RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337938.6

EDN3-202, Transcript of endothelin 3, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene EDN3, Length 2,636 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN3-202ENST00000337938 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
EDN3-202ENST00000337938 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.58■■□□□ 1.69
EDN3-202ENST00000337938 CUL7Q14999 1698 aa25.56■■□□□ 1.68
EDN3-202ENST00000337938 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
EDN3-202ENST00000337938 ERCC6Q03468 1493 aa25.5■■□□□ 1.67
EDN3-202ENST00000337938 ITGAEP38570 1179 aa25.45■■□□□ 1.66
EDN3-202ENST00000337938 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.44■■□□□ 1.66
EDN3-202ENST00000337938 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
EDN3-202ENST00000337938 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
EDN3-202ENST00000337938 PBRM1Q86U86 1689 aa25.39■■□□□ 1.65
EDN3-202ENST00000337938 TIAM1Q13009 1591 aa25.37■■□□□ 1.65
EDN3-202ENST00000337938 WDR62O43379 1518 aa25.36■■□□□ 1.65
EDN3-202ENST00000337938 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.35■■□□□ 1.65
EDN3-202ENST00000337938 IFT140Q96RY7 1462 aa25.3■■□□□ 1.64
EDN3-202ENST00000337938 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.3■■□□□ 1.64
EDN3-202ENST00000337938 GRIN2BQ13224 1484 aa25.29■■□□□ 1.64
EDN3-202ENST00000337938 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.29■■□□□ 1.64
EDN3-202ENST00000337938 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.28■■□□□ 1.64
EDN3-202ENST00000337938 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.27■■□□□ 1.64
EDN3-202ENST00000337938 ADAMTS12P58397 1594 aa25.27■■□□□ 1.64
EDN3-202ENST00000337938 ARID3CA6NKF2 412 aa25.27■■□□□ 1.64
EDN3-202ENST00000337938 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
EDN3-202ENST00000337938 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
EDN3-202ENST00000337938 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.23■■□□□ 1.63
EDN3-202ENST00000337938 FBLN2P98095 1184 aa25.23■■□□□ 1.63
EDN3-202ENST00000337938 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.22■■□□□ 1.63
EDN3-202ENST00000337938 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
EDN3-202ENST00000337938 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
EDN3-202ENST00000337938 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.2■■□□□ 1.63
EDN3-202ENST00000337938 SAMD9Q5K651 1589 aa25.2■■□□□ 1.62
EDN3-202ENST00000337938 FMN1Q68DA7 1419 aa25.19■■□□□ 1.62
EDN3-202ENST00000337938 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.18■■□□□ 1.62
EDN3-202ENST00000337938 MAP3K1Q13233 1512 aa25.17■■□□□ 1.62
EDN3-202ENST00000337938 IQGAP2Q13576 1575 aa25.14■■□□□ 1.61
EDN3-202ENST00000337938 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.13■■□□□ 1.61
EDN3-202ENST00000337938 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
EDN3-202ENST00000337938 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.09■■□□□ 1.61
EDN3-202ENST00000337938 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
EDN3-202ENST00000337938 GRIN2AQ12879 1464 aa25.05■■□□□ 1.6
EDN3-202ENST00000337938 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.98■■□□□ 1.59
EDN3-202ENST00000337938 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.97■■□□□ 1.59
EDN3-202ENST00000337938 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
EDN3-202ENST00000337938 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.96■■□□□ 1.59
EDN3-202ENST00000337938 DISP1Q96F81 1524 aa24.94■■□□□ 1.58
EDN3-202ENST00000337938 CEP170Q5SW79 1584 aa24.94■■□□□ 1.58
EDN3-202ENST00000337938 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
EDN3-202ENST00000337938 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.93■■□□□ 1.58
EDN3-202ENST00000337938 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
EDN3-202ENST00000337938 SYNJ2O15056 1496 aa24.92■■□□□ 1.58
EDN3-202ENST00000337938 NCOA2Q15596 1464 aa24.92■■□□□ 1.58
EDN3-202ENST00000337938 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.91■■□□□ 1.58
EDN3-202ENST00000337938 MYT1Q01538 1121 aa24.9■■□□□ 1.58
EDN3-202ENST00000337938 NEUROD1Q13562 356 aa24.9■■□□□ 1.58
EDN3-202ENST00000337938 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
EDN3-202ENST00000337938 KIAA0556O60303 1618 aa24.88■■□□□ 1.57
EDN3-202ENST00000337938 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.85■■□□□ 1.57
EDN3-202ENST00000337938 HECW1Q76N89 1606 aa24.84■■□□□ 1.57
EDN3-202ENST00000337938 JPH4Q96JJ6 628 aa24.83■■□□□ 1.57
EDN3-202ENST00000337938 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
EDN3-202ENST00000337938 PTPRKQ15262 1439 aa24.82■■□□□ 1.56
EDN3-202ENST00000337938 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.81■■□□□ 1.56
EDN3-202ENST00000337938 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.8■■□□□ 1.56
EDN3-202ENST00000337938 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
EDN3-202ENST00000337938 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
EDN3-202ENST00000337938 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.79■■□□□ 1.56
EDN3-202ENST00000337938 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.78■■□□□ 1.56
EDN3-202ENST00000337938 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.78■■□□□ 1.56
EDN3-202ENST00000337938 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
EDN3-202ENST00000337938 NUP160Q12769 1436 aa24.75■■□□□ 1.55
EDN3-202ENST00000337938 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.73■■□□□ 1.55
EDN3-202ENST00000337938 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.73■■□□□ 1.55
EDN3-202ENST00000337938 MAPKBP1O60336 1514 aa24.73■■□□□ 1.55
EDN3-202ENST00000337938 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
EDN3-202ENST00000337938 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.71■■□□□ 1.55
EDN3-202ENST00000337938 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.7■■□□□ 1.55
EDN3-202ENST00000337938 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.7■■□□□ 1.54
EDN3-202ENST00000337938 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.69■■□□□ 1.54
EDN3-202ENST00000337938 ARHGEF11O15085 1522 aa24.69■■□□□ 1.54
EDN3-202ENST00000337938 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
EDN3-202ENST00000337938 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
EDN3-202ENST00000337938 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
EDN3-202ENST00000337938 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.64■■□□□ 1.53
EDN3-202ENST00000337938 CHD1O14646 1710 aa24.6■■□□□ 1.53
EDN3-202ENST00000337938 NAIPQ13075 1403 aa24.58■■□□□ 1.52
EDN3-202ENST00000337938 HFM1A2PYH4 1435 aa24.56■■□□□ 1.52
EDN3-202ENST00000337938 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
EDN3-202ENST00000337938 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
EDN3-202ENST00000337938 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
EDN3-202ENST00000337938 KIF14Q15058 1648 aa24.51■■□□□ 1.51
EDN3-202ENST00000337938 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
EDN3-202ENST00000337938 KDM6BO15054 1643 aa24.48■■□□□ 1.51
EDN3-202ENST00000337938 TRIM52Q96A61 297 aa24.47■■□□□ 1.51
EDN3-202ENST00000337938 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.47■■□□□ 1.51
EDN3-202ENST00000337938 PTPRGP23470 1445 aa24.47■■□□□ 1.51
EDN3-202ENST00000337938 MIA2Q96PC5 1412 aa24.47■■□□□ 1.51
EDN3-202ENST00000337938 MIER1Q8N108 512 aa24.46■■□□□ 1.51
EDN3-202ENST00000337938 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
EDN3-202ENST00000337938 ATP10BO94823 1461 aa24.45■■□□□ 1.5
EDN3-202ENST00000337938 ABCA8O94911 1581 aa24.44■■□□□ 1.5
EDN3-202ENST00000337938 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms