RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 GRIN2AQ12879 1464 aa31.19■■■□□ 2.58
VSTM2B-201ENST00000335523 CHD1O14646 1710 aa31.17■■■□□ 2.58
VSTM2B-201ENST00000335523 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
VSTM2B-201ENST00000335523 CLIP1P30622 1438 aa31.11■■■□□ 2.57
VSTM2B-201ENST00000335523 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.01■■■□□ 2.55
VSTM2B-201ENST00000335523 NUP160Q12769 1436 aa31■■■□□ 2.55
VSTM2B-201ENST00000335523 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.99■■■□□ 2.55
VSTM2B-201ENST00000335523 CEP170Q5SW79 1584 aa30.92■■■□□ 2.54
VSTM2B-201ENST00000335523 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.92■■■□□ 2.54
VSTM2B-201ENST00000335523 IQGAP2Q13576 1575 aa30.92■■■□□ 2.54
VSTM2B-201ENST00000335523 ARHGEF11O15085 1522 aa30.88■■■□□ 2.53
VSTM2B-201ENST00000335523 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.87■■■□□ 2.53
VSTM2B-201ENST00000335523 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.86■■■□□ 2.53
VSTM2B-201ENST00000335523 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.86■■■□□ 2.53
VSTM2B-201ENST00000335523 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.86■■■□□ 2.53
VSTM2B-201ENST00000335523 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.84■■■□□ 2.53
VSTM2B-201ENST00000335523 JPH4Q96JJ6 628 aa30.84■■■□□ 2.53
VSTM2B-201ENST00000335523 P3H3Q8IVL6 736 aa30.82■■■□□ 2.52
VSTM2B-201ENST00000335523 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.81■■■□□ 2.52
VSTM2B-201ENST00000335523 ARAP1Q96P48 1450 aa30.78■■■□□ 2.52
VSTM2B-201ENST00000335523 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.75■■■□□ 2.51
VSTM2B-201ENST00000335523 SAMD9Q5K651 1589 aa30.72■■■□□ 2.51
VSTM2B-201ENST00000335523 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
VSTM2B-201ENST00000335523 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.7■■■□□ 2.5
VSTM2B-201ENST00000335523 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.7■■■□□ 2.5
VSTM2B-201ENST00000335523 DISP1Q96F81 1524 aa30.64■■■□□ 2.5
VSTM2B-201ENST00000335523 FMN1Q68DA7 1419 aa30.64■■■□□ 2.49
VSTM2B-201ENST00000335523 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
VSTM2B-201ENST00000335523 APLP2Q06481 763 aa30.59■■■□□ 2.49
VSTM2B-201ENST00000335523 KIAA0556O60303 1618 aa30.58■■■□□ 2.49
VSTM2B-201ENST00000335523 SHROOM2Q13796 1616 aa30.58■■■□□ 2.49
VSTM2B-201ENST00000335523 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.55■■■□□ 2.48
VSTM2B-201ENST00000335523 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.49■■■□□ 2.47
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
VSTM2B-201ENST00000335523 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
VSTM2B-201ENST00000335523 PTPRGP23470 1445 aa30.43■■■□□ 2.46
VSTM2B-201ENST00000335523 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.43■■■□□ 2.46
VSTM2B-201ENST00000335523 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
VSTM2B-201ENST00000335523 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.36■■■□□ 2.45
VSTM2B-201ENST00000335523 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP3K1Q13233 1512 aa30.32■■■□□ 2.44
VSTM2B-201ENST00000335523 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.26■■■□□ 2.43
VSTM2B-201ENST00000335523 HECW1Q76N89 1606 aa30.26■■■□□ 2.43
VSTM2B-201ENST00000335523 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.24■■■□□ 2.43
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.22■■■□□ 2.43
VSTM2B-201ENST00000335523 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
VSTM2B-201ENST00000335523 UACAQ9BZF9 1416 aa30.22■■■□□ 2.43
VSTM2B-201ENST00000335523 TIAM1Q13009 1591 aa30.21■■■□□ 2.43
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCA8O94911 1581 aa30.2■■■□□ 2.43
VSTM2B-201ENST00000335523 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
VSTM2B-201ENST00000335523 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
VSTM2B-201ENST00000335523 ARID3CA6NKF2 412 aa30.16■■■□□ 2.42
VSTM2B-201ENST00000335523 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
VSTM2B-201ENST00000335523 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
VSTM2B-201ENST00000335523 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.13■■■□□ 2.41
VSTM2B-201ENST00000335523 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.1■■■□□ 2.41
VSTM2B-201ENST00000335523 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.1■■■□□ 2.41
VSTM2B-201ENST00000335523 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
VSTM2B-201ENST00000335523 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.08■■■□□ 2.41
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCC2Q92887 1545 aa30.07■■■□□ 2.4
VSTM2B-201ENST00000335523 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP10BO94823 1461 aa30.05■■■□□ 2.4
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.04■■■□□ 2.4
VSTM2B-201ENST00000335523 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.01■■■□□ 2.4
VSTM2B-201ENST00000335523 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.96■■■□□ 2.39
VSTM2B-201ENST00000335523 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
VSTM2B-201ENST00000335523 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
VSTM2B-201ENST00000335523 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.92■■■□□ 2.38
VSTM2B-201ENST00000335523 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.92■■■□□ 2.38
VSTM2B-201ENST00000335523 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
VSTM2B-201ENST00000335523 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.91■■■□□ 2.38
VSTM2B-201ENST00000335523 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.88■■■□□ 2.37
VSTM2B-201ENST00000335523 MAPKBP1O60336 1514 aa29.85■■■□□ 2.37
VSTM2B-201ENST00000335523 NCOA2Q15596 1464 aa29.84■■■□□ 2.37
VSTM2B-201ENST00000335523 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.83■■■□□ 2.37
VSTM2B-201ENST00000335523 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
VSTM2B-201ENST00000335523 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
VSTM2B-201ENST00000335523 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
VSTM2B-201ENST00000335523 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.74■■■□□ 2.35
VSTM2B-201ENST00000335523 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.72■■■□□ 2.35
VSTM2B-201ENST00000335523 KCNH8Q96L42 1107 aa29.72■■■□□ 2.35
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.7■■■□□ 2.35
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF14Q15058 1648 aa29.68■■■□□ 2.34
VSTM2B-201ENST00000335523 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.66■■■□□ 2.34
VSTM2B-201ENST00000335523 ASXL2Q76L83 1435 aa29.66■■■□□ 2.34
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.66■■■□□ 2.34
VSTM2B-201ENST00000335523 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.66■■■□□ 2.34
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
VSTM2B-201ENST00000335523 MIA2Q96PC5 1412 aa29.64■■■□□ 2.33
VSTM2B-201ENST00000335523 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
VSTM2B-201ENST00000335523 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.61■■■□□ 2.33
VSTM2B-201ENST00000335523 DIP2BQ9P265 1576 aa29.61■■■□□ 2.33
VSTM2B-201ENST00000335523 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.56■■■□□ 2.32
VSTM2B-201ENST00000335523 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
VSTM2B-201ENST00000335523 GLI2P10070 1586 aa29.5■■■□□ 2.31
VSTM2B-201ENST00000335523 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
VSTM2B-201ENST00000335523 ITGAEP38570 1179 aa29.48■■■□□ 2.31
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
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