RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.1■■■□□ 2.57
KCNQ1-202ENST00000335475 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.07■■■□□ 2.56
KCNQ1-202ENST00000335475 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.04■■■□□ 2.56
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.02■■■□□ 2.56
KCNQ1-202ENST00000335475 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
KCNQ1-202ENST00000335475 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.98■■■□□ 2.55
KCNQ1-202ENST00000335475 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.98■■■□□ 2.55
KCNQ1-202ENST00000335475 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
KCNQ1-202ENST00000335475 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.95■■■□□ 2.55
KCNQ1-202ENST00000335475 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
KCNQ1-202ENST00000335475 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.54
KCNQ1-202ENST00000335475 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
KCNQ1-202ENST00000335475 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.92■■■□□ 2.54
KCNQ1-202ENST00000335475 SAMD9Q5K651 1589 aa30.89■■■□□ 2.54
KCNQ1-202ENST00000335475 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.89■■■□□ 2.54
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
KCNQ1-202ENST00000335475 P3H3Q8IVL6 736 aa30.86■■■□□ 2.53
KCNQ1-202ENST00000335475 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.85■■■□□ 2.53
KCNQ1-202ENST00000335475 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.82■■■□□ 2.52
KCNQ1-202ENST00000335475 PBRM1Q86U86 1689 aa30.82■■■□□ 2.52
KCNQ1-202ENST00000335475 FMN1Q68DA7 1419 aa30.78■■■□□ 2.52
KCNQ1-202ENST00000335475 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.77■■■□□ 2.52
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.73■■■□□ 2.51
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAMTS12P58397 1594 aa30.69■■■□□ 2.5
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.67■■■□□ 2.5
KCNQ1-202ENST00000335475 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
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KCNQ1-202ENST00000335475 ITGAEP38570 1179 aa30.64■■■□□ 2.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
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KCNQ1-202ENST00000335475 MAPKBP1O60336 1514 aa30.6■■■□□ 2.49
KCNQ1-202ENST00000335475 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.59■■■□□ 2.49
KCNQ1-202ENST00000335475 IQGAP2Q13576 1575 aa30.55■■■□□ 2.48
KCNQ1-202ENST00000335475 IFT140Q96RY7 1462 aa30.52■■■□□ 2.48
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KCNQ1-202ENST00000335475 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.51■■■□□ 2.47
KCNQ1-202ENST00000335475 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
KCNQ1-202ENST00000335475 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.48■■■□□ 2.47
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
KCNQ1-202ENST00000335475 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.46■■■□□ 2.47
KCNQ1-202ENST00000335475 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
KCNQ1-202ENST00000335475 NCOA2Q15596 1464 aa30.42■■■□□ 2.46
KCNQ1-202ENST00000335475 HECW1Q76N89 1606 aa30.42■■■□□ 2.46
KCNQ1-202ENST00000335475 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGEF11O15085 1522 aa30.41■■■□□ 2.46
KCNQ1-202ENST00000335475 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.41■■■□□ 2.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 NEUROD1Q13562 356 aa30.38■■■□□ 2.45
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KCNQ1-202ENST00000335475 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.37■■■□□ 2.45
KCNQ1-202ENST00000335475 MIER1Q8N108 512 aa30.32■■■□□ 2.44
KCNQ1-202ENST00000335475 PTPRKQ15262 1439 aa30.3■■■□□ 2.44
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KCNQ1-202ENST00000335475 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.28■■■□□ 2.44
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA0556O60303 1618 aa30.26■■■□□ 2.43
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.26■■■□□ 2.43
KCNQ1-202ENST00000335475 HFM1A2PYH4 1435 aa30.25■■■□□ 2.43
KCNQ1-202ENST00000335475 GRIN2AQ12879 1464 aa30.25■■■□□ 2.43
KCNQ1-202ENST00000335475 DISP1Q96F81 1524 aa30.22■■■□□ 2.43
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KCNQ1-202ENST00000335475 ERCC6Q03468 1493 aa30.21■■■□□ 2.43
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KCNQ1-202ENST00000335475 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
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KCNQ1-202ENST00000335475 UACAQ9BZF9 1416 aa30.11■■■□□ 2.41
KCNQ1-202ENST00000335475 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.1■■■□□ 2.41
KCNQ1-202ENST00000335475 CEP170Q5SW79 1584 aa30.09■■■□□ 2.41
KCNQ1-202ENST00000335475 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.08■■■□□ 2.41
KCNQ1-202ENST00000335475 MIA2Q96PC5 1412 aa30.06■■■□□ 2.4
KCNQ1-202ENST00000335475 SYNJ2O15056 1496 aa30.06■■■□□ 2.4
KCNQ1-202ENST00000335475 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
KCNQ1-202ENST00000335475 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.05■■■□□ 2.4
KCNQ1-202ENST00000335475 AKNAQ7Z591 1439 aa30.02■■■□□ 2.4
KCNQ1-202ENST00000335475 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
KCNQ1-202ENST00000335475 NUP160Q12769 1436 aa29.96■■■□□ 2.39
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KCNQ1-202ENST00000335475 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
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KCNQ1-202ENST00000335475 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
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KCNQ1-202ENST00000335475 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.83■■■□□ 2.37
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KCNQ1-202ENST00000335475 TONSLQ96HA7 1378 aa29.8■■■□□ 2.36
KCNQ1-202ENST00000335475 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.8■■■□□ 2.36
KCNQ1-202ENST00000335475 ROCK1Q13464 1354 aa29.77■■■□□ 2.36
KCNQ1-202ENST00000335475 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.77■■■□□ 2.36
KCNQ1-202ENST00000335475 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.77■■■□□ 2.36
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCC5O15440 1437 aa29.77■■■□□ 2.36
KCNQ1-202ENST00000335475 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
KCNQ1-202ENST00000335475 KIF14Q15058 1648 aa29.74■■■□□ 2.35
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