■■■ 4.39
H2AFV-204ENST00000350771 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.44■■■■■ 4.38
H2AFV-204ENST00000350771 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.43■■■■■ 4.38
H2AFV-204ENST00000350771 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.41■■■■■ 4.38
H2AFV-204ENST00000350771 DIP2BQ9P265 1576 aa42.39■■■■■ 4.38
H2AFV-204ENST00000350771 P3H3Q8IVL6 736 aa42.39■■■■■ 4.38
H2AFV-204ENST00000350771 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.34■■■■■ 4.37
H2AFV-204ENST00000350771 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
H2AFV-204ENST00000350771 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
H2AFV-204ENST00000350771 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.28■■■■■ 4.36
H2AFV-204ENST00000350771 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.22■■■■■ 4.35
H2AFV-204ENST00000350771 ASXL2Q76L83 1435 aa42.19■■■■■ 4.34
H2AFV-204ENST00000350771 TSPOAP1O95153 1857 aa42.15■■■■■ 4.34
H2AFV-204ENST00000350771 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
H2AFV-204ENST00000350771 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
H2AFV-204ENST00000350771 ATP10BO94823 1461 aa42.07■■■■■ 4.33
H2AFV-204ENST00000350771 FMN1Q68DA7 1419 aa42.07■■■■■ 4.33
H2AFV-204ENST00000350771 GLI2P10070 1586 aa42.02■■■■■ 4.32
H2AFV-204ENST00000350771 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.02■■■■■ 4.32
H2AFV-204ENST00000350771 CLIP1P30622 1438 aa42■■■■■ 4.31
H2AFV-204ENST00000350771 KDM6BO15054 1643 aa41.99■■■■■ 4.31
H2AFV-204ENST00000350771 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
H2AFV-204ENST00000350771 HECW1Q76N89 1606 aa41.87■■■■■ 4.29
H2AFV-204ENST00000350771 CEP162Q5TB80 1403 aa41.86■■■■■ 4.29
H2AFV-204ENST00000350771 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.85■■■■■ 4.29
H2AFV-204ENST00000350771 ARID3CA6NKF2 412 aa41.85■■■■■ 4.29
H2AFV-204ENST00000350771 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
H2AFV-204ENST00000350771 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.82■■■■■ 4.29
H2AFV-204ENST00000350771 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.78■■■■■ 4.28
H2AFV-204ENST00000350771 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.27
H2AFV-204ENST00000350771 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
H2AFV-204ENST00000350771 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.71■■■■■ 4.27
H2AFV-204ENST00000350771 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.7■■■■■ 4.27
H2AFV-204ENST00000350771 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.69■■■■■ 4.26
H2AFV-204ENST00000350771 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.69■■■■■ 4.26
H2AFV-204ENST00000350771 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
H2AFV-204ENST00000350771 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
H2AFV-204ENST00000350771 KCNH8Q96L42 1107 aa41.66■■■■■ 4.26
H2AFV-204ENST00000350771 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.65■■■■■ 4.26
H2AFV-204ENST00000350771 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.62■■■■■ 4.25
H2AFV-204ENST00000350771 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.6■■■■■ 4.25
H2AFV-204ENST00000350771 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.59■■■■■ 4.25
H2AFV-204ENST00000350771 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
H2AFV-204ENST00000350771 CD109Q6YHK3 1445 aa41.58■■■■■ 4.25
H2AFV-204ENST00000350771 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
H2AFV-204ENST00000350771 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
H2AFV-204ENST00000350771 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.23
H2AFV-204ENST00000350771 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.232e-6■■□□□ 13.3
H2AFV-204ENST00000350771 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.39■■■■■ 4.22
H2AFV-204ENST00000350771 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.37■■■■■ 4.21
H2AFV-204ENST00000350771 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.36■■■■■ 4.21
H2AFV-204ENST00000350771 KIF14Q15058 1648 aa41.34■■■■■ 4.21
H2AFV-204ENST00000350771 NEO1Q92859 1461 aa41.27■■■■■ 4.2
H2AFV-204ENST00000350771 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.26■■■■■ 4.2
H2AFV-204ENST00000350771 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.23■■■■■ 4.19
H2AFV-204ENST00000350771 PLCH2O75038 1416 aa41.2■■■■■ 4.19
H2AFV-204ENST00000350771 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.19■■■■■ 4.18
H2AFV-204ENST00000350771 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.17■■■■■ 4.18
H2AFV-204ENST00000350771 FANCAO15360 1455 aa41.15■■■■■ 4.18
H2AFV-204ENST00000350771 ADGRL1O94910 1474 aa41.15■■■■■ 4.18
H2AFV-204ENST00000350771 TIAM1Q13009 1591 aa41.12■■■■■ 4.17
H2AFV-204ENST00000350771 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.1■■■■■ 4.17
H2AFV-204ENST00000350771 MAP3K1Q13233 1512 aa41.09■■■■■ 4.17
H2AFV-204ENST00000350771 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.08■■■■■ 4.17
H2AFV-204ENST00000350771 AKNAQ7Z591 1439 aa41.06■■■■■ 4.16
H2AFV-204ENST00000350771 PREX2Q70Z35 1606 aa41.05■■■■■ 4.16
H2AFV-204ENST00000350771 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.03■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms