RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340006.6

CSRP1-201, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRP1, Length 1,952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1-201ENST00000340006 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.74■■□□□ 1.39
CSRP1-201ENST00000340006 CEP170Q5SW79 1584 aa23.73■■□□□ 1.39
CSRP1-201ENST00000340006 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.72■■□□□ 1.39
CSRP1-201ENST00000340006 NUP160Q12769 1436 aa23.71■■□□□ 1.39
CSRP1-201ENST00000340006 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.69■■□□□ 1.38
CSRP1-201ENST00000340006 JPH4Q96JJ6 628 aa23.65■■□□□ 1.38
CSRP1-201ENST00000340006 IQGAP2Q13576 1575 aa23.64■■□□□ 1.37
CSRP1-201ENST00000340006 P3H3Q8IVL6 736 aa23.58■■□□□ 1.36
CSRP1-201ENST00000340006 CEP162Q5TB80 1403 aa23.56■■□□□ 1.36
CSRP1-201ENST00000340006 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.55■■□□□ 1.36
CSRP1-201ENST00000340006 CLIP1P30622 1438 aa23.54■■□□□ 1.36
CSRP1-201ENST00000340006 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CSRP1-201ENST00000340006 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.49■■□□□ 1.35
CSRP1-201ENST00000340006 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CSRP1-201ENST00000340006 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.47■■□□□ 1.35
CSRP1-201ENST00000340006 SHROOM2Q13796 1616 aa23.45■■□□□ 1.34
CSRP1-201ENST00000340006 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.44■■□□□ 1.34
CSRP1-201ENST00000340006 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.42■■□□□ 1.34
CSRP1-201ENST00000340006 DISP1Q96F81 1524 aa23.41■■□□□ 1.34
CSRP1-201ENST00000340006 SAMD9Q5K651 1589 aa23.4■■□□□ 1.34
CSRP1-201ENST00000340006 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRP1-201ENST00000340006 KIAA0556O60303 1618 aa23.38■■□□□ 1.33
CSRP1-201ENST00000340006 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRP1-201ENST00000340006 ARAP1Q96P48 1450 aa23.34■■□□□ 1.33
CSRP1-201ENST00000340006 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CSRP1-201ENST00000340006 PTPRGP23470 1445 aa23.31■■□□□ 1.32
CSRP1-201ENST00000340006 ARHGEF11O15085 1522 aa23.27■■□□□ 1.32
CSRP1-201ENST00000340006 FMN1Q68DA7 1419 aa23.27■■□□□ 1.32
CSRP1-201ENST00000340006 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.22■■□□□ 1.31
CSRP1-201ENST00000340006 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.22■■□□□ 1.31
CSRP1-201ENST00000340006 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.22■■□□□ 1.31
CSRP1-201ENST00000340006 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.21■■□□□ 1.31
CSRP1-201ENST00000340006 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.21■■□□□ 1.31
CSRP1-201ENST00000340006 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.2■■□□□ 1.3
CSRP1-201ENST00000340006 APLP2Q06481 763 aa23.17■■□□□ 1.3
CSRP1-201ENST00000340006 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.16■■□□□ 1.3
CSRP1-201ENST00000340006 ARID3CA6NKF2 412 aa23.15■■□□□ 1.3
CSRP1-201ENST00000340006 UACAQ9BZF9 1416 aa23.13■■□□□ 1.29
CSRP1-201ENST00000340006 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CSRP1-201ENST00000340006 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CSRP1-201ENST00000340006 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.12■■□□□ 1.29
CSRP1-201ENST00000340006 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.11■■□□□ 1.29
CSRP1-201ENST00000340006 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CSRP1-201ENST00000340006 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.08■■□□□ 1.29
CSRP1-201ENST00000340006 ABCA8O94911 1581 aa23.08■■□□□ 1.28
CSRP1-201ENST00000340006 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
CSRP1-201ENST00000340006 HECW1Q76N89 1606 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRP1-201ENST00000340006 ABCC2Q92887 1545 aa23.02■■□□□ 1.28
CSRP1-201ENST00000340006 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CSRP1-201ENST00000340006 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CSRP1-201ENST00000340006 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23■■□□□ 1.27
CSRP1-201ENST00000340006 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CSRP1-201ENST00000340006 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.99■■□□□ 1.27
CSRP1-201ENST00000340006 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CSRP1-201ENST00000340006 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.98■■□□□ 1.27
CSRP1-201ENST00000340006 ATP10BO94823 1461 aa22.96■■□□□ 1.27
CSRP1-201ENST00000340006 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.96■■□□□ 1.27
CSRP1-201ENST00000340006 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CSRP1-201ENST00000340006 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.94■■□□□ 1.26
CSRP1-201ENST00000340006 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CSRP1-201ENST00000340006 TIAM1Q13009 1591 aa22.91■■□□□ 1.26
CSRP1-201ENST00000340006 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.9■■□□□ 1.26
CSRP1-201ENST00000340006 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CSRP1-201ENST00000340006 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.89■■□□□ 1.25
CSRP1-201ENST00000340006 MAP3K1Q13233 1512 aa22.88■■□□□ 1.25
CSRP1-201ENST00000340006 KCNH8Q96L42 1107 aa22.86■■□□□ 1.25
CSRP1-201ENST00000340006 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.86■■□□□ 1.25
CSRP1-201ENST00000340006 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.83■■□□□ 1.25
CSRP1-201ENST00000340006 ASXL2Q76L83 1435 aa22.78■■□□□ 1.24
CSRP1-201ENST00000340006 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.78■■□□□ 1.24
CSRP1-201ENST00000340006 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CSRP1-201ENST00000340006 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.74■■□□□ 1.23
CSRP1-201ENST00000340006 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.72■■□□□ 1.23
CSRP1-201ENST00000340006 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CSRP1-201ENST00000340006 MAPKBP1O60336 1514 aa22.69■■□□□ 1.22
CSRP1-201ENST00000340006 KIF14Q15058 1648 aa22.67■■□□□ 1.22
CSRP1-201ENST00000340006 NCOA2Q15596 1464 aa22.66■■□□□ 1.22
CSRP1-201ENST00000340006 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.63■■□□□ 1.21
CSRP1-201ENST00000340006 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.63■■□□□ 1.21
CSRP1-201ENST00000340006 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
CSRP1-201ENST00000340006 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.59■■□□□ 1.21
CSRP1-201ENST00000340006 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CSRP1-201ENST00000340006 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CSRP1-201ENST00000340006 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CSRP1-201ENST00000340006 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.56■■□□□ 1.2
CSRP1-201ENST00000340006 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.55■■□□□ 1.2
CSRP1-201ENST00000340006 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.53■■□□□ 1.2
CSRP1-201ENST00000340006 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CSRP1-201ENST00000340006 CD109Q6YHK3 1445 aa22.52■■□□□ 1.2
CSRP1-201ENST00000340006 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.52■■□□□ 1.2
CSRP1-201ENST00000340006 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.52■■□□□ 1.2
CSRP1-201ENST00000340006 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.51■■□□□ 1.19
CSRP1-201ENST00000340006 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CSRP1-201ENST00000340006 DIP2BQ9P265 1576 aa22.5■■□□□ 1.19
CSRP1-201ENST00000340006 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.49■■□□□ 1.19
CSRP1-201ENST00000340006 PLCH2O75038 1416 aa22.49■■□□□ 1.19
CSRP1-201ENST00000340006 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.49■■□□□ 1.19
CSRP1-201ENST00000340006 GLI2P10070 1586 aa22.48■■□□□ 1.19
CSRP1-201ENST00000340006 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.47■■□□□ 1.19
CSRP1-201ENST00000340006 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.47■■□□□ 1.19
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